125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_2536 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_2536  protein of unknown function DUF201  100 
 
 		 359 aa  735    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.505707  normal  0.139385 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0684  protein of unknown function DUF201  27.3 
 
 		 356 aa  114  3e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.401732 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0146  hypothetical protein  26.65 
 
 		 382 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0724  protein of unknown function DUF201  26.97 
 
 		 356 aa  107  3e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.255037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0711  hypothetical protein  26.64 
 
 		 356 aa  105  1e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.283238 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2070  protein of unknown function DUF201  27.54 
 
 		 355 aa  100  4e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2484  carbamoyl phosphate synthase-like protein  29.57 
 
 		 354 aa  73.9  0.000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.834927  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2881  ATP-grasp protein-like protein  22.55 
 
 		 399 aa  69.7  0.00000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000202032  hitchhiker  0.00373255 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1598  ATP-grasp enzyme-like protein  21.89 
 
 		 383 aa  68.9  0.0000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.116073  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0579  ATP-grasp enzyme-like protein  21.83 
 
 		 339 aa  68.6  0.0000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0958  ATP-grasp enzyme-like  26.53 
 
 		 385 aa  67.4  0.0000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3856  hypothetical protein  21.77 
 
 		 458 aa  65.1  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.930196 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0384  ATP-grasp enzyme-like  21.92 
 
 		 346 aa  60.8  0.00000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0958371 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0081  hypothetical protein  22.27 
 
 		 372 aa  59.7  0.00000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4379  protein of unknown function DUF201  22.34 
 
 		 323 aa  58.9  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0127  hypothetical protein  23.89 
 
 		 404 aa  58.5  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2335  hypothetical protein  24.56 
 
 		 404 aa  58.2  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2376  hypothetical protein  23.79 
 
 		 404 aa  57.8  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1270  protein of unknown function DUF201  26.97 
 
 		 322 aa  57  0.0000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.462862 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1574  protein tyrosine phosphatase  22.8 
 
 		 695 aa  57  0.0000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.354937  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4794  protein of unknown function DUF201  26.4 
 
 		 337 aa  57  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2122  ATP-grasp protein-like protein  24.9 
 
 		 428 aa  56.6  0.0000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.598506  normal  0.35732 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0637  hypothetical protein  28.06 
 
 		 484 aa  56.6  0.0000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.110504  normal  0.0645726 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0677  pyruvate carboxylase  24.73 
 
 		 1154 aa  56.2  0.0000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00418471 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2485  pyruvate carboxylase  25.61 
 
 		 1145 aa  56.2  0.0000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0753  carbamoyl phosphate synthase-like protein  26.13 
 
 		 326 aa  55.8  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.564232 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0164  ATP-grasp enzyme-like  24.62 
 
 		 416 aa  55.8  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3002  hypothetical protein  22.04 
 
 		 387 aa  54.7  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1936  ATP-grasp protein-like protein  25 
 
 		 414 aa  55.1  0.000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0421  hypothetical protein  23.86 
 
 		 321 aa  55.1  0.000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3248  hypothetical protein  22.04 
 
 		 387 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3017  hypothetical protein  22.04 
 
 		 360 aa  54.7  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0773038  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2939  hypothetical protein  22.04 
 
 		 387 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1133  protein of unknown function DUF201  22.96 
 
 		 342 aa  54.7  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1569  hypothetical protein  24.83 
 
 		 412 aa  54.3  0.000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0588  carbamoyl phosphate synthase-like protein  23.87 
 
 		 320 aa  54.3  0.000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4983  hypothetical protein  20.71 
 
 		 452 aa  54.3  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.301738 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3289  protein of unknown function DUF201  28.29 
 
 		 361 aa  54.7  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0509227  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22630  biotin carboxylase  32.87 
 
 		 333 aa  53.5  0.000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.405302 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1782  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  22.34 
 
 		 1054 aa  53.9  0.000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0836  protein of unknown function DUF201  22.71 
 
 		 351 aa  53.1  0.000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.532579  normal  0.0458825 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0189  hypothetical protein  24.88 
 
 		 391 aa  52.8  0.000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2090  pyruvate carboxylase  23.89 
 
 		 1154 aa  51.6  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2781  pyruvate carboxylase  24.9 
 
 		 1146 aa  51.6  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.34557 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2028  pyruvate carboxylase  24.9 
 
 		 1146 aa  51.6  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0765  pyruvate carboxylase  23.89 
 
 		 1154 aa  51.2  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.531635  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1349  ATP-grasp domain protein  26.4 
 
 		 352 aa  52  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.204009  normal  0.65425 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1972  hypothetical protein  25.31 
 
 		 349 aa  50.8  0.00003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2168  ATP-grasp enzyme-like protein  25.82 
 
 		 411 aa  50.8  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.862248  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0662  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  26.48 
 
 		 1072 aa  51.2  0.00003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3434  ATP-grasp protein-like protein  24.1 
 
 		 439 aa  51.2  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16420  predicted ATP-grasp enzyme  26.15 
 
 		 415 aa  51.2  0.00003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4257  hypothetical protein  25.69 
 
 		 429 aa  51.2  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.845129  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_90563  multifunctional pyrimidine biosynthesis protein (PYR1)  21.08 
 
 		 2211 aa  50.4  0.00005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0682407 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0668  ATP-grasp protein-like protein  23.68 
 
 		 393 aa  50.1  0.00005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1730  ATP-grasp protein-like protein  25.91 
 
 		 418 aa  49.3  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.171571  normal  0.118252 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2532  hypothetical protein  21.18 
 
 		 408 aa  49.3  0.0001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2958  hypothetical protein  20.76 
 
 		 387 aa  48.9  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0760444  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04920  predicted ATP-grasp enzyme  25.97 
 
 		 753 aa  48.9  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2734  hypothetical protein  31.4 
 
 		 340 aa  48.1  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2607  hypothetical protein  31.4 
 
 		 340 aa  48.1  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4144  pyruvate carboxylase  23.98 
 
 		 1144 aa  48.5  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.407783 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4702  protein of unknown function DUF201  32.26 
 
 		 346 aa  48.1  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0701331  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1887  ATP-grasp protein-like protein  23.15 
 
 		 426 aa  48.5  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.615046  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0762  hypothetical protein  21.24 
 
 		 388 aa  48.1  0.0003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.960806  normal  0.0752452 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1349  ATP-grasp protein-like protein  31.03 
 
 		 525 aa  47.8  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.971756  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1178  cyanophycin synthetase  29.7 
 
 		 900 aa  47.4  0.0004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0373  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  23.16 
 
 		 1075 aa  47.4  0.0004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1886  carbamoyl phosphate synthase large subunit  25.27 
 
 		 950 aa  47.4  0.0004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.964164  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0081  hypothetical protein  23.71 
 
 		 418 aa  47  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2319  carbamoyl phosphate synthase large subunit  23.81 
 
 		 1056 aa  47  0.0005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1584  putative carbamoyl-phosphate-synthetase protein  27.15 
 
 		 393 aa  47  0.0005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2251  phosphoribosylglycinamide synthetase  27.86 
 
 		 418 aa  46.6  0.0006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000511987 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2317  pyruvate carboxylase  22.43 
 
 		 1146 aa  46.6  0.0007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0136  ATP-grasp protein  24.18 
 
 		 443 aa  46.6  0.0007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000567708  normal  0.0743555 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2016  ATP-grasp protein-like protein  25.1 
 
 		 427 aa  46.6  0.0007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.943806 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4563  carbamoyl phosphate synthase-like protein  27.46 
 
 		 330 aa  46.6  0.0007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.146127  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2200  ATP-grasp protein-like protein  24.31 
 
 		 390 aa  46.6  0.0007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0759  hypothetical protein  21.24 
 
 		 391 aa  46.2  0.0008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.227198 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12240  predicted ATP-grasp enzyme  26.64 
 
 		 424 aa  46.6  0.0008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.589336  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0530  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  22.17 
 
 		 1075 aa  45.8  0.001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1971  argininosuccinate lyase  27.46 
 
 		 891 aa  45.8  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0139  hypothetical protein  24.02 
 
 		 410 aa  45.8  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0402  pyruvate carboxylase  23.84 
 
 		 1147 aa  45.4  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1663  putative ATP-grasp protein  36.07 
 
 		 391 aa  45.8  0.001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0312334  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1520  carbamoyl phosphate synthase-like protein  22.73 
 
 		 327 aa  45.4  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0333  carbamoyl-phosphate synthase large subunit  23.2 
 
 		 1087 aa  45.4  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.639877  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1176  hypothetical protein  19.45 
 
 		 418 aa  45.1  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.356654  hitchhiker  0.00556122 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12823  carbamoyl-phosphate synthase, large (or ammonia) subunit (carB)  24.47 
 
 		 950 aa  44.7  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.188852  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3552  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain-containing protein  27.71 
 
 		 373 aa  45.1  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.138111  normal  0.272734 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3192  argininosuccinate lyase  25.91 
 
 		 924 aa  44.7  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.655648  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07361  phosphoribosylaminoimidazole carboxylase ATPase subunit  24.24 
 
 		 396 aa  45.1  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.291651  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0360  D-alanine/D-alanine ligase  26.6 
 
 		 330 aa  45.1  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1401  protein of unknown function DUF201  24.22 
 
 		 409 aa  45.1  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0960  cyanophycin synthetase  26.18 
 
 		 877 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0987  cyanophycin synthetase  26.18 
 
 		 877 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0216297 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2222  hypothetical protein  26.01 
 
 		 354 aa  44.3  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1929  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  26.52 
 
 		 411 aa  44.3  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2122  argininosuccinate lyase  25.91 
 
 		 894 aa  44.7  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0099  carbamoyl phosphate synthase large subunit  25.7 
 
 		 951 aa  44.3  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.217171  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>