25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_1349 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011353  ECH74115_1349  ATP-grasp domain protein  100 
 
 
352 aa  735    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.204009  normal  0.65425 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3693  protein of unknown function DUF201  60.23 
 
 
354 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0184207  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3878  hypothetical protein  55.14 
 
 
353 aa  400  9.999999999999999e-111  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0188025  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3790  hypothetical protein  54.86 
 
 
353 aa  398  9.999999999999999e-111  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000713822  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0661  hypothetical protein  54.57 
 
 
352 aa  390  1e-107  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.015179  normal  0.248709 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0801  hypothetical protein  40.19 
 
 
332 aa  231  2e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0933  hypothetical protein  40.51 
 
 
332 aa  228  9e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0762  hypothetical protein  35.73 
 
 
388 aa  219  6e-56  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.960806  normal  0.0752452 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0081  hypothetical protein  35.77 
 
 
372 aa  214  1.9999999999999998e-54  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0759  hypothetical protein  35.26 
 
 
391 aa  210  2e-53  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.227198 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0896  hypothetical protein  29.93 
 
 
335 aa  124  3e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18730  hypothetical protein  29.05 
 
 
371 aa  97.1  4e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.379343 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4658  hypothetical protein  26.85 
 
 
339 aa  92.4  9e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.601408 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0481  protein of unknown function DUF201  29.86 
 
 
375 aa  86.7  6e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4985  hypothetical protein  27.78 
 
 
395 aa  79  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.076001  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22630  biotin carboxylase  36.84 
 
 
333 aa  62  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.405302 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4794  protein of unknown function DUF201  35.78 
 
 
337 aa  61.2  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0836  protein of unknown function DUF201  26.07 
 
 
351 aa  59.3  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.532579  normal  0.0458825 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1270  protein of unknown function DUF201  37.29 
 
 
322 aa  58.5  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.462862 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2536  protein of unknown function DUF201  25.62 
 
 
359 aa  52.4  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.505707  normal  0.139385 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0684  protein of unknown function DUF201  25 
 
 
356 aa  50.4  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.401732 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0724  protein of unknown function DUF201  25.36 
 
 
356 aa  47  0.0005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.255037  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0711  hypothetical protein  25.36 
 
 
356 aa  47  0.0005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.283238 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3212  protein of unknown function DUF201  24.35 
 
 
322 aa  44.3  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3857  protein of unknown function DUF201  24.56 
 
 
430 aa  43.9  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.214933 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>