70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_19040 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_19040  carbamoylphosphate synthase large subunit  100 
 
 		 291 aa  570  1e-161  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.327123  normal  0.127791 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1919  hypothetical protein  40.68 
 
 		 284 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.57396 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0342  protein of unknown function DUF201  40.96 
 
 		 302 aa  159  8e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0637  hypothetical protein  38.89 
 
 		 484 aa  89.4  7e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.110504  normal  0.0645726 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22630  biotin carboxylase  33.69 
 
 		 333 aa  83.6  0.000000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.405302 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0421  hypothetical protein  23.69 
 
 		 321 aa  82.8  0.000000000000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1270  protein of unknown function DUF201  33.21 
 
 		 322 aa  81.3  0.00000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.462862 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4702  protein of unknown function DUF201  33.57 
 
 		 346 aa  72.8  0.000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0701331  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6289  hypothetical protein  33.5 
 
 		 325 aa  72.8  0.000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3289  protein of unknown function DUF201  32.06 
 
 		 361 aa  70.1  0.00000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0509227  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4794  protein of unknown function DUF201  29.24 
 
 		 337 aa  70.1  0.00000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0753  carbamoyl phosphate synthase-like protein  24.66 
 
 		 326 aa  66.2  0.0000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.564232 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2623  hypothetical protein  27.27 
 
 		 341 aa  65.1  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4563  carbamoyl phosphate synthase-like protein  28.15 
 
 		 330 aa  63.5  0.000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.146127  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3255  protein of unknown function DUF201  29.74 
 
 		 327 aa  62.8  0.000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0836  protein of unknown function DUF201  26.55 
 
 		 351 aa  62  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.532579  normal  0.0458825 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0481  protein of unknown function DUF201  28.51 
 
 		 375 aa  58.2  0.0000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2522  carbamoyl phosphate synthase-like protein  22.46 
 
 		 322 aa  53.1  0.000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000809265 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02450  Glutathione synthase  26.88 
 
 		 292 aa  49.7  0.00005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0385  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.21 
 
 		 677 aa  49.7  0.00006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0588  carbamoyl phosphate synthase-like protein  24.35 
 
 		 320 aa  49.3  0.00007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2958  hypothetical protein  23.51 
 
 		 387 aa  49.7  0.00007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0760444  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3212  protein of unknown function DUF201  24.11 
 
 		 322 aa  48.9  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2586  cyanophycin synthetase  38.78 
 
 		 856 aa  47.8  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.96396  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1379  bifunctional glutamate--cysteine ligase/glutathione synthetase  30.77 
 
 		 754 aa  48.1  0.0002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.955263  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4856  protein of unknown function DUF201  27.01 
 
 		 396 aa  48.1  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2583  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  30.77 
 
 		 302 aa  47.4  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.549073  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2213  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  30.77 
 
 		 302 aa  47.4  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.262107 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2122  argininosuccinate lyase  26.79 
 
 		 894 aa  47  0.0004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3192  argininosuccinate lyase  26.79 
 
 		 924 aa  47  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.655648  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4040  cyanophycin synthetase  35.78 
 
 		 865 aa  47  0.0004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000142292 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4852  cyanophycin synthetase  31.9 
 
 		 918 aa  46.6  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.744581  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2536  protein of unknown function DUF201  27.51 
 
 		 359 aa  46.6  0.0005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.505707  normal  0.139385 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0670  cyanophycin synthetase  33.96 
 
 		 856 aa  46.2  0.0006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2939  hypothetical protein  22.81 
 
 		 387 aa  46.2  0.0006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5710  cyanophycin synthetase  35.71 
 
 		 875 aa  46.2  0.0006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.011022 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1149  hypothetical protein  21.76 
 
 		 414 aa  46.2  0.0006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1620  argininosuccinate lyase  26.54 
 
 		 896 aa  46.2  0.0007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1396  argininosuccinate lyase  26.54 
 
 		 926 aa  46.2  0.0007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3002  hypothetical protein  22.92 
 
 		 387 aa  45.8  0.0008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3248  hypothetical protein  22.92 
 
 		 387 aa  45.8  0.0008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1971  argininosuccinate lyase  27.75 
 
 		 891 aa  45.8  0.0009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2507  argininosuccinate lyase  25.81 
 
 		 912 aa  45.8  0.0009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3017  hypothetical protein  22.38 
 
 		 360 aa  45.8  0.0009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0773038  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1462  protein of unknown function DUF201  25.58 
 
 		 318 aa  45.1  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.127358  normal  0.969827 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1645  hypothetical protein  21.24 
 
 		 349 aa  45.8  0.001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.428665  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2646  argininosuccinate lyase  26.05 
 
 		 904 aa  44.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37420  biotin carboxylase  26.9 
 
 		 405 aa  45.1  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.442231 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2484  carbamoyl phosphate synthase-like protein  25.64 
 
 		 354 aa  44.7  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.834927  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3820  carbamoyl phosphate synthase-like protein  25.98 
 
 		 343 aa  44.7  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.937743  normal  0.217924 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2560  argininosuccinate lyase  26.05 
 
 		 904 aa  44.3  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1774  hypothetical protein  25.48 
 
 		 312 aa  43.9  0.003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1314  cyanophycin synthetase  34.65 
 
 		 858 aa  44.3  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.098804  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0914  hypothetical protein  20.73 
 
 		 349 aa  43.5  0.004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2392  putative carbamoylphosphate synthase large subunit short form  23.49 
 
 		 428 aa  43.5  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000165669  hitchhiker  0.0000484341 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1965  cyanophycin synthetase  41.94 
 
 		 902 aa  43.5  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.644693  normal  0.187039 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4854  cyanophycin synthetase  49.21 
 
 		 914 aa  43.5  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4989  cyanophycin synthetase  33.66 
 
 		 890 aa  43.9  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.267943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3981  cyanophycin synthetase  33 
 
 		 861 aa  43.5  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0635  cyanophycin synthetase  35.64 
 
 		 861 aa  43.1  0.005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.298111  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0703  cyanophycin synthetase  35.42 
 
 		 856 aa  43.1  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.331658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1298  lysine biosynthesis enzyme LysX  34.44 
 
 		 271 aa  43.1  0.006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.18194  normal  0.20368 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2497  polysaccharide biosynthesis protein CapD  21.35 
 
 		 613 aa  42.7  0.007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.495773  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1871  cyanophycin synthetase  35.29 
 
 		 939 aa  42.4  0.008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1315  hypothetical protein  31.34 
 
 		 307 aa  42.7  0.008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2782  xanthine/uracil/vitamin C permease  28.3 
 
 		 429 aa  42.7  0.008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000148305  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1388  hypothetical protein  23.02 
 
 		 395 aa  42.4  0.009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0314212 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0656  cyanophycin synthetase  35.64 
 
 		 861 aa  42.4  0.009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.271968  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4082  cyanophycin synthetase  37.76 
 
 		 855 aa  42.4  0.01  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.88935 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3969  cyanophycin synthetase  37.76 
 
 		 855 aa  42.4  0.01  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>