53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_2122 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_2122  ATP-grasp protein-like protein  100 
 
 		 428 aa  882    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.598506  normal  0.35732 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1888  protein of unknown function DUF201  36.7 
 
 		 441 aa  251  2e-65  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.205911  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16420  predicted ATP-grasp enzyme  35.99 
 
 		 415 aa  249  9e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1887  ATP-grasp protein-like protein  39.27 
 
 		 426 aa  238  2e-61  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.615046  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1730  ATP-grasp protein-like protein  36.1 
 
 		 418 aa  236  5.0000000000000005e-61  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.171571  normal  0.118252 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12240  predicted ATP-grasp enzyme  31.84 
 
 		 424 aa  227  2e-58  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.589336  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1390  putative ATP-grasp protein  32.36 
 
 		 413 aa  215  9.999999999999999e-55  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00627885  normal  0.224685 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06110  predicted ATP-grasp enzyme  31.02 
 
 		 421 aa  199  6e-50  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2532  hypothetical protein  30.34 
 
 		 408 aa  195  1e-48  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0466  hypothetical protein  29.1 
 
 		 413 aa  191  2e-47  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0136  ATP-grasp protein  30.42 
 
 		 443 aa  184  3e-45  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000567708  normal  0.0743555 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04920  predicted ATP-grasp enzyme  29.38 
 
 		 753 aa  179  5.999999999999999e-44  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12250  predicted ATP-grasp enzyme  29.56 
 
 		 419 aa  176  6e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.206907  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1966  ATP-grasp protein  30.47 
 
 		 443 aa  168  2e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.151473  hitchhiker  0.0000495401 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1936  ATP-grasp protein-like protein  25.67 
 
 		 414 aa  163  6e-39  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1663  putative ATP-grasp protein  23.33 
 
 		 391 aa  110  7.000000000000001e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0312334  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2881  ATP-grasp protein-like protein  27 
 
 		 399 aa  87  5e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000202032  hitchhiker  0.00373255 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0958  ATP-grasp enzyme-like  25 
 
 		 385 aa  76.3  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1972  hypothetical protein  25.95 
 
 		 349 aa  67.4  0.0000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0164  ATP-grasp enzyme-like  21.82 
 
 		 416 aa  64.3  0.000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1884  ATP-grasp protein-like protein  23.85 
 
 		 434 aa  61.2  0.00000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.336917 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2168  ATP-grasp enzyme-like protein  24.34 
 
 		 411 aa  60.8  0.00000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.862248  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0924  D-alanine--D-alanine ligase  25.85 
 
 		 313 aa  60.8  0.00000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.783773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0139  hypothetical protein  23.68 
 
 		 410 aa  60.5  0.00000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2376  hypothetical protein  25.11 
 
 		 404 aa  59.3  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4510  D-alanine--D-alanine ligase  24.04 
 
 		 318 aa  59.7  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.926971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4385  D-alanine--D-alanine ligase  24.04 
 
 		 318 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0215233  normal  0.165436 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0189  hypothetical protein  24.39 
 
 		 391 aa  56.6  0.0000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0946  D-alanine--D-alanine ligase  23.51 
 
 		 318 aa  56.6  0.0000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.427679  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2536  protein of unknown function DUF201  24.9 
 
 		 359 aa  56.6  0.0000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.505707  normal  0.139385 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1339  D-alanine--D-alanine ligase  23.69 
 
 		 318 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.266833  normal  0.0340242 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4671  D-alanine--D-alanine ligase  23.49 
 
 		 324 aa  53.1  0.000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0129578  normal  0.448814 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6859  ATP-grasp enzyme-like protein  25.41 
 
 		 400 aa  52  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1598  carbamoyl phosphate synthase large subunit  22.39 
 
 		 1042 aa  52  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2070  protein of unknown function DUF201  26.29 
 
 		 355 aa  50.8  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0146  hypothetical protein  24.39 
 
 		 382 aa  49.7  0.00009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0741  carbamoyl phosphate synthase large subunit  22.83 
 
 		 1040 aa  49.3  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2618  carbamoylphosphate synthase large subunit (split gene in MJ)-like  23.47 
 
 		 387 aa  48.5  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0833  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  23.94 
 
 		 1086 aa  47.4  0.0005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00324716  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1569  hypothetical protein  21.78 
 
 		 412 aa  47  0.0006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0630  hypothetical protein  21.43 
 
 		 408 aa  47  0.0007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1967  D-alanine--D-alanine ligase  23.83 
 
 		 320 aa  46.6  0.0009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000254256  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2046  D-alanine--D-alanine ligase  23.83 
 
 		 320 aa  46.2  0.001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000802497  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0085  carbamoyl phosphate synthase large subunit  20.95 
 
 		 1056 aa  45.8  0.001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00260745  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0358  methyltransferase type 11  26.8 
 
 		 637 aa  46.6  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000290663  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2272  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  23.92 
 
 		 1030 aa  45.4  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1087  carbamoyl phosphate synthase large subunit  19.83 
 
 		 1062 aa  45.4  0.002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1472  D-alanine--D-alanine ligase  26.14 
 
 		 326 aa  45.1  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.269509  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0684  protein of unknown function DUF201  24.49 
 
 		 356 aa  45.1  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.401732 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4982  D-alanine--D-alanine ligase  22.91 
 
 		 319 aa  44.3  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.380222  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2476  carbamoyl phosphate synthase large subunit  23.23 
 
 		 947 aa  43.9  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0099  carbamoyl phosphate synthase large subunit  26.01 
 
 		 951 aa  43.9  0.006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.217171  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0360  D-alanine--D-alanine ligase  22.7 
 
 		 308 aa  43.1  0.01  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>