251 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1520 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_1520  carbamoyl phosphate synthase-like protein  100 
 
 		 327 aa  677    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1133  protein of unknown function DUF201  31.38 
 
 		 342 aa  160  4e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0533  carbamoyl phosphate synthase-like protein  31.94 
 
 		 336 aa  155  8e-37  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2623  hypothetical protein  31.15 
 
 		 341 aa  142  8e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4563  carbamoyl phosphate synthase-like protein  28.7 
 
 		 330 aa  140  3e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.146127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0421  hypothetical protein  25.91 
 
 		 321 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0588  carbamoyl phosphate synthase-like protein  27.48 
 
 		 320 aa  103  4e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2484  carbamoyl phosphate synthase-like protein  27.37 
 
 		 354 aa  100  4e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.834927  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0753  carbamoyl phosphate synthase-like protein  25.8 
 
 		 326 aa  94.7  2e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.564232 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22630  biotin carboxylase  25.24 
 
 		 333 aa  92  1e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.405302 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3289  protein of unknown function DUF201  25.64 
 
 		 361 aa  90.5  4e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0509227  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0098  protein of unknown function DUF201  24.68 
 
 		 334 aa  89.4  7e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1462  protein of unknown function DUF201  24.52 
 
 		 318 aa  86.3  6e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.127358  normal  0.969827 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3820  carbamoyl phosphate synthase-like protein  24.04 
 
 		 343 aa  86.3  7e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.937743  normal  0.217924 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2522  carbamoyl phosphate synthase-like protein  26.59 
 
 		 322 aa  83.6  0.000000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000809265 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4794  protein of unknown function DUF201  23.47 
 
 		 337 aa  82.8  0.000000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1270  protein of unknown function DUF201  26.77 
 
 		 322 aa  82.8  0.000000000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.462862 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1972  hypothetical protein  23.7 
 
 		 349 aa  80.9  0.00000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3255  protein of unknown function DUF201  24.65 
 
 		 327 aa  77.4  0.0000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1774  hypothetical protein  21.99 
 
 		 312 aa  75.1  0.000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0385  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.39 
 
 		 677 aa  74.3  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0637  hypothetical protein  25.78 
 
 		 484 aa  70.5  0.00000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.110504  normal  0.0645726 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1935  carbamoyl phosphate synthase-like protein  24.03 
 
 		 324 aa  70.9  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2392  putative carbamoylphosphate synthase large subunit short form  26.09 
 
 		 428 aa  66.6  0.0000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000165669  hitchhiker  0.0000484341 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0481  protein of unknown function DUF201  23.55 
 
 		 375 aa  63.5  0.000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0836  protein of unknown function DUF201  21.27 
 
 		 351 aa  61.2  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.532579  normal  0.0458825 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4658  hypothetical protein  24.59 
 
 		 339 aa  61.6  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.601408 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1967  carbamoyl phosphate synthase large subunit  25.42 
 
 		 1076 aa  61.2  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2576  carbamoyl phosphate synthase large subunit  29.1 
 
 		 1067 aa  60.8  0.00000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3620  carbamoyl phosphate synthase large subunit  25.33 
 
 		 1073 aa  60.5  0.00000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.830394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2897  carbamoyl phosphate synthase large subunit  29.1 
 
 		 1067 aa  60.5  0.00000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1562  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  29.08 
 
 		 1077 aa  59.7  0.00000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0769  carbamoyl phosphate synthase large subunit  27.84 
 
 		 1057 aa  58.9  0.0000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0833  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  23.83 
 
 		 1086 aa  58.9  0.0000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00324716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6289  hypothetical protein  24.32 
 
 		 325 aa  58.5  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0949  carbamoyl phosphate synthase large subunit  23.68 
 
 		 1072 aa  58.5  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.742849  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0741  carbamoyl phosphate synthase large subunit  22.92 
 
 		 1040 aa  58.2  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1919  hypothetical protein  21.83 
 
 		 284 aa  58.2  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.57396 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0767  carbamoyl phosphate synthase large subunit  24.01 
 
 		 1073 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.256868  normal  0.1584 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5241  hypothetical protein  26.62 
 
 		 429 aa  57.4  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0582778  normal  0.347235 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0559  carbamoyl phosphate synthase large subunit  28.64 
 
 		 1059 aa  57.8  0.0000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4501  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  23.84 
 
 		 1073 aa  57.4  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4191  carbamoyl phosphate synthase large subunit  23.84 
 
 		 1073 aa  56.2  0.0000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.725714  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3212  protein of unknown function DUF201  22.81 
 
 		 322 aa  55.8  0.0000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0925  carbamoyl phosphate synthase large subunit  32.21 
 
 		 939 aa  55.5  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.49458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0779  carbamoyl-phosphate synthase large subunit  23.41 
 
 		 1068 aa  55.5  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0332696  hitchhiker  0.000231672 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0829  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  25.62 
 
 		 1112 aa  55.5  0.000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5257  protein of unknown function DUF201  26.52 
 
 		 363 aa  55.5  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1598  carbamoyl phosphate synthase large subunit  23.75 
 
 		 1042 aa  55.5  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0814  carbamoyl-phosphate synthase large subunit  25.62 
 
 		 1084 aa  55.1  0.000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.253705  normal  0.0427985 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62910  carbamoyl phosphate synthase large subunit  24.34 
 
 		 1073 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1498  carbamoyl phosphate synthase large subunit  28 
 
 		 1064 aa  54.7  0.000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5476  carbamoyl phosphate synthase large subunit  24.34 
 
 		 1073 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.783479  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4723  carbamoyl phosphate synthase large subunit  23.1 
 
 		 1073 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00575089 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1467  carbamoyl phosphate synthase large subunit  27.03 
 
 		 1085 aa  54.3  0.000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4589  carbamoyl phosphate synthase large subunit  23.1 
 
 		 1055 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.387511  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1207  carbamoyl-phosphate synthase large subunit  27.93 
 
 		 1059 aa  53.9  0.000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42930  carbamoyl phosphate synthase large subunit  23.36 
 
 		 1073 aa  53.5  0.000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0709  carbamoyl phosphate synthase large subunit  22.92 
 
 		 1073 aa  53.9  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0416816 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12823  carbamoyl-phosphate synthase, large (or ammonia) subunit (carB)  27.01 
 
 		 950 aa  53.9  0.000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.188852  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1042  carbamoyl phosphate synthase large subunit  27.93 
 
 		 1060 aa  53.5  0.000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0115  carbamoyl phosphate synthase large subunit  26.32 
 
 		 1056 aa  53.1  0.000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1990  carbamoyl phosphate synthase large subunit  26.46 
 
 		 1046 aa  53.1  0.000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.950925  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1370  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  25.48 
 
 		 1095 aa  53.1  0.000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0586  carbamoyl phosphate synthase large subunit  24.17 
 
 		 1076 aa  52.8  0.000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.221423  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2072  carbamoyl phosphate synthase large subunit  27.59 
 
 		 1083 aa  52.8  0.000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.471557 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2877  carbamoyl phosphate synthase large subunit  27.98 
 
 		 1076 aa  52.4  0.000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.1435 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0555  carbamoyl phosphate synthase large subunit  23.75 
 
 		 1074 aa  52  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.770872  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004478  carbamoyl-phosphate synthase large chain  22.92 
 
 		 1077 aa  52  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1378  carbamoyl phosphate synthase large subunit  25.6 
 
 		 1075 aa  52.4  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1262  carbamoyl phosphate synthase large subunit  26.14 
 
 		 1057 aa  52.4  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4724  carbamoyl phosphate synthase large subunit  22.77 
 
 		 1073 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1287  carbamoyl phosphate synthase large subunit  26.14 
 
 		 1057 aa  52.4  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.867856  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2503  carbamoyl phosphate synthase large subunit  23.51 
 
 		 1076 aa  52.4  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0897  carbamoyl phosphate synthase large subunit  23.41 
 
 		 1076 aa  52.4  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.641004 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1917  carbamoyl phosphate synthase large subunit  28 
 
 		 1065 aa  52  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0593  carbamoyl phosphate synthase large subunit  24.09 
 
 		 1074 aa  52  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.820402  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1886  carbamoyl phosphate synthase large subunit  27.31 
 
 		 950 aa  51.2  0.00002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.964164  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3211  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  26.73 
 
 		 1082 aa  52  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03505  conserved hypothetical protein  21.96 
 
 		 380 aa  50.8  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0380  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  23.75 
 
 		 1099 aa  50.8  0.00003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0635  carbamoyl phosphate synthase large subunit  25.99 
 
 		 1076 aa  50.8  0.00003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2728  carbamoyl phosphate synthase large subunit  22.89 
 
 		 1077 aa  50.8  0.00003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.523784  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3202  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  26.35 
 
 		 1079 aa  50.8  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0283  carbamoyl phosphate synthase large subunit  24.6 
 
 		 1053 aa  50.8  0.00003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.85267 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0363  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  23.75 
 
 		 1099 aa  50.8  0.00003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.948928  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3074  carbamoyl phosphate synthase large subunit  23.41 
 
 		 1073 aa  50.4  0.00004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.581012  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3085  carbamoyl-phosphate synthase large subunit  27.89 
 
 		 1076 aa  50.4  0.00004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0783  carbamoyl phosphate synthase large subunit  24.19 
 
 		 1077 aa  50.4  0.00004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.523621  normal  0.328934 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0754  protein of unknown function DUF201  24.55 
 
 		 409 aa  50.4  0.00004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3582  carbamoyl phosphate synthase large subunit  24.19 
 
 		 1077 aa  50.4  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3453  carbamoyl phosphate synthase large subunit  24.19 
 
 		 1077 aa  50.4  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.755127  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0319  carbamoyl phosphate synthase large subunit  30.41 
 
 		 1084 aa  50.4  0.00004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0327  carbamoyl phosphate synthase large subunit  27.27 
 
 		 1089 aa  50.1  0.00005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1052  carbamoyl phosphate synthase large subunit  22.77 
 
 		 1074 aa  50.1  0.00005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000022294 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3525  carbamoyl phosphate synthase large subunit  22.77 
 
 		 1074 aa  50.1  0.00005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3400  carbamoyl phosphate synthase large subunit  22.77 
 
 		 1074 aa  50.1  0.00006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3018  carbamoyl-phosphate synthase large subunit  25 
 
 		 1074 aa  49.7  0.00006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2618  carbamoylphosphate synthase large subunit (split gene in MJ)-like  24.42 
 
 		 387 aa  50.1  0.00006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3304  carbamoyl phosphate synthase large subunit  22.77 
 
 		 1074 aa  50.1  0.00006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>