More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A2484 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A2484  carbamoyl phosphate synthase-like protein  100 
 
 		 354 aa  726    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.834927  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0588  carbamoyl phosphate synthase-like protein  35.05 
 
 		 320 aa  199  7e-50  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2522  carbamoyl phosphate synthase-like protein  31.63 
 
 		 322 aa  177  2e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000809265 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3255  protein of unknown function DUF201  31.85 
 
 		 327 aa  169  9e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0753  carbamoyl phosphate synthase-like protein  31.63 
 
 		 326 aa  163  4.0000000000000004e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.564232 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5257  protein of unknown function DUF201  32.94 
 
 		 363 aa  128  1.0000000000000001e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0421  hypothetical protein  26.96 
 
 		 321 aa  125  2e-27  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1774  hypothetical protein  26.94 
 
 		 312 aa  120  3e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3820  carbamoyl phosphate synthase-like protein  29.81 
 
 		 343 aa  120  3.9999999999999996e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.937743  normal  0.217924 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1520  carbamoyl phosphate synthase-like protein  27.37 
 
 		 327 aa  100  5e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1935  carbamoyl phosphate synthase-like protein  28.31 
 
 		 324 aa  98.6  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0098  protein of unknown function DUF201  25.62 
 
 		 334 aa  96.7  6e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3212  protein of unknown function DUF201  26.58 
 
 		 322 aa  91.7  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0533  carbamoyl phosphate synthase-like protein  25.78 
 
 		 336 aa  88.2  2e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1270  protein of unknown function DUF201  27.72 
 
 		 322 aa  87.8  3e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.462862 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4794  protein of unknown function DUF201  27.35 
 
 		 337 aa  82.8  0.000000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1462  protein of unknown function DUF201  24.46 
 
 		 318 aa  81.6  0.00000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.127358  normal  0.969827 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22630  biotin carboxylase  27.03 
 
 		 333 aa  79.3  0.00000000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.405302 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0836  protein of unknown function DUF201  25.8 
 
 		 351 aa  77.8  0.0000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.532579  normal  0.0458825 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4563  carbamoyl phosphate synthase-like protein  28.84 
 
 		 330 aa  76.6  0.0000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.146127  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0637  hypothetical protein  26.69 
 
 		 484 aa  75.5  0.000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.110504  normal  0.0645726 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1133  protein of unknown function DUF201  23.08 
 
 		 342 aa  75.9  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2536  protein of unknown function DUF201  29.57 
 
 		 359 aa  73.9  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.505707  normal  0.139385 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0385  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.38 
 
 		 677 aa  73.6  0.000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6289  hypothetical protein  25.44 
 
 		 325 aa  71.6  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3289  protein of unknown function DUF201  23.75 
 
 		 361 aa  71.6  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0509227  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4702  protein of unknown function DUF201  28.96 
 
 		 346 aa  70.5  0.00000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0701331  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2623  hypothetical protein  26.91 
 
 		 341 aa  66.2  0.0000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1598  ATP-grasp enzyme-like protein  25.64 
 
 		 383 aa  66.2  0.0000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.116073  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2987  phosphoribosylglycinamide synthetase  28.14 
 
 		 410 aa  63.9  0.000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.0000000000875543  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1414  D-alanine/D-alanine ligase  31.87 
 
 		 346 aa  62  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5793  D-alanine--D-lactate ligase  32.17 
 
 		 346 aa  61.2  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0328939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2612  D-alanine--D-alanine ligase  29.63 
 
 		 317 aa  61.2  0.00000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000431315  unclonable  0.00000000000418412 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0754  protein of unknown function DUF201  25 
 
 		 409 aa  60.1  0.00000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1684  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  24.08 
 
 		 1071 aa  58.9  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000705985  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7137  D-alanine--D-lactate ligase  30.34 
 
 		 348 aa  57.4  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.137191  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04920  predicted ATP-grasp enzyme  24.3 
 
 		 753 aa  57.8  0.0000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5356  D-alanine/D-alanine ligase  30.63 
 
 		 346 aa  57.8  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0315218  normal  0.0664489 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3132  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  24.2 
 
 		 1101 aa  57.4  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.288772  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0579  ATP-grasp enzyme-like protein  23.43 
 
 		 339 aa  57.4  0.0000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0833  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  24.89 
 
 		 1086 aa  57  0.0000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00324716  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12240  predicted ATP-grasp enzyme  27.24 
 
 		 424 aa  56.2  0.0000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.589336  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2876  hypothetical protein  24.89 
 
 		 734 aa  56.2  0.0000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3891  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  24.06 
 
 		 525 aa  56.2  0.0000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6289  lysine biosynthesis enzyme LysX  31.96 
 
 		 293 aa  56.2  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2867  carbamoyl phosphate synthase large subunit  25.29 
 
 		 1084 aa  56.2  0.0000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00982729  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3857  protein of unknown function DUF201  25.85 
 
 		 430 aa  56.2  0.0000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.214933 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4671  D-alanine--D-alanine ligase  28.1 
 
 		 324 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0129578  normal  0.448814 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0924  D-alanine--D-alanine ligase  27.32 
 
 		 313 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.783773  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2724  lysine biosynthesis enzyme LysX  29.23 
 
 		 281 aa  54.7  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.772565  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2376  hypothetical protein  23.43 
 
 		 404 aa  55.1  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2144  phosphoribosylglycinamide synthetase  28.93 
 
 		 416 aa  55.1  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0250211 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1732  carbamoyl phosphate synthase large subunit  25 
 
 		 1076 aa  54.7  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.215987  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0724  protein of unknown function DUF201  23.27 
 
 		 356 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.255037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0946  D-alanine--D-alanine ligase  29.47 
 
 		 318 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.427679  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1257  carbamoyl phosphate synthase large subunit  24.51 
 
 		 1084 aa  55.1  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0711  hypothetical protein  23.27 
 
 		 356 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.283238 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1263  carbamoyl phosphate synthase large subunit  24.31 
 
 		 1084 aa  54.7  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.522789  normal  0.213082 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0811  carbamoyl phosphate synthase large subunit  24.31 
 
 		 1084 aa  54.7  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1292  carbamoyl phosphate synthase large subunit  24.31 
 
 		 1084 aa  54.7  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0373  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  28.36 
 
 		 1075 aa  54.3  0.000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2175  carbamoyl phosphate synthase large subunit  24.59 
 
 		 1082 aa  54.3  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.321083  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1967  carbamoyl phosphate synthase large subunit  24.9 
 
 		 1076 aa  54.7  0.000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1339  D-alanine--D-alanine ligase  28.95 
 
 		 318 aa  53.9  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.266833  normal  0.0340242 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1664  D-alanine--D-lactate ligase  32.72 
 
 		 341 aa  53.9  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2006  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  25.74 
 
 		 1098 aa  53.9  0.000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.488825  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02890  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  23.73 
 
 		 1067 aa  53.9  0.000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0033  carbamoyl phosphate synthase large subunit  25.31 
 
 		 1073 aa  53.5  0.000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4510  D-alanine--D-alanine ligase  28.95 
 
 		 318 aa  53.5  0.000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.926971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1972  hypothetical protein  23.48 
 
 		 349 aa  53.9  0.000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1919  hypothetical protein  23.7 
 
 		 284 aa  53.1  0.000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.57396 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4385  D-alanine--D-alanine ligase  28.95 
 
 		 318 aa  53.5  0.000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0215233  normal  0.165436 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62910  carbamoyl phosphate synthase large subunit  25 
 
 		 1073 aa  53.1  0.000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5476  carbamoyl phosphate synthase large subunit  25 
 
 		 1073 aa  52.8  0.000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.783479  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4648  protein of unknown function DUF201  28.91 
 
 		 404 aa  53.1  0.000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.896666  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2611  carbamoyl-phosphate synthase large subunit  24.89 
 
 		 1056 aa  52.8  0.000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.994048 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1370  carbamoyl-phosphate synthase large chain  24.8 
 
 		 1073 aa  52.8  0.000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.636117  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1840  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  25.25 
 
 		 450 aa  52.8  0.000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0829  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  24.47 
 
 		 1112 aa  52.8  0.000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1430  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  24.8 
 
 		 1073 aa  52.8  0.000009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3566  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  24.9 
 
 		 1073 aa  52  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0036  carbamoyl phosphate synthase large subunit  24.9 
 
 		 1073 aa  52  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1507  carbamoyl phosphate synthase large subunit  24.22 
 
 		 1084 aa  52.4  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3622  carbamoyl phosphate synthase large subunit  24.9 
 
 		 1073 aa  52  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.443028 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0772  carbamoyl phosphate synthase large subunit  24.22 
 
 		 1084 aa  52.4  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4931  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  23.73 
 
 		 1052 aa  52.4  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.324611 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0814  carbamoyl-phosphate synthase large subunit  24.47 
 
 		 1084 aa  52.4  0.00001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.253705  normal  0.0427985 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3620  carbamoyl phosphate synthase large subunit  25 
 
 		 1073 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.830394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00913  carbamoyl phosphate synthase large subunit  23.98 
 
 		 1077 aa  52.4  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12690  carbamoyl-phosphate synthase large subunit  25.3 
 
 		 1118 aa  52.4  0.00001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0359466  normal  0.0639836 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0479  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  25.31 
 
 		 1075 aa  52.8  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2886  carbamoyl phosphate synthase large subunit  24.19 
 
 		 1082 aa  52.4  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.827795  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0438  lysine biosynthesis enzyme LysX  28.95 
 
 		 281 aa  52.4  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00025755 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0779  carbamoyl-phosphate synthase large subunit  24.47 
 
 		 1068 aa  52  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0332696  hitchhiker  0.000231672 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0481  protein of unknown function DUF201  24.83 
 
 		 375 aa  52.8  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0036  carbamoyl phosphate synthase large subunit  24.9 
 
 		 1073 aa  52  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1281  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  24.77 
 
 		 1074 aa  52.4  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1047  carbamoyl phosphate synthase large subunit  24.22 
 
 		 1065 aa  52.4  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1283  carbamoyl phosphate synthase large subunit  24.22 
 
 		 1084 aa  52.4  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.494856  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2153  D-alanine--D-alanine ligase  28.7 
 
 		 333 aa  52.4  0.00001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>