29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4379 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_4379  protein of unknown function DUF201  100 
 
 		 323 aa  665    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3002  hypothetical protein  33.02 
 
 		 387 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2958  hypothetical protein  33.12 
 
 		 387 aa  164  3e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0760444  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3017  hypothetical protein  32.49 
 
 		 360 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0773038  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3248  hypothetical protein  32.7 
 
 		 387 aa  162  6e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2939  hypothetical protein  33.02 
 
 		 387 aa  162  6e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4983  hypothetical protein  32.92 
 
 		 452 aa  159  5e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.301738 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3856  hypothetical protein  31.45 
 
 		 458 aa  142  6e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.930196 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4257  hypothetical protein  33.23 
 
 		 429 aa  142  8e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.845129  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002731  carbamoylphosphate synthase large subunit  30.55 
 
 		 370 aa  139  4.999999999999999e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2975  hypothetical protein  29.39 
 
 		 454 aa  138  1e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.155279 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3531  hypothetical protein  23.91 
 
 		 397 aa  99.8  6e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1549  hypothetical protein  26.18 
 
 		 413 aa  92.8  7e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0081  hypothetical protein  27.24 
 
 		 418 aa  81.6  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06402  conserved hypothetical protein  24.92 
 
 		 816 aa  81.3  0.00000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0546217 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4899  hypothetical protein  26.55 
 
 		 406 aa  80.5  0.00000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.781459  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0897  hypothetical protein  25.89 
 
 		 513 aa  78.6  0.0000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.271555  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0668  ATP-grasp protein-like protein  26.32 
 
 		 393 aa  77  0.0000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2200  ATP-grasp protein-like protein  23.66 
 
 		 390 aa  62.8  0.000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3050  hypothetical protein  25.7 
 
 		 457 aa  62  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2536  protein of unknown function DUF201  22.34 
 
 		 359 aa  58.9  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.505707  normal  0.139385 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3047  hypothetical protein  21.89 
 
 		 439 aa  56.6  0.0000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.836021  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0684  protein of unknown function DUF201  24.9 
 
 		 356 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.401732 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0146  hypothetical protein  24.34 
 
 		 382 aa  52  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0421  hypothetical protein  21.28 
 
 		 321 aa  48.9  0.0001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0665  protein of unknown function DUF201  20.9 
 
 		 386 aa  47.4  0.0004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0637  hypothetical protein  22.81 
 
 		 484 aa  47  0.0004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.110504  normal  0.0645726 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2070  protein of unknown function DUF201  25.71 
 
 		 355 aa  46.6  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1477  carbamoyl-phosphate synthase large subunit  20.94 
 
 		 1054 aa  42.7  0.008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.438417  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>