95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0665 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_0665  protein of unknown function DUF201  100 
 
 		 386 aa  775    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3047  hypothetical protein  63.27 
 
 		 439 aa  499  1e-140  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.836021  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0668  ATP-grasp protein-like protein  40.11 
 
 		 393 aa  241  2e-62  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2200  ATP-grasp protein-like protein  34.2 
 
 		 390 aa  204  3e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3050  hypothetical protein  32.96 
 
 		 457 aa  194  3e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2335  hypothetical protein  28.48 
 
 		 404 aa  98.6  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2376  hypothetical protein  28.22 
 
 		 404 aa  94.4  3e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0384  ATP-grasp enzyme-like  24.54 
 
 		 346 aa  92.4  1e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0958371 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0127  hypothetical protein  27 
 
 		 404 aa  90.1  6e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1598  ATP-grasp enzyme-like protein  23.53 
 
 		 383 aa  85.9  0.000000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.116073  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3434  ATP-grasp protein-like protein  30.18 
 
 		 439 aa  84  0.000000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2016  ATP-grasp protein-like protein  24.69 
 
 		 427 aa  79.3  0.0000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.943806 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2618  carbamoylphosphate synthase large subunit (split gene in MJ)-like  21.85 
 
 		 387 aa  77.8  0.0000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0724  protein of unknown function DUF201  25.89 
 
 		 356 aa  74.7  0.000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.255037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0711  hypothetical protein  25.89 
 
 		 356 aa  74.7  0.000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.283238 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0684  protein of unknown function DUF201  24.6 
 
 		 356 aa  71.6  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.401732 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2958  hypothetical protein  20.45 
 
 		 387 aa  67.4  0.0000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0760444  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3255  protein of unknown function DUF201  24.23 
 
 		 327 aa  66.6  0.0000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2070  protein of unknown function DUF201  23.17 
 
 		 355 aa  66.2  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3248  hypothetical protein  19.17 
 
 		 387 aa  64.7  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1176  hypothetical protein  22.46 
 
 		 418 aa  64.3  0.000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.356654  hitchhiker  0.00556122 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3002  hypothetical protein  19.17 
 
 		 387 aa  64.7  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3017  hypothetical protein  19.25 
 
 		 360 aa  64.3  0.000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0773038  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3531  hypothetical protein  24.73 
 
 		 397 aa  62.4  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1349  ATP-grasp protein-like protein  34.86 
 
 		 525 aa  62.8  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.971756  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2939  hypothetical protein  20.3 
 
 		 387 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0698  protein of unknown function DUF201  23.94 
 
 		 467 aa  60.5  0.00000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0421  hypothetical protein  20.85 
 
 		 321 aa  60.1  0.00000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2168  ATP-grasp enzyme-like protein  25 
 
 		 411 aa  60.1  0.00000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.862248  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1350  ATP-grasp protein-like protein  24.17 
 
 		 440 aa  58.2  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1270  protein of unknown function DUF201  26.58 
 
 		 322 aa  56.2  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.462862 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0189  hypothetical protein  25.6 
 
 		 391 aa  55.8  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0753  carbamoyl phosphate synthase-like protein  21.24 
 
 		 326 aa  55.8  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.564232 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0579  ATP-grasp enzyme-like protein  20.96 
 
 		 339 aa  55.5  0.000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0630  hypothetical protein  23.4 
 
 		 408 aa  54.3  0.000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2876  hypothetical protein  24.47 
 
 		 734 aa  53.9  0.000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0139  hypothetical protein  24.43 
 
 		 410 aa  52.8  0.000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2808  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  26.71 
 
 		 1097 aa  52.4  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2001  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  22.63 
 
 		 946 aa  51.2  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.890669  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1477  carbamoyl-phosphate synthase large subunit  22.53 
 
 		 1054 aa  51.2  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.438417  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1574  protein tyrosine phosphatase  23.28 
 
 		 695 aa  50.4  0.00005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.354937  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1549  hypothetical protein  23.49 
 
 		 413 aa  50.1  0.00007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3132  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  24.78 
 
 		 1101 aa  50.1  0.00007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.288772  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0637  hypothetical protein  25.2 
 
 		 484 aa  49.3  0.0001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.110504  normal  0.0645726 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0958  ATP-grasp enzyme-like  24.25 
 
 		 385 aa  49.7  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1302  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  22.59 
 
 		 1082 aa  49.3  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1120  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  21.94 
 
 		 554 aa  48.9  0.0002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4600  ATP-grasp protein-like protein  25.89 
 
 		 399 aa  48.9  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.215683  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0373  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  24.77 
 
 		 1075 aa  48.5  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2459  RimK domain-containing protein ATP-grasp  23.73 
 
 		 320 aa  48.5  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.26965  normal  0.276307 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1569  hypothetical protein  30.14 
 
 		 412 aa  48.1  0.0003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2484  carbamoyl phosphate synthase-like protein  23.97 
 
 		 354 aa  48.1  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.834927  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1919  hypothetical protein  25.89 
 
 		 284 aa  47.8  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.57396 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4379  protein of unknown function DUF201  20.9 
 
 		 323 aa  47.4  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2214  carbamoyl phosphate synthase large subunit  23.4 
 
 		 1072 aa  46.6  0.0007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.173726  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1917  carbamoyl phosphate synthase large subunit  21.99 
 
 		 1065 aa  46.6  0.0007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1370  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  21.89 
 
 		 1095 aa  46.6  0.0007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0613  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  22.43 
 
 		 1073 aa  46.6  0.0008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.438109  normal  0.344128 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5241  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  23.26 
 
 		 1099 aa  46.2  0.0009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.560222  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0481  protein of unknown function DUF201  25.39 
 
 		 375 aa  46.2  0.0009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1598  carbamoyl phosphate synthase large subunit  23.12 
 
 		 1042 aa  45.4  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3012  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  27.22 
 
 		 1107 aa  45.4  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.541011  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1047  carbamoyl phosphate synthase large subunit  21.99 
 
 		 1065 aa  45.4  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0769  carbamoyl phosphate synthase large subunit  21.94 
 
 		 1057 aa  45.8  0.001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0534  hypothetical protein  24.38 
 
 		 380 aa  46.2  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3357  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  23.32 
 
 		 1112 aa  46.2  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2456  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  23.79 
 
 		 1096 aa  45.4  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4723  carbamoyl phosphate synthase large subunit  21.59 
 
 		 1073 aa  45.1  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00575089 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04920  predicted ATP-grasp enzyme  21.66 
 
 		 753 aa  45.4  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4724  carbamoyl phosphate synthase large subunit  21.59 
 
 		 1073 aa  45.1  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2485  pyruvate carboxylase  25.11 
 
 		 1145 aa  45.4  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1446  carbamoyl phosphate synthase large subunit  22.58 
 
 		 1066 aa  45.1  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0402  pyruvate carboxylase  26.55 
 
 		 1147 aa  45.4  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2623  hypothetical protein  24.67 
 
 		 341 aa  45.1  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4057  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  24.63 
 
 		 1113 aa  45.1  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3289  protein of unknown function DUF201  24.18 
 
 		 361 aa  44.7  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0509227  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2536  protein of unknown function DUF201  21.99 
 
 		 359 aa  44.3  0.003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.505707  normal  0.139385 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1972  hypothetical protein  23.57 
 
 		 349 aa  44.7  0.003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4589  carbamoyl phosphate synthase large subunit  21.59 
 
 		 1055 aa  44.7  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.387511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6289  hypothetical protein  28.67 
 
 		 325 aa  44.7  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0709  carbamoyl phosphate synthase large subunit  21.59 
 
 		 1073 aa  44.7  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0416816 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1287  carbamoyl phosphate synthase large subunit  21.94 
 
 		 1057 aa  44.3  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.867856  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1262  carbamoyl phosphate synthase large subunit  21.94 
 
 		 1057 aa  44.3  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1888  protein of unknown function DUF201  26.11 
 
 		 441 aa  44.3  0.004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.205911  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0146  hypothetical protein  22.4 
 
 		 382 aa  44.3  0.004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3202  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  21.3 
 
 		 1079 aa  44.3  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2352  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  20.43 
 
 		 1074 aa  43.9  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.374511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0085  carbamoyl phosphate synthase large subunit  22.46 
 
 		 1056 aa  43.5  0.006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00260745  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0559  carbamoyl phosphate synthase large subunit  21.69 
 
 		 1059 aa  43.5  0.006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1087  carbamoyl phosphate synthase large subunit  21.08 
 
 		 1062 aa  43.5  0.006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4206  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  24.12 
 
 		 1077 aa  43.1  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.412079  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0098  protein of unknown function DUF201  24.08 
 
 		 334 aa  43.5  0.007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3198  carbamoyl phosphate synthase large subunit  24.02 
 
 		 1130 aa  43.1  0.008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00397433  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4983  hypothetical protein  20 
 
 		 452 aa  43.1  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.301738 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2446  carbamoyl-phosphate synthase large subunit  20.06 
 
 		 1106 aa  43.1  0.009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>