81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_2168 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_2168  ATP-grasp enzyme-like protein  100 
 
 		 411 aa  850    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.862248  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0630  hypothetical protein  52.71 
 
 		 408 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2881  ATP-grasp protein-like protein  29.41 
 
 		 399 aa  187  2e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000202032  hitchhiker  0.00373255 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6859  ATP-grasp enzyme-like protein  32.72 
 
 		 400 aa  152  1e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0164  ATP-grasp enzyme-like  26.87 
 
 		 416 aa  136  8e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6484  ATP-grasp enzyme-like protein  27.54 
 
 		 405 aa  126  7e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.810845  normal  0.469063 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1119  ATP-grasp enzyme-like protein  27.54 
 
 		 405 aa  123  5e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0189  hypothetical protein  32.5 
 
 		 391 aa  118  1.9999999999999998e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0139  hypothetical protein  29.77 
 
 		 410 aa  112  8.000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1460  ATP-grasp enzyme-like protein  27.5 
 
 		 387 aa  108  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0958  ATP-grasp enzyme-like  26.63 
 
 		 385 aa  107  4e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1598  ATP-grasp enzyme-like protein  24.5 
 
 		 383 aa  100  6e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.116073  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1569  hypothetical protein  24.63 
 
 		 412 aa  84.7  0.000000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1176  hypothetical protein  24.23 
 
 		 418 aa  83.6  0.000000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.356654  hitchhiker  0.00556122 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2335  hypothetical protein  27.59 
 
 		 404 aa  83.6  0.000000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1936  ATP-grasp protein-like protein  25.63 
 
 		 414 aa  83.6  0.000000000000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0127  hypothetical protein  23.62 
 
 		 404 aa  80.1  0.00000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12240  predicted ATP-grasp enzyme  25.58 
 
 		 424 aa  80.1  0.00000000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.589336  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6401  hypothetical protein  24.23 
 
 		 418 aa  72.4  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.468222 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0466  hypothetical protein  24.45 
 
 		 413 aa  72.8  0.00000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06110  predicted ATP-grasp enzyme  26.2 
 
 		 421 aa  71.6  0.00000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1663  putative ATP-grasp protein  24.78 
 
 		 391 aa  70.5  0.00000000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0312334  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2376  hypothetical protein  26.09 
 
 		 404 aa  70.1  0.00000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1421  RimK domain-containing protein ATP-grasp  27 
 
 		 316 aa  67.8  0.0000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.624987  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2532  hypothetical protein  24.78 
 
 		 408 aa  67  0.0000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0534  hypothetical protein  26.64 
 
 		 380 aa  66.6  0.0000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0579  ATP-grasp enzyme-like protein  24.21 
 
 		 339 aa  65.9  0.000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0136  ATP-grasp protein  25.33 
 
 		 443 aa  64.7  0.000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000567708  normal  0.0743555 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1433  RimK domain-containing protein ATP-grasp  27 
 
 		 316 aa  64.3  0.000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.133242 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1972  hypothetical protein  24.43 
 
 		 349 aa  63.5  0.000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1574  protein tyrosine phosphatase  24.24 
 
 		 695 aa  62.8  0.00000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.354937  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2016  ATP-grasp protein-like protein  23.59 
 
 		 427 aa  62.4  0.00000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.943806 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2122  ATP-grasp protein-like protein  24.34 
 
 		 428 aa  60.8  0.00000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.598506  normal  0.35732 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1730  ATP-grasp protein-like protein  23.89 
 
 		 418 aa  60.8  0.00000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.171571  normal  0.118252 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1888  protein of unknown function DUF201  24.63 
 
 		 441 aa  60.8  0.00000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.205911  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16420  predicted ATP-grasp enzyme  25.26 
 
 		 415 aa  60.1  0.00000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0475  RimK domain-containing protein ATP-grasp  27 
 
 		 316 aa  60.1  0.00000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.60167  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0665  protein of unknown function DUF201  25 
 
 		 386 aa  59.7  0.00000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04920  predicted ATP-grasp enzyme  23.08 
 
 		 753 aa  59.3  0.0000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1201  RimK domain-containing protein ATP-grasp  25.5 
 
 		 255 aa  56.6  0.0000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1884  ATP-grasp protein-like protein  21.53 
 
 		 434 aa  56.2  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.336917 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2618  carbamoylphosphate synthase large subunit (split gene in MJ)-like  20.25 
 
 		 387 aa  55.8  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4510  D-alanine--D-alanine ligase  22.63 
 
 		 318 aa  54.3  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.926971  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1339  D-alanine--D-alanine ligase  21.58 
 
 		 318 aa  53.5  0.000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.266833  normal  0.0340242 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4385  D-alanine--D-alanine ligase  22.11 
 
 		 318 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0215233  normal  0.165436 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1695  RimK domain-containing protein ATP-grasp  26.73 
 
 		 335 aa  52.4  0.00001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.803385  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0946  D-alanine--D-alanine ligase  22.63 
 
 		 318 aa  52  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.427679  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1887  ATP-grasp protein-like protein  25.12 
 
 		 426 aa  51.2  0.00003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.615046  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0373  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  24.05 
 
 		 1075 aa  51.6  0.00003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3434  ATP-grasp protein-like protein  22.83 
 
 		 439 aa  50.8  0.00004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2536  protein of unknown function DUF201  25.82 
 
 		 359 aa  50.8  0.00004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.505707  normal  0.139385 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4982  D-alanine--D-alanine ligase  21.99 
 
 		 319 aa  51.2  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.380222  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1549  hypothetical protein  26.12 
 
 		 413 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2484  carbamoyl phosphate synthase-like protein  24.07 
 
 		 354 aa  49.7  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.834927  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57320  D-alanine--D-alanine ligase  22.63 
 
 		 319 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1966  ATP-grasp protein  26.28 
 
 		 443 aa  49.7  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.151473  hitchhiker  0.0000495401 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2088  D-alanine--D-alanine ligase  26.46 
 
 		 304 aa  49.3  0.0001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1349  ATP-grasp protein-like protein  26.77 
 
 		 525 aa  48.9  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.971756  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_30519  precursor of carboxylase pyruvate carboxylase  33.7 
 
 		 1252 aa  47.8  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0668  ATP-grasp protein-like protein  24.63 
 
 		 393 aa  48.1  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12250  predicted ATP-grasp enzyme  21.57 
 
 		 419 aa  47.8  0.0003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.206907  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3050  hypothetical protein  26.35 
 
 		 457 aa  47.8  0.0004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2876  hypothetical protein  24.88 
 
 		 734 aa  46.6  0.0008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3089  urea carboxylase  25.65 
 
 		 1204 aa  46.2  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.176139  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0924  D-alanine--D-alanine ligase  27.66 
 
 		 313 aa  45.4  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.783773  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0698  protein of unknown function DUF201  21.87 
 
 		 467 aa  44.7  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0772  D-alanine--D-alanine ligase  25.53 
 
 		 309 aa  45.1  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.170719  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0421  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  22.74 
 
 		 448 aa  44.3  0.004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1308  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  22.37 
 
 		 1082 aa  44.3  0.004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0934  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  23.37 
 
 		 458 aa  44.3  0.004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1782  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  18.57 
 
 		 1054 aa  44.3  0.004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2426  D-alanine--D-alanine ligase  23.4 
 
 		 309 aa  44.3  0.004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.142396  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4671  D-alanine--D-alanine ligase  26.6 
 
 		 324 aa  43.9  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0129578  normal  0.448814 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2304  urea carboxylase  24.65 
 
 		 1209 aa  43.9  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.198231  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0776  RimK domain-containing protein ATP-grasp  31 
 
 		 486 aa  43.9  0.006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.121233  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1626  RimK domain-containing protein ATP-grasp  26.03 
 
 		 290 aa  43.5  0.006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0205048 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1774  hypothetical protein  22.81 
 
 		 312 aa  43.5  0.007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2995  pyruvate carboxylase  25 
 
 		 1149 aa  43.1  0.008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0452  D-alanine/D-alanine ligase  24.06 
 
 		 324 aa  42.7  0.01  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0742321  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3792  urea amidolyase related protein  23.48 
 
 		 1228 aa  42.7  0.01  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0007  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  22.52 
 
 		 465 aa  43.1  0.01  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>