50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_0698 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_0698  protein of unknown function DUF201  100 
 
 
467 aa  944    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3434  ATP-grasp protein-like protein  48.21 
 
 
439 aa  358  9.999999999999999e-98  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4600  ATP-grasp protein-like protein  47.62 
 
 
399 aa  343  2.9999999999999997e-93  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.215683  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1350  ATP-grasp protein-like protein  46.09 
 
 
440 aa  327  3e-88  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2016  ATP-grasp protein-like protein  45.9 
 
 
427 aa  325  1e-87  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.943806 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1349  ATP-grasp protein-like protein  53.23 
 
 
525 aa  217  4e-55  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.971756  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1598  ATP-grasp enzyme-like protein  28.44 
 
 
383 aa  125  2e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.116073  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0668  ATP-grasp protein-like protein  26.62 
 
 
393 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0384  ATP-grasp enzyme-like  23.01 
 
 
346 aa  111  3e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0958371 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1569  hypothetical protein  28.66 
 
 
412 aa  110  4.0000000000000004e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0127  hypothetical protein  28.07 
 
 
404 aa  101  2e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2335  hypothetical protein  25.13 
 
 
404 aa  100  4e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2376  hypothetical protein  27.23 
 
 
404 aa  96.7  8e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2200  ATP-grasp protein-like protein  25.79 
 
 
390 aa  91.7  3e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0579  ATP-grasp enzyme-like protein  25.76 
 
 
339 aa  87.8  3e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2881  ATP-grasp protein-like protein  22.94 
 
 
399 aa  83.2  0.00000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000202032  hitchhiker  0.00373255 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1972  hypothetical protein  26.54 
 
 
349 aa  79.3  0.0000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0897  hypothetical protein  25.37 
 
 
513 aa  75.5  0.000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.271555  normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3050  hypothetical protein  24.46 
 
 
457 aa  73.9  0.000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0958  ATP-grasp enzyme-like  22.96 
 
 
385 aa  72.8  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0189  hypothetical protein  23.46 
 
 
391 aa  70.1  0.00000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2618  carbamoylphosphate synthase large subunit (split gene in MJ)-like  21.18 
 
 
387 aa  69.7  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1176  hypothetical protein  22.77 
 
 
418 aa  69.3  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.356654  hitchhiker  0.00556122 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1574  protein tyrosine phosphatase  23.55 
 
 
695 aa  67  0.0000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.354937  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0588  carbamoyl phosphate synthase-like protein  25.17 
 
 
320 aa  63.2  0.00000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1774  hypothetical protein  25.16 
 
 
312 aa  61.6  0.00000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0164  ATP-grasp enzyme-like  22.46 
 
 
416 aa  61.2  0.00000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3047  hypothetical protein  24.24 
 
 
439 aa  60.8  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.836021  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0665  protein of unknown function DUF201  24.41 
 
 
386 aa  60.1  0.00000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3212  protein of unknown function DUF201  22.22 
 
 
322 aa  53.5  0.000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1549  hypothetical protein  24.48 
 
 
413 aa  51.6  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2939  hypothetical protein  20 
 
 
387 aa  51.6  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4899  hypothetical protein  23.68 
 
 
406 aa  50.8  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.781459  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3002  hypothetical protein  20.34 
 
 
387 aa  50.8  0.00006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3248  hypothetical protein  20.34 
 
 
387 aa  50.4  0.00006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3255  protein of unknown function DUF201  21.9 
 
 
327 aa  50.1  0.00008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3017  hypothetical protein  20.34 
 
 
360 aa  50.1  0.00008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0773038  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1390  putative ATP-grasp protein  23.89 
 
 
413 aa  49.3  0.0001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00627885  normal  0.224685 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0139  hypothetical protein  22.59 
 
 
410 aa  48.9  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0597  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  22.82 
 
 
457 aa  48.5  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1884  ATP-grasp protein-like protein  24.35 
 
 
434 aa  47.4  0.0006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.336917 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16420  predicted ATP-grasp enzyme  25.88 
 
 
415 aa  47.4  0.0006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1663  putative ATP-grasp protein  23.04 
 
 
391 aa  46.2  0.001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0312334  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4422  hypothetical protein  22.61 
 
 
340 aa  44.7  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.125384  normal  0.305337 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6289  hypothetical protein  26.22 
 
 
325 aa  44.3  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2168  ATP-grasp enzyme-like protein  21.87 
 
 
411 aa  44.7  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.862248  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0146  hypothetical protein  22.37 
 
 
382 aa  44.7  0.004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3257  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  23.05 
 
 
458 aa  43.5  0.007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.21701 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0630  hypothetical protein  22.83 
 
 
408 aa  43.1  0.009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5754  pyruvate carboxylase  24.57 
 
 
1169 aa  43.1  0.01  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.345143  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>