27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_0759 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_0759  hypothetical protein  100 
 
 		 391 aa  817    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.227198 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0762  hypothetical protein  90.18 
 
 		 388 aa  748    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.960806  normal  0.0752452 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0081  hypothetical protein  65.85 
 
 		 372 aa  507  9.999999999999999e-143  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3693  protein of unknown function DUF201  32.98 
 
 		 354 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0184207  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1349  ATP-grasp domain protein  35.26 
 
 		 352 aa  196  5.000000000000001e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.204009  normal  0.65425 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0801  hypothetical protein  34.7 
 
 		 332 aa  192  8e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0933  hypothetical protein  35.15 
 
 		 332 aa  191  2e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3878  hypothetical protein  30.21 
 
 		 353 aa  174  1.9999999999999998e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0188025  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0661  hypothetical protein  30.21 
 
 		 352 aa  174  1.9999999999999998e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.015179  normal  0.248709 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3790  hypothetical protein  30.21 
 
 		 353 aa  174  2.9999999999999996e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000713822  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0896  hypothetical protein  28.7 
 
 		 335 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4658  hypothetical protein  27.51 
 
 		 339 aa  85.1  0.000000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.601408 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18730  hypothetical protein  23.84 
 
 		 371 aa  79.7  0.00000000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.379343 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0481  protein of unknown function DUF201  27.23 
 
 		 375 aa  60.5  0.00000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4794  protein of unknown function DUF201  26.75 
 
 		 337 aa  58.2  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4985  hypothetical protein  23.05 
 
 		 395 aa  53.9  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.076001  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1270  protein of unknown function DUF201  30.09 
 
 		 322 aa  52.4  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.462862 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2135  phosphoribosylglycinamide synthetase  24.51 
 
 		 412 aa  51.6  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.165665  normal  0.504192 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22630  biotin carboxylase  25.35 
 
 		 333 aa  50.1  0.00007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.405302 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0637  hypothetical protein  34.02 
 
 		 484 aa  49.3  0.0001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.110504  normal  0.0645726 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02890  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  23.61 
 
 		 1067 aa  47.4  0.0004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2536  protein of unknown function DUF201  21.24 
 
 		 359 aa  46.6  0.0008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.505707  normal  0.139385 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0684  protein of unknown function DUF201  22.07 
 
 		 356 aa  45.1  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.401732 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0724  protein of unknown function DUF201  21.78 
 
 		 356 aa  44.7  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.255037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0711  hypothetical protein  21.78 
 
 		 356 aa  44.7  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.283238 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2914  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  22.57 
 
 		 1070 aa  44.3  0.004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4702  protein of unknown function DUF201  31.25 
 
 		 346 aa  44.3  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0701331  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>