37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_1549 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_1549  hypothetical protein  100 
 
 		 413 aa  813    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4899  hypothetical protein  76.6 
 
 		 406 aa  577  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.781459  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0897  hypothetical protein  50.37 
 
 		 513 aa  381  1e-104  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.271555  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0081  hypothetical protein  51.24 
 
 		 418 aa  333  3e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4379  protein of unknown function DUF201  26.18 
 
 		 323 aa  92.4  1e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0668  ATP-grasp protein-like protein  27.8 
 
 		 393 aa  83.6  0.000000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2376  hypothetical protein  27.03 
 
 		 404 aa  82  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1598  ATP-grasp enzyme-like protein  22.74 
 
 		 383 aa  77.4  0.0000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.116073  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3531  hypothetical protein  25.97 
 
 		 397 aa  72.4  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3050  hypothetical protein  27.17 
 
 		 457 aa  70.9  0.00000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3002  hypothetical protein  22.55 
 
 		 387 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3248  hypothetical protein  22.55 
 
 		 387 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3017  hypothetical protein  22.55 
 
 		 360 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0773038  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2958  hypothetical protein  22.26 
 
 		 387 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0760444  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2939  hypothetical protein  22.18 
 
 		 387 aa  67  0.0000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2200  ATP-grasp protein-like protein  21.97 
 
 		 390 aa  66.6  0.0000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0384  ATP-grasp enzyme-like  21.94 
 
 		 346 aa  55.5  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0958371 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2335  hypothetical protein  23.12 
 
 		 404 aa  55.5  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4983  hypothetical protein  21.68 
 
 		 452 aa  54.7  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.301738 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2618  carbamoylphosphate synthase large subunit (split gene in MJ)-like  19.61 
 
 		 387 aa  53.5  0.000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12240  predicted ATP-grasp enzyme  28 
 
 		 424 aa  51.6  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.589336  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0698  protein of unknown function DUF201  24.48 
 
 		 467 aa  51.2  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6289  hypothetical protein  27.3 
 
 		 325 aa  50.4  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1972  hypothetical protein  26.12 
 
 		 349 aa  49.7  0.00009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0665  protein of unknown function DUF201  23.49 
 
 		 386 aa  49.3  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2168  ATP-grasp enzyme-like protein  26.12 
 
 		 411 aa  48.9  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.862248  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1574  protein tyrosine phosphatase  25.26 
 
 		 695 aa  48.1  0.0003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.354937  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002731  carbamoylphosphate synthase large subunit  23.32 
 
 		 370 aa  47  0.0007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2975  hypothetical protein  18.9 
 
 		 454 aa  46.6  0.0008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.155279 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0138  pyruvate carboxylase subunit A  21.76 
 
 		 500 aa  46.2  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.732252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0637  hypothetical protein  26.38 
 
 		 484 aa  45.1  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.110504  normal  0.0645726 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3856  hypothetical protein  20.51 
 
 		 458 aa  45.4  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.930196 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2016  ATP-grasp protein-like protein  23.4 
 
 		 427 aa  44.7  0.003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.943806 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6042  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  22.65 
 
 		 451 aa  43.9  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.650251  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3047  hypothetical protein  22.34 
 
 		 439 aa  43.5  0.006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.836021  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4257  hypothetical protein  25.42 
 
 		 429 aa  43.5  0.007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.845129  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1728  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP- binding  35.44 
 
 		 626 aa  43.5  0.007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00036271  normal  0.117337 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>