22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_0081 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_0081  hypothetical protein  100 
 
 		 372 aa  777    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0759  hypothetical protein  65.85 
 
 		 391 aa  507  9.999999999999999e-143  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.227198 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0762  hypothetical protein  65.31 
 
 		 388 aa  506  9.999999999999999e-143  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.960806  normal  0.0752452 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1349  ATP-grasp domain protein  35.77 
 
 		 352 aa  199  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.204009  normal  0.65425 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3693  protein of unknown function DUF201  36.14 
 
 		 354 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0184207  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3878  hypothetical protein  32.79 
 
 		 353 aa  188  1e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0188025  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3790  hypothetical protein  32.79 
 
 		 353 aa  188  1e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000713822  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0801  hypothetical protein  35.14 
 
 		 332 aa  183  3e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0661  hypothetical protein  32.51 
 
 		 352 aa  183  5.0000000000000004e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.015179  normal  0.248709 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0933  hypothetical protein  35.14 
 
 		 332 aa  182  6e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0896  hypothetical protein  28.78 
 
 		 335 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4658  hypothetical protein  27.72 
 
 		 339 aa  93.6  5e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.601408 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18730  hypothetical protein  24.24 
 
 		 371 aa  85.5  0.000000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.379343 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0481  protein of unknown function DUF201  24.47 
 
 		 375 aa  68.2  0.0000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1270  protein of unknown function DUF201  33.63 
 
 		 322 aa  60.5  0.00000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.462862 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2536  protein of unknown function DUF201  22.27 
 
 		 359 aa  60.1  0.00000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.505707  normal  0.139385 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0836  protein of unknown function DUF201  25.5 
 
 		 351 aa  58.5  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.532579  normal  0.0458825 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4794  protein of unknown function DUF201  25.21 
 
 		 337 aa  54.7  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4985  hypothetical protein  25.37 
 
 		 395 aa  51.6  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.076001  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22630  biotin carboxylase  30.7 
 
 		 333 aa  52  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.405302 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2135  phosphoribosylglycinamide synthetase  24.66 
 
 		 412 aa  44.7  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.165665  normal  0.504192 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0637  hypothetical protein  30.93 
 
 		 484 aa  43.1  0.008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.110504  normal  0.0645726 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>