116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4702 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_4702  protein of unknown function DUF201  100 
 
 		 346 aa  657    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0701331  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0637  hypothetical protein  51.29 
 
 		 484 aa  242  6e-63  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.110504  normal  0.0645726 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6289  hypothetical protein  40.25 
 
 		 325 aa  172  5e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22630  biotin carboxylase  41.85 
 
 		 333 aa  170  3e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.405302 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1270  protein of unknown function DUF201  40 
 
 		 322 aa  157  3e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.462862 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4794  protein of unknown function DUF201  39.43 
 
 		 337 aa  149  8e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0421  hypothetical protein  26.13 
 
 		 321 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3289  protein of unknown function DUF201  35.84 
 
 		 361 aa  142  7e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0509227  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0753  carbamoyl phosphate synthase-like protein  25 
 
 		 326 aa  131  2.0000000000000002e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.564232 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3255  protein of unknown function DUF201  28.35 
 
 		 327 aa  124  3e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1462  protein of unknown function DUF201  29.81 
 
 		 318 aa  118  1.9999999999999998e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.127358  normal  0.969827 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3820  carbamoyl phosphate synthase-like protein  30.63 
 
 		 343 aa  111  2.0000000000000002e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.937743  normal  0.217924 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1774  hypothetical protein  30.54 
 
 		 312 aa  108  1e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0481  protein of unknown function DUF201  27.48 
 
 		 375 aa  106  7e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0588  carbamoyl phosphate synthase-like protein  25.52 
 
 		 320 aa  100  3e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3212  protein of unknown function DUF201  26.07 
 
 		 322 aa  94  4e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2522  carbamoyl phosphate synthase-like protein  22.91 
 
 		 322 aa  88.6  1e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000809265 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1133  protein of unknown function DUF201  23.66 
 
 		 342 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2484  carbamoyl phosphate synthase-like protein  27.82 
 
 		 354 aa  82.4  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.834927  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1919  hypothetical protein  28.23 
 
 		 284 aa  81.3  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.57396 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0836  protein of unknown function DUF201  22.62 
 
 		 351 aa  79.7  0.00000000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.532579  normal  0.0458825 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19040  carbamoylphosphate synthase large subunit  33.33 
 
 		 291 aa  79  0.0000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.327123  normal  0.127791 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1935  carbamoyl phosphate synthase-like protein  27.38 
 
 		 324 aa  78.2  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4563  carbamoyl phosphate synthase-like protein  25.24 
 
 		 330 aa  77  0.0000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.146127  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0098  protein of unknown function DUF201  27.44 
 
 		 334 aa  75.9  0.0000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5257  protein of unknown function DUF201  31.16 
 
 		 363 aa  65.5  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2536  protein of unknown function DUF201  29.71 
 
 		 359 aa  62.8  0.000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.505707  normal  0.139385 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2623  hypothetical protein  27.24 
 
 		 341 aa  62.8  0.000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3017  hypothetical protein  20.98 
 
 		 360 aa  62  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0773038  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3002  hypothetical protein  20.38 
 
 		 387 aa  62.4  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2939  hypothetical protein  19.75 
 
 		 387 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2958  hypothetical protein  22.03 
 
 		 387 aa  61.6  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0760444  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3248  hypothetical protein  20.98 
 
 		 387 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2263  putative biotin carboxylase/biotin carboxyl carrier protein  27.3 
 
 		 661 aa  60.5  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1972  hypothetical protein  27.74 
 
 		 349 aa  59.3  0.00000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1000  phosphoribosylamine--glycine ligase  34.01 
 
 		 430 aa  59.3  0.00000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.14412  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2618  carbamoylphosphate synthase large subunit (split gene in MJ)-like  19.12 
 
 		 387 aa  58.2  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0668  ATP-grasp protein-like protein  28.43 
 
 		 393 aa  58.2  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0373  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  28.33 
 
 		 1075 aa  57.8  0.0000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3192  argininosuccinate lyase  30.65 
 
 		 924 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.655648  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1520  carbamoyl phosphate synthase-like protein  20.83 
 
 		 327 aa  56.6  0.0000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0579  ATP-grasp enzyme-like protein  24.11 
 
 		 339 aa  56.2  0.0000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2815  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  28.7 
 
 		 654 aa  55.8  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.102576  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1396  argininosuccinate lyase  30.4 
 
 		 926 aa  55.8  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0342  protein of unknown function DUF201  32.16 
 
 		 302 aa  55.8  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26670  putative biotin carboxylase/biotin carboxyl carrier protein  26.69 
 
 		 661 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.795664  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2122  argininosuccinate lyase  31.19 
 
 		 894 aa  55.1  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1620  argininosuccinate lyase  30.88 
 
 		 896 aa  54.3  0.000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2646  argininosuccinate lyase  29.92 
 
 		 904 aa  54.3  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2560  argininosuccinate lyase  29.92 
 
 		 904 aa  54.3  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2507  argininosuccinate lyase  29.69 
 
 		 912 aa  53.5  0.000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3950  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  25 
 
 		 653 aa  52.8  0.000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.13606  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5241  hypothetical protein  29.93 
 
 		 429 aa  52.8  0.000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0582778  normal  0.347235 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1971  argininosuccinate lyase  31.19 
 
 		 891 aa  52.4  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0385  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.69 
 
 		 677 aa  52  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3856  hypothetical protein  21.41 
 
 		 458 aa  51.6  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.930196 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1386  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  31.61 
 
 		 752 aa  51.2  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4257  hypothetical protein  26.41 
 
 		 429 aa  50.8  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.845129  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0197  hypothetical protein  25.84 
 
 		 391 aa  50.4  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1684  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  25.83 
 
 		 1071 aa  50.4  0.00004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000705985  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2316  phosphoribosylamine/glycine ligase  28.21 
 
 		 446 aa  50.8  0.00004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.306508 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4985  hypothetical protein  26.8 
 
 		 395 aa  50.1  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.076001  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0533  carbamoyl phosphate synthase-like protein  20.86 
 
 		 336 aa  50.1  0.00006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2694  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  24.32 
 
 		 661 aa  49.7  0.00007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.250479  normal  0.322946 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0840  phosphoribosylamine--glycine ligase  36.21 
 
 		 427 aa  49.7  0.00007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.464676 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0684  protein of unknown function DUF201  26.52 
 
 		 356 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.401732 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2392  putative carbamoylphosphate synthase large subunit short form  22.51 
 
 		 428 aa  48.5  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000165669  hitchhiker  0.0000484341 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0559  carbamoyl phosphate synthase large subunit  23.93 
 
 		 1059 aa  48.5  0.0002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1404  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  29.66 
 
 		 733 aa  48.1  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000354677 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1350  ATP-grasp protein-like protein  26.67 
 
 		 440 aa  48.5  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2987  phosphoribosylglycinamide synthetase  24.33 
 
 		 410 aa  47.4  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.0000000000875543  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6358  carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP- binding protein  30.23 
 
 		 667 aa  47.4  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.188022  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3047  hypothetical protein  27.31 
 
 		 439 aa  47  0.0005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.836021  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1401  protein of unknown function DUF201  25.31 
 
 		 409 aa  47  0.0005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2359  phosphoribosylamine--glycine ligase  30.71 
 
 		 430 aa  47  0.0005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.110333 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2209  CarB family protein  28.75 
 
 		 543 aa  46.6  0.0006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.304362  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4090  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  29.81 
 
 		 660 aa  46.6  0.0006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.734303  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3200  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  26.71 
 
 		 664 aa  46.6  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0237038  normal  0.361734 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0662  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  24.89 
 
 		 1072 aa  46.6  0.0007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0506  phosphoribosylamine/glycine ligase  27.37 
 
 		 430 aa  46.6  0.0007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.437456  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0434  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  27.47 
 
 		 659 aa  46.2  0.0008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.321717 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0724  protein of unknown function DUF201  23.43 
 
 		 356 aa  45.8  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.255037  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0146  hypothetical protein  24.47 
 
 		 382 aa  45.1  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1787  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  27.67 
 
 		 621 aa  45.1  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1528  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  34.1 
 
 		 734 aa  44.7  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.890646  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0319  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  24.61 
 
 		 689 aa  45.1  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2980  phosphoribosylamine/glycine ligase  25.93 
 
 		 430 aa  44.7  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0711  hypothetical protein  23.43 
 
 		 356 aa  44.7  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.283238 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0759  hypothetical protein  31.25 
 
 		 391 aa  44.3  0.003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.227198 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0371  hypothetical protein  21.94 
 
 		 290 aa  44.3  0.003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000731332  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0632  carbamoyl phosphate synthase large subunit  25.54 
 
 		 1120 aa  44.3  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.298922  normal  0.175677 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3204  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  28.86 
 
 		 1042 aa  44.3  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.610402  normal  0.762296 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2340  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  32.39 
 
 		 1110 aa  44.7  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1378  carbamoyl phosphate synthase large subunit  22.37 
 
 		 1075 aa  44.3  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14410  carbamoylphosphate synthase large subunit  24.48 
 
 		 423 aa  44.3  0.003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3531  hypothetical protein  26.19 
 
 		 397 aa  44.3  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2265  5-formaminoimidazole-4-carboxamide-1-(beta)-D- ribofuranosyl 5'-monophosphate synthetase  26.06 
 
 		 335 aa  43.9  0.004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0561077  normal  0.0630751 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3857  protein of unknown function DUF201  24.53 
 
 		 430 aa  43.9  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.214933 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2200  ATP-grasp protein-like protein  22.58 
 
 		 390 aa  43.9  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3379  phosphoribosylamine--glycine ligase  33.33 
 
 		 414 aa  43.5  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.104647 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>