38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1390 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_1390  putative ATP-grasp protein  100 
 
 		 413 aa  852    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00627885  normal  0.224685 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16420  predicted ATP-grasp enzyme  57.49 
 
 		 415 aa  492  9.999999999999999e-139  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1888  protein of unknown function DUF201  44.85 
 
 		 441 aa  320  3e-86  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.205911  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1730  ATP-grasp protein-like protein  40.82 
 
 		 418 aa  312  4.999999999999999e-84  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.171571  normal  0.118252 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1887  ATP-grasp protein-like protein  39.38 
 
 		 426 aa  298  8e-80  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.615046  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12240  predicted ATP-grasp enzyme  39.95 
 
 		 424 aa  295  1e-78  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.589336  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06110  predicted ATP-grasp enzyme  39.76 
 
 		 421 aa  281  2e-74  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12250  predicted ATP-grasp enzyme  39.08 
 
 		 419 aa  268  1e-70  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.206907  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04920  predicted ATP-grasp enzyme  35.35 
 
 		 753 aa  231  2e-59  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2122  ATP-grasp protein-like protein  32.36 
 
 		 428 aa  215  9.999999999999999e-55  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.598506  normal  0.35732 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1966  ATP-grasp protein  33.57 
 
 		 443 aa  205  1e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.151473  hitchhiker  0.0000495401 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2532  hypothetical protein  29.41 
 
 		 408 aa  199  5e-50  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0136  ATP-grasp protein  28.95 
 
 		 443 aa  192  1e-47  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000567708  normal  0.0743555 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0466  hypothetical protein  29.44 
 
 		 413 aa  185  1.0000000000000001e-45  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1936  ATP-grasp protein-like protein  25.12 
 
 		 414 aa  183  6e-45  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1663  putative ATP-grasp protein  21.28 
 
 		 391 aa  81.6  0.00000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0312334  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2881  ATP-grasp protein-like protein  25.44 
 
 		 399 aa  70.1  0.00000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000202032  hitchhiker  0.00373255 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1119  ATP-grasp enzyme-like protein  24.58 
 
 		 405 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6484  ATP-grasp enzyme-like protein  25 
 
 		 405 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.810845  normal  0.469063 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0958  ATP-grasp enzyme-like  23.64 
 
 		 385 aa  63.5  0.000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6401  hypothetical protein  23.05 
 
 		 418 aa  56.6  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.468222 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0164  ATP-grasp enzyme-like  24.19 
 
 		 416 aa  55.8  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0139  hypothetical protein  24.75 
 
 		 410 aa  53.1  0.000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1598  ATP-grasp enzyme-like protein  21.81 
 
 		 383 aa  52.4  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.116073  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2070  protein of unknown function DUF201  26.17 
 
 		 355 aa  52  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0698  protein of unknown function DUF201  24.49 
 
 		 467 aa  49.3  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0711  hypothetical protein  23.58 
 
 		 356 aa  47.4  0.0005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.283238 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0146  hypothetical protein  21.01 
 
 		 382 aa  47.4  0.0005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0724  protein of unknown function DUF201  23.58 
 
 		 356 aa  47  0.0007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.255037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0684  protein of unknown function DUF201  23.16 
 
 		 356 aa  46.6  0.0009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.401732 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2070  carbamoyl phosphate synthase large subunit  23.79 
 
 		 1029 aa  44.3  0.004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0127  hypothetical protein  21.49 
 
 		 404 aa  44.3  0.005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1700  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  23.77 
 
 		 1496 aa  43.5  0.006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1972  hypothetical protein  24.68 
 
 		 349 aa  43.9  0.006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2376  hypothetical protein  24.14 
 
 		 404 aa  43.5  0.007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2046  D-alanine--D-alanine ligase  21.08 
 
 		 320 aa  43.1  0.009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000802497  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1287  carbamoyl phosphate synthase large subunit  19.72 
 
 		 1057 aa  43.1  0.009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.867856  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1262  carbamoyl phosphate synthase large subunit  19.72 
 
 		 1057 aa  43.1  0.009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>