55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_0533 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009802  CCC13826_0533  carbamoyl phosphate synthase-like protein  100 
 
 		 336 aa  681    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1520  carbamoyl phosphate synthase-like protein  32.29 
 
 		 327 aa  156  6e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1133  protein of unknown function DUF201  29.66 
 
 		 342 aa  142  6e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2623  hypothetical protein  27.81 
 
 		 341 aa  122  8e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0421  hypothetical protein  32.96 
 
 		 321 aa  116  6e-25  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0385  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.88 
 
 		 677 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4563  carbamoyl phosphate synthase-like protein  27.08 
 
 		 330 aa  104  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.146127  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0753  carbamoyl phosphate synthase-like protein  27.83 
 
 		 326 aa  103  3e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.564232 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1462  protein of unknown function DUF201  26.67 
 
 		 318 aa  94.4  2e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.127358  normal  0.969827 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1972  hypothetical protein  24.72 
 
 		 349 aa  92.4  9e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3255  protein of unknown function DUF201  27.08 
 
 		 327 aa  89.7  7e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2484  carbamoyl phosphate synthase-like protein  25.78 
 
 		 354 aa  88.2  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.834927  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4794  protein of unknown function DUF201  24.04 
 
 		 337 aa  84.7  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1774  hypothetical protein  23.74 
 
 		 312 aa  84  0.000000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0588  carbamoyl phosphate synthase-like protein  26.86 
 
 		 320 aa  84.3  0.000000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0481  protein of unknown function DUF201  26.89 
 
 		 375 aa  84.3  0.000000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1270  protein of unknown function DUF201  23.89 
 
 		 322 aa  79.3  0.00000000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.462862 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22630  biotin carboxylase  24.7 
 
 		 333 aa  75.9  0.0000000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.405302 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3289  protein of unknown function DUF201  24.76 
 
 		 361 aa  75.5  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0509227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2522  carbamoyl phosphate synthase-like protein  24.74 
 
 		 322 aa  72.4  0.00000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000809265 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1935  carbamoyl phosphate synthase-like protein  23.96 
 
 		 324 aa  71.2  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0836  protein of unknown function DUF201  25.71 
 
 		 351 aa  67.4  0.0000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.532579  normal  0.0458825 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3212  protein of unknown function DUF201  23.15 
 
 		 322 aa  65.5  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0098  protein of unknown function DUF201  19.01 
 
 		 334 aa  56.6  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2002  argininosuccinate lyase  26.34 
 
 		 900 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.848902  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2158  argininosuccinate lyase  26.34 
 
 		 914 aa  55.8  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2392  putative carbamoylphosphate synthase large subunit short form  23.13 
 
 		 428 aa  55.5  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000165669  hitchhiker  0.0000484341 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3496  D-alanine--D-alanine ligase  25 
 
 		 301 aa  54.3  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.303259  normal  0.188396 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2022  argininosuccinate lyase  25.95 
 
 		 900 aa  53.1  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.10658  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1919  hypothetical protein  23.58 
 
 		 284 aa  53.1  0.000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.57396 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6289  hypothetical protein  23.6 
 
 		 325 aa  50.8  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3820  carbamoyl phosphate synthase-like protein  23.66 
 
 		 343 aa  50.8  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.937743  normal  0.217924 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2374  carbamoyl phosphate synthase large subunit  25.53 
 
 		 1071 aa  48.5  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.128175  normal  0.572238 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1700  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  26.14 
 
 		 1496 aa  48.5  0.0002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2435  D-alanine--D-alanine ligase  26.75 
 
 		 304 aa  48.1  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.470821  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2390  D-alanine--D-alanine ligase  27.67 
 
 		 304 aa  48.1  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.593473  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2356  D-alanine--D-alanine ligase  27.67 
 
 		 304 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2610  D-alanine--D-alanine ligase  26.75 
 
 		 304 aa  48.1  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.5132  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5241  hypothetical protein  18.56 
 
 		 429 aa  48.5  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0582778  normal  0.347235 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2628  D-alanine--D-alanine ligase  26.75 
 
 		 304 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.292335  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2666  D-alanine--D-alanine ligase  26.75 
 
 		 304 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.555621  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2741  D-alanine--D-alanine ligase  26.11 
 
 		 304 aa  47  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.199895  hitchhiker  0.00000666317 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2582  D-alanine--D-alanine ligase  26.11 
 
 		 304 aa  46.6  0.0006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0925  carbamoyl phosphate synthase large subunit  25.89 
 
 		 939 aa  46.2  0.0008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.49458  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2456  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  24.44 
 
 		 1096 aa  45.8  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0637  hypothetical protein  21.01 
 
 		 484 aa  45.4  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.110504  normal  0.0645726 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2627  D-alanine--D-alanine ligase  27.04 
 
 		 304 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000105454 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2524  D-alanine--D-alanine ligase  28.85 
 
 		 311 aa  45.8  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0109792  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4658  hypothetical protein  24.09 
 
 		 339 aa  44.3  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.601408 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0316  lysine biosynthesis enzyme LysX  36.71 
 
 		 282 aa  44.3  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2230  carbamoyl phosphate synthase large subunit  44.9 
 
 		 1107 aa  43.9  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.497608  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1664  D-alanine--D-lactate ligase  26.11 
 
 		 341 aa  43.5  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0872  carbamoyl phosphate synthase large subunit  25.71 
 
 		 1075 aa  43.5  0.005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3296  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  24.65 
 
 		 1074 aa  43.1  0.006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1151  lysine biosynthesis enzyme LysX  39.34 
 
 		 292 aa  42.7  0.009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.492268  normal  0.326079 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>