48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0136 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_0136  ATP-grasp protein  100 
 
 		 443 aa  914    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000567708  normal  0.0743555 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1936  ATP-grasp protein-like protein  53.03 
 
 		 414 aa  443  1e-123  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2532  hypothetical protein  53.56 
 
 		 408 aa  441  9.999999999999999e-123  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0466  hypothetical protein  48.31 
 
 		 413 aa  411  1e-113  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1887  ATP-grasp protein-like protein  30.68 
 
 		 426 aa  234  3e-60  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.615046  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1730  ATP-grasp protein-like protein  29.85 
 
 		 418 aa  222  9.999999999999999e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.171571  normal  0.118252 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16420  predicted ATP-grasp enzyme  30.27 
 
 		 415 aa  218  1e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1888  protein of unknown function DUF201  30.15 
 
 		 441 aa  206  8e-52  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.205911  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1390  putative ATP-grasp protein  28.95 
 
 		 413 aa  192  1e-47  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00627885  normal  0.224685 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12240  predicted ATP-grasp enzyme  33.23 
 
 		 424 aa  184  3e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.589336  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2122  ATP-grasp protein-like protein  30.42 
 
 		 428 aa  184  4.0000000000000006e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.598506  normal  0.35732 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06110  predicted ATP-grasp enzyme  29.18 
 
 		 421 aa  176  8e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1663  putative ATP-grasp protein  32.44 
 
 		 391 aa  168  1e-40  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0312334  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12250  predicted ATP-grasp enzyme  27.03 
 
 		 419 aa  166  5e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.206907  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1966  ATP-grasp protein  25 
 
 		 443 aa  151  2e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.151473  hitchhiker  0.0000495401 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04920  predicted ATP-grasp enzyme  25.5 
 
 		 753 aa  134  3e-30  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2881  ATP-grasp protein-like protein  25.94 
 
 		 399 aa  87.4  5e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000202032  hitchhiker  0.00373255 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0164  ATP-grasp enzyme-like  25.91 
 
 		 416 aa  82  0.00000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6401  hypothetical protein  24.35 
 
 		 418 aa  79  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.468222 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0958  ATP-grasp enzyme-like  27.87 
 
 		 385 aa  78.2  0.0000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2168  ATP-grasp enzyme-like protein  25.33 
 
 		 411 aa  64.7  0.000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.862248  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1569  hypothetical protein  22.98 
 
 		 412 aa  62.4  0.00000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1119  ATP-grasp enzyme-like protein  21.98 
 
 		 405 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1460  ATP-grasp enzyme-like protein  22.44 
 
 		 387 aa  58.2  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6484  ATP-grasp enzyme-like protein  20.74 
 
 		 405 aa  54.3  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.810845  normal  0.469063 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2618  carbamoylphosphate synthase large subunit (split gene in MJ)-like  26.61 
 
 		 387 aa  53.9  0.000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0630  hypothetical protein  24.9 
 
 		 408 aa  53.5  0.000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2340  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  20.95 
 
 		 1110 aa  52.8  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2581  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  21.88 
 
 		 1109 aa  52  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.195323  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1999  carbamoyl phosphate synthase large subunit  24.64 
 
 		 1109 aa  49.3  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000570089 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0189  hypothetical protein  22.75 
 
 		 391 aa  49.3  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3102  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  22.55 
 
 		 1100 aa  48.9  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1355  carbamoyl-phosphate synthase large subunit  22.61 
 
 		 1092 aa  48.5  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0316249 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1096  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  22.81 
 
 		 1080 aa  47.8  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.528087  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12580  carbamoyl phosphate synthase large subunit  25.31 
 
 		 1101 aa  47  0.0007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0991038  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1087  carbamoyl phosphate synthase large subunit  24.77 
 
 		 1062 aa  46.2  0.001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12690  carbamoyl-phosphate synthase large subunit  24.76 
 
 		 1118 aa  46.2  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0359466  normal  0.0639836 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2536  protein of unknown function DUF201  24.18 
 
 		 359 aa  46.6  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.505707  normal  0.139385 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0373  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  24.31 
 
 		 1075 aa  45.4  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1670  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  22.39 
 
 		 1078 aa  45.4  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00809225 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0380  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  24.54 
 
 		 1099 aa  44.7  0.003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2808  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  22.11 
 
 		 1097 aa  44.3  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1298  carbamoyl-phosphate synthase large subunit  22.48 
 
 		 1093 aa  44.3  0.005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0243124 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2262  carbamoyl phosphate synthase large subunit  24.64 
 
 		 1099 aa  43.9  0.006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.133094  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4605  carbamoyl phosphate synthase large subunit  24.88 
 
 		 1109 aa  43.5  0.007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.709642  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3012  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  22.36 
 
 		 1107 aa  43.1  0.009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.541011  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22630  biotin carboxylase  22.92 
 
 		 333 aa  43.1  0.01  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.405302 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2405  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  21.45 
 
 		 1099 aa  43.1  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>