35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_4899 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_4899  hypothetical protein  100 
 
 		 406 aa  806    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.781459  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1549  hypothetical protein  76.6 
 
 		 413 aa  609  1e-173  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0897  hypothetical protein  50.37 
 
 		 513 aa  381  1e-104  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.271555  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0081  hypothetical protein  52.11 
 
 		 418 aa  331  1e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4379  protein of unknown function DUF201  27.6 
 
 		 323 aa  80.1  0.00000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2376  hypothetical protein  25.77 
 
 		 404 aa  78.2  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0668  ATP-grasp protein-like protein  25.43 
 
 		 393 aa  69.7  0.00000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3017  hypothetical protein  21.82 
 
 		 360 aa  63.5  0.000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0773038  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3002  hypothetical protein  21.82 
 
 		 387 aa  62.8  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3248  hypothetical protein  21.82 
 
 		 387 aa  62.8  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2200  ATP-grasp protein-like protein  22.04 
 
 		 390 aa  60.8  0.00000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2939  hypothetical protein  21.45 
 
 		 387 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1598  ATP-grasp enzyme-like protein  23.03 
 
 		 383 aa  59.3  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.116073  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3531  hypothetical protein  25.46 
 
 		 397 aa  58.9  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2958  hypothetical protein  21.82 
 
 		 387 aa  57.8  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0760444  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3050  hypothetical protein  25.28 
 
 		 457 aa  55.8  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2335  hypothetical protein  24.68 
 
 		 404 aa  55.1  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2618  carbamoylphosphate synthase large subunit (split gene in MJ)-like  19.77 
 
 		 387 aa  54.7  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002731  carbamoylphosphate synthase large subunit  24.29 
 
 		 370 aa  52.8  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0698  protein of unknown function DUF201  23 
 
 		 467 aa  52  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3434  ATP-grasp protein-like protein  23.22 
 
 		 439 aa  51.6  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1350  ATP-grasp protein-like protein  24.91 
 
 		 440 aa  48.9  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1972  hypothetical protein  27.13 
 
 		 349 aa  48.1  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3856  hypothetical protein  21.55 
 
 		 458 aa  47.8  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.930196 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0138  pyruvate carboxylase subunit A  21.9 
 
 		 500 aa  47  0.0006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.732252  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2016  ATP-grasp protein-like protein  25.32 
 
 		 427 aa  46.6  0.0007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.943806 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1518  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  23.91 
 
 		 449 aa  45.8  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0122051  normal  0.737322 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_44400  predicted protein  23.66 
 
 		 2012 aa  46.2  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.251659  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0384  ATP-grasp enzyme-like  20.8 
 
 		 346 aa  44.3  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0958371 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4983  hypothetical protein  20.21 
 
 		 452 aa  44.3  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.301738 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2715  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  23.37 
 
 		 448 aa  43.9  0.005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0856039  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1728  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP- binding  36.71 
 
 		 626 aa  43.5  0.007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00036271  normal  0.117337 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1520  carbamoyl phosphate synthase-like protein  24.47 
 
 		 327 aa  43.1  0.009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2436  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  23.74 
 
 		 655 aa  43.1  0.01  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.930093  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2969  hypothetical protein  30.81 
 
 		 402 aa  42.7  0.01  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>