19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0896 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A0896  hypothetical protein  100 
 
 		 335 aa  681    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4658  hypothetical protein  35.63 
 
 		 339 aa  194  3e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.601408 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18730  hypothetical protein  33.84 
 
 		 371 aa  149  8e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.379343 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3878  hypothetical protein  31.58 
 
 		 353 aa  135  9.999999999999999e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0188025  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0661  hypothetical protein  31.91 
 
 		 352 aa  135  9.999999999999999e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.015179  normal  0.248709 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3790  hypothetical protein  31.58 
 
 		 353 aa  134  1.9999999999999998e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000713822  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0933  hypothetical protein  31.43 
 
 		 332 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3693  protein of unknown function DUF201  30.31 
 
 		 354 aa  127  3e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0184207  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0801  hypothetical protein  31.01 
 
 		 332 aa  125  1e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4985  hypothetical protein  29.84 
 
 		 395 aa  122  9e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.076001  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0081  hypothetical protein  28.78 
 
 		 372 aa  118  9.999999999999999e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1349  ATP-grasp domain protein  29.93 
 
 		 352 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.204009  normal  0.65425 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0759  hypothetical protein  28.7 
 
 		 391 aa  112  1.0000000000000001e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.227198 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0762  hypothetical protein  27.6 
 
 		 388 aa  102  7e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.960806  normal  0.0752452 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0481  protein of unknown function DUF201  28.84 
 
 		 375 aa  90.9  3e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0836  protein of unknown function DUF201  24.63 
 
 		 351 aa  73.2  0.000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.532579  normal  0.0458825 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22630  biotin carboxylase  27.88 
 
 		 333 aa  62.4  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.405302 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1270  protein of unknown function DUF201  34.53 
 
 		 322 aa  59.7  0.00000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.462862 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4794  protein of unknown function DUF201  26.54 
 
 		 337 aa  58.2  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>