85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_1569 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008789  Hhal_1569  hypothetical protein  100 
 
 		 412 aa  837    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0127  hypothetical protein  46.08 
 
 		 404 aa  367  1e-100  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1574  protein tyrosine phosphatase  41.69 
 
 		 695 aa  311  2e-83  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.354937  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2376  hypothetical protein  36.39 
 
 		 404 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1598  ATP-grasp enzyme-like protein  31.44 
 
 		 383 aa  152  8.999999999999999e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.116073  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0579  ATP-grasp enzyme-like protein  31.46 
 
 		 339 aa  144  3e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1176  hypothetical protein  29.59 
 
 		 418 aa  135  9.999999999999999e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.356654  hitchhiker  0.00556122 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2335  hypothetical protein  34.21 
 
 		 404 aa  134  3.9999999999999996e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3434  ATP-grasp protein-like protein  28.98 
 
 		 439 aa  121  1.9999999999999998e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0698  protein of unknown function DUF201  28.66 
 
 		 467 aa  111  2.0000000000000002e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0958  ATP-grasp enzyme-like  26.38 
 
 		 385 aa  105  1e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1350  ATP-grasp protein-like protein  29.86 
 
 		 440 aa  103  5e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1349  ATP-grasp protein-like protein  41.89 
 
 		 525 aa  102  2e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.971756  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0384  ATP-grasp enzyme-like  28.31 
 
 		 346 aa  99  1e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0958371 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2200  ATP-grasp protein-like protein  26.46 
 
 		 390 aa  97.8  3e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2016  ATP-grasp protein-like protein  28.27 
 
 		 427 aa  94.7  3e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.943806 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0668  ATP-grasp protein-like protein  26.22 
 
 		 393 aa  93.6  6e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0139  hypothetical protein  27.39 
 
 		 410 aa  88.6  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0164  ATP-grasp enzyme-like  23.84 
 
 		 416 aa  85.1  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2168  ATP-grasp enzyme-like protein  24.63 
 
 		 411 aa  84.7  0.000000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.862248  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4600  ATP-grasp protein-like protein  25.57 
 
 		 399 aa  84.7  0.000000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.215683  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0189  hypothetical protein  27.31 
 
 		 391 aa  79  0.0000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1972  hypothetical protein  28.17 
 
 		 349 aa  72.4  0.00000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1884  ATP-grasp protein-like protein  25.42 
 
 		 434 aa  72  0.00000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.336917 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2881  ATP-grasp protein-like protein  19.93 
 
 		 399 aa  69.7  0.00000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000202032  hitchhiker  0.00373255 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1887  ATP-grasp protein-like protein  26.29 
 
 		 426 aa  65.9  0.000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.615046  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1936  ATP-grasp protein-like protein  21.72 
 
 		 414 aa  65.5  0.000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2618  carbamoylphosphate synthase large subunit (split gene in MJ)-like  21.28 
 
 		 387 aa  63.5  0.000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0136  ATP-grasp protein  22.98 
 
 		 443 aa  62.4  0.00000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000567708  normal  0.0743555 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2532  hypothetical protein  24.43 
 
 		 408 aa  62  0.00000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22630  biotin carboxylase  28.01 
 
 		 333 aa  60.1  0.00000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.405302 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3265  hypothetical protein  27.27 
 
 		 412 aa  58.2  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0588  carbamoyl phosphate synthase-like protein  25.7 
 
 		 320 aa  57.4  0.0000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0466  hypothetical protein  23.66 
 
 		 413 aa  55.1  0.000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4422  hypothetical protein  23.6 
 
 		 340 aa  55.5  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.125384  normal  0.305337 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0684  protein of unknown function DUF201  25.21 
 
 		 356 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.401732 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0711  hypothetical protein  24.77 
 
 		 356 aa  55.1  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.283238 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0724  protein of unknown function DUF201  24.77 
 
 		 356 aa  54.3  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.255037  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1401  protein of unknown function DUF201  24.65 
 
 		 409 aa  54.3  0.000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2536  protein of unknown function DUF201  24.83 
 
 		 359 aa  53.9  0.000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.505707  normal  0.139385 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09600  D-alanine-D-alanine ligase A  33.33 
 
 		 346 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0897  D-alanine-D-alanine ligase A  33.33 
 
 		 346 aa  53.1  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.121426  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0766  urea carboxylase  24.44 
 
 		 1201 aa  52.8  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8506  hypothetical protein  31.82 
 
 		 379 aa  52.4  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.412944  normal  0.0307347 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1938  D-alanyl-alanine synthetase A  24.3 
 
 		 376 aa  52  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00320777  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1730  ATP-grasp protein-like protein  27.04 
 
 		 418 aa  50.8  0.00004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.171571  normal  0.118252 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3050  hypothetical protein  38.46 
 
 		 457 aa  50.1  0.00007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4671  D-alanine--D-alanine ligase  28.32 
 
 		 324 aa  50.1  0.00008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0129578  normal  0.448814 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1270  protein of unknown function DUF201  30.4 
 
 		 322 aa  49.7  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.462862 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3255  protein of unknown function DUF201  25.29 
 
 		 327 aa  48.5  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5356  D-alanine/D-alanine ligase  26.11 
 
 		 346 aa  48.5  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0315218  normal  0.0664489 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4983  hypothetical protein  23.08 
 
 		 452 aa  48.9  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.301738 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04920  predicted ATP-grasp enzyme  23.04 
 
 		 753 aa  48.9  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0665  protein of unknown function DUF201  30.14 
 
 		 386 aa  48.1  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0753  carbamoyl phosphate synthase-like protein  23.37 
 
 		 326 aa  48.1  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.564232 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1308  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  20 
 
 		 1082 aa  47.4  0.0004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2122  ATP-grasp protein-like protein  21.78 
 
 		 428 aa  47  0.0005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.598506  normal  0.35732 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2522  carbamoyl phosphate synthase-like protein  22.47 
 
 		 322 aa  47.4  0.0005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000809265 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0630  hypothetical protein  24.02 
 
 		 408 aa  47  0.0006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2232  carbamoyl phosphate synthase large subunit  25.75 
 
 		 1079 aa  46.6  0.0007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.251597  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0146  hypothetical protein  21.98 
 
 		 382 aa  46.6  0.0008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4257  hypothetical protein  28.74 
 
 		 429 aa  46.2  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.845129  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2975  hypothetical protein  22.35 
 
 		 454 aa  46.2  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.155279 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2794  sporulation domain-containing protein  27.85 
 
 		 671 aa  46.2  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1414  D-alanine/D-alanine ligase  25.62 
 
 		 346 aa  45.8  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0421  hypothetical protein  21.66 
 
 		 321 aa  46.2  0.001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0836  protein of unknown function DUF201  23.99 
 
 		 351 aa  45.1  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.532579  normal  0.0458825 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1064  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  23.89 
 
 		 485 aa  45.8  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.000000351305  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1119  ATP-grasp enzyme-like protein  21.63 
 
 		 405 aa  45.4  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16420  predicted ATP-grasp enzyme  22.8 
 
 		 415 aa  44.7  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3455  D-alanine/D-alanine ligase  25.28 
 
 		 336 aa  44.7  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0409597  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1480  D-alanyl-alanine synthetase A  24.21 
 
 		 360 aa  44.7  0.003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.351068 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2070  protein of unknown function DUF201  23.67 
 
 		 355 aa  44.3  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2692  carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  24.15 
 
 		 1091 aa  44.3  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.246578  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2876  hypothetical protein  24.74 
 
 		 734 aa  44.3  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0987  cyanophycin synthetase  31.46 
 
 		 877 aa  43.5  0.006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0216297 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0960  cyanophycin synthetase  31.46 
 
 		 877 aa  43.5  0.006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2741  D-alanine--D-alanine ligase  25.23 
 
 		 304 aa  43.5  0.006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.199895  hitchhiker  0.00000666317 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0949  D-alanine-D-alanine ligase and related ATP-grasp enzyme-like  31.76 
 
 		 573 aa  43.5  0.007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.994551  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2582  D-alanine--D-alanine ligase  25.23 
 
 		 304 aa  43.1  0.008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6484  ATP-grasp enzyme-like protein  22.02 
 
 		 405 aa  43.5  0.008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.810845  normal  0.469063 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3047  hypothetical protein  20.2 
 
 		 439 aa  43.1  0.009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.836021  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3257  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  25.73 
 
 		 458 aa  43.1  0.009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.21701 
 
 
-
 
NC_002978  WD0095  D-alanine--D-alanine ligase  21.47 
 
 		 315 aa  43.1  0.009  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.798262  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1428  phosphoribosylaminoimidazole carboxylase ATPase subunit  32.04 
 
 		 395 aa  43.1  0.01  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>