32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_1935 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_1935  carbamoyl phosphate synthase-like protein  100 
 
 		 324 aa  664    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3255  protein of unknown function DUF201  39.04 
 
 		 327 aa  206  5e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0753  carbamoyl phosphate synthase-like protein  32.2 
 
 		 326 aa  154  2e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.564232 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0588  carbamoyl phosphate synthase-like protein  33.54 
 
 		 320 aa  154  2e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1774  hypothetical protein  33.44 
 
 		 312 aa  135  8e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3820  carbamoyl phosphate synthase-like protein  34.81 
 
 		 343 aa  131  1.0000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.937743  normal  0.217924 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2522  carbamoyl phosphate synthase-like protein  27.03 
 
 		 322 aa  111  2.0000000000000002e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000809265 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0421  hypothetical protein  25.48 
 
 		 321 aa  107  4e-22  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4794  protein of unknown function DUF201  33.09 
 
 		 337 aa  102  7e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2484  carbamoyl phosphate synthase-like protein  28.31 
 
 		 354 aa  98.6  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.834927  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1462  protein of unknown function DUF201  31.03 
 
 		 318 aa  97.1  3e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.127358  normal  0.969827 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22630  biotin carboxylase  30.88 
 
 		 333 aa  94.7  2e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.405302 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0098  protein of unknown function DUF201  30.23 
 
 		 334 aa  89.7  6e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1270  protein of unknown function DUF201  31.43 
 
 		 322 aa  82.4  0.00000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.462862 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3212  protein of unknown function DUF201  23.71 
 
 		 322 aa  76.3  0.0000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1520  carbamoyl phosphate synthase-like protein  24.03 
 
 		 327 aa  71.2  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0533  carbamoyl phosphate synthase-like protein  23.96 
 
 		 336 aa  71.2  0.00000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0385  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.59 
 
 		 677 aa  70.9  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5257  protein of unknown function DUF201  26.52 
 
 		 363 aa  69.7  0.00000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4563  carbamoyl phosphate synthase-like protein  27.65 
 
 		 330 aa  64.3  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.146127  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3857  protein of unknown function DUF201  26.52 
 
 		 430 aa  63.9  0.000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.214933 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4702  protein of unknown function DUF201  26.88 
 
 		 346 aa  63.5  0.000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0701331  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0637  hypothetical protein  25.56 
 
 		 484 aa  60.8  0.00000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.110504  normal  0.0645726 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0481  protein of unknown function DUF201  27.44 
 
 		 375 aa  57.4  0.0000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0836  protein of unknown function DUF201  23.15 
 
 		 351 aa  55.5  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.532579  normal  0.0458825 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3289  protein of unknown function DUF201  26.89 
 
 		 361 aa  54.3  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0509227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6289  hypothetical protein  24.35 
 
 		 325 aa  50.4  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3434  ATP-grasp protein-like protein  26.58 
 
 		 439 aa  47.8  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1133  protein of unknown function DUF201  21.68 
 
 		 342 aa  47  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2016  ATP-grasp protein-like protein  25.97 
 
 		 427 aa  47  0.0005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.943806 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4658  hypothetical protein  22.68 
 
 		 339 aa  42.7  0.009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.601408 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1350  ATP-grasp protein-like protein  24.23 
 
 		 440 aa  42.4  0.01  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>