50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0630 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_0630  hypothetical protein  100 
 
 		 408 aa  857    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2168  ATP-grasp enzyme-like protein  52.71 
 
 		 411 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.862248  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2881  ATP-grasp protein-like protein  29.62 
 
 		 399 aa  195  1e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000202032  hitchhiker  0.00373255 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0164  ATP-grasp enzyme-like  29.18 
 
 		 416 aa  138  2e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6484  ATP-grasp enzyme-like protein  27.51 
 
 		 405 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.810845  normal  0.469063 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1119  ATP-grasp enzyme-like protein  27.39 
 
 		 405 aa  125  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6859  ATP-grasp enzyme-like protein  28.75 
 
 		 400 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0189  hypothetical protein  26.7 
 
 		 391 aa  113  8.000000000000001e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0958  ATP-grasp enzyme-like  25.96 
 
 		 385 aa  112  9e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0139  hypothetical protein  26.89 
 
 		 410 aa  102  1e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1460  ATP-grasp enzyme-like protein  26.67 
 
 		 387 aa  90.1  6e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1598  ATP-grasp enzyme-like protein  24.9 
 
 		 383 aa  82.8  0.00000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.116073  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12240  predicted ATP-grasp enzyme  25.86 
 
 		 424 aa  80.9  0.00000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.589336  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0127  hypothetical protein  23.17 
 
 		 404 aa  73.6  0.000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2376  hypothetical protein  25.71 
 
 		 404 aa  72  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1176  hypothetical protein  23.37 
 
 		 418 aa  72  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.356654  hitchhiker  0.00556122 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2335  hypothetical protein  24.54 
 
 		 404 aa  70.5  0.00000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2532  hypothetical protein  23.71 
 
 		 408 aa  69.3  0.0000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6401  hypothetical protein  22.77 
 
 		 418 aa  67.8  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.468222 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1730  ATP-grasp protein-like protein  25.96 
 
 		 418 aa  64.7  0.000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.171571  normal  0.118252 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04920  predicted ATP-grasp enzyme  26.43 
 
 		 753 aa  63.5  0.000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1936  ATP-grasp protein-like protein  25.82 
 
 		 414 aa  63.2  0.000000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1663  putative ATP-grasp protein  23.99 
 
 		 391 aa  63.2  0.000000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0312334  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0466  hypothetical protein  25.74 
 
 		 413 aa  62.4  0.00000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0579  ATP-grasp enzyme-like protein  25.93 
 
 		 339 aa  62.4  0.00000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1888  protein of unknown function DUF201  26.48 
 
 		 441 aa  62.4  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.205911  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2016  ATP-grasp protein-like protein  20.99 
 
 		 427 aa  60.8  0.00000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.943806 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1972  hypothetical protein  25.42 
 
 		 349 aa  60.5  0.00000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06110  predicted ATP-grasp enzyme  25 
 
 		 421 aa  56.6  0.0000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3434  ATP-grasp protein-like protein  22.48 
 
 		 439 aa  55.8  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1884  ATP-grasp protein-like protein  20.62 
 
 		 434 aa  54.3  0.000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.336917 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0136  ATP-grasp protein  24.9 
 
 		 443 aa  53.5  0.000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000567708  normal  0.0743555 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0665  protein of unknown function DUF201  23.4 
 
 		 386 aa  53.5  0.000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1349  ATP-grasp protein-like protein  27.09 
 
 		 525 aa  52.8  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.971756  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1574  protein tyrosine phosphatase  20.75 
 
 		 695 aa  51.6  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.354937  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2522  carbamoyl phosphate synthase-like protein  22.46 
 
 		 322 aa  51.2  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000809265 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1887  ATP-grasp protein-like protein  24.24 
 
 		 426 aa  50.8  0.00004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.615046  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0384  ATP-grasp enzyme-like  21.23 
 
 		 346 aa  48.5  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0958371 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1350  ATP-grasp protein-like protein  21.59 
 
 		 440 aa  48.9  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1462  protein of unknown function DUF201  27.27 
 
 		 318 aa  47.8  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.127358  normal  0.969827 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1569  hypothetical protein  24.02 
 
 		 412 aa  47  0.0006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2122  ATP-grasp protein-like protein  21.43 
 
 		 428 aa  47  0.0007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.598506  normal  0.35732 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16420  predicted ATP-grasp enzyme  24.16 
 
 		 415 aa  46.2  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2158  argininosuccinate lyase  23.93 
 
 		 914 aa  44.7  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1308  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  19.1 
 
 		 1082 aa  44.7  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13270  D-alanine--D-alanine ligase  22.75 
 
 		 315 aa  44.7  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.122637  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2002  argininosuccinate lyase  23.93 
 
 		 900 aa  44.7  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.848902  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2022  argininosuccinate lyase  23.93 
 
 		 900 aa  44.3  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.10658  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0698  protein of unknown function DUF201  22.83 
 
 		 467 aa  43.5  0.006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1270  protein of unknown function DUF201  21.74 
 
 		 322 aa  43.1  0.01  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.462862 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>