More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_22630 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_22630  biotin carboxylase  100 
 
 		 333 aa  645    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.405302 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1270  protein of unknown function DUF201  67.71 
 
 		 322 aa  390  1e-107  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.462862 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4794  protein of unknown function DUF201  49.84 
 
 		 337 aa  273  3e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4702  protein of unknown function DUF201  40.58 
 
 		 346 aa  151  1e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0701331  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0481  protein of unknown function DUF201  33.92 
 
 		 375 aa  144  3e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0421  hypothetical protein  26.56 
 
 		 321 aa  141  9.999999999999999e-33  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0588  carbamoyl phosphate synthase-like protein  32.54 
 
 		 320 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3255  protein of unknown function DUF201  29.49 
 
 		 327 aa  135  9e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3289  protein of unknown function DUF201  35.58 
 
 		 361 aa  124  2e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0509227  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1462  protein of unknown function DUF201  34.24 
 
 		 318 aa  123  4e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.127358  normal  0.969827 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0637  hypothetical protein  35.25 
 
 		 484 aa  122  7e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.110504  normal  0.0645726 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1133  protein of unknown function DUF201  27.36 
 
 		 342 aa  119  7e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0753  carbamoyl phosphate synthase-like protein  27.72 
 
 		 326 aa  119  7e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.564232 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1774  hypothetical protein  29.64 
 
 		 312 aa  119  7e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0836  protein of unknown function DUF201  30.32 
 
 		 351 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.532579  normal  0.0458825 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6289  hypothetical protein  33.56 
 
 		 325 aa  106  7e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4563  carbamoyl phosphate synthase-like protein  30.79 
 
 		 330 aa  103  3e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.146127  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1972  hypothetical protein  29.97 
 
 		 349 aa  102  6e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3212  protein of unknown function DUF201  31.34 
 
 		 322 aa  102  8e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2392  putative carbamoylphosphate synthase large subunit short form  26.56 
 
 		 428 aa  99.8  6e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000165669  hitchhiker  0.0000484341 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3820  carbamoyl phosphate synthase-like protein  30.51 
 
 		 343 aa  97.4  3e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.937743  normal  0.217924 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0098  protein of unknown function DUF201  31.56 
 
 		 334 aa  97.1  4e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1935  carbamoyl phosphate synthase-like protein  31.2 
 
 		 324 aa  94.7  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1520  carbamoyl phosphate synthase-like protein  25.32 
 
 		 327 aa  94  3e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0385  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.68 
 
 		 677 aa  94  3e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2522  carbamoyl phosphate synthase-like protein  23.49 
 
 		 322 aa  93.2  6e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000809265 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2484  carbamoyl phosphate synthase-like protein  27.33 
 
 		 354 aa  90.1  5e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.834927  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3857  protein of unknown function DUF201  34.76 
 
 		 430 aa  88.2  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.214933 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1919  hypothetical protein  27.57 
 
 		 284 aa  87.4  3e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.57396 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19040  carbamoylphosphate synthase large subunit  34.16 
 
 		 291 aa  84.7  0.000000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.327123  normal  0.127791 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3434  ATP-grasp protein-like protein  31.27 
 
 		 439 aa  84.3  0.000000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0342  protein of unknown function DUF201  34.63 
 
 		 302 aa  80.9  0.00000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0127  hypothetical protein  27.71 
 
 		 404 aa  80.5  0.00000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4658  hypothetical protein  25.39 
 
 		 339 aa  78.6  0.0000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.601408 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0533  carbamoyl phosphate synthase-like protein  23.53 
 
 		 336 aa  78.6  0.0000000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0933  hypothetical protein  29.45 
 
 		 332 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5257  protein of unknown function DUF201  29.88 
 
 		 363 aa  77.4  0.0000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0801  hypothetical protein  28.73 
 
 		 332 aa  76.6  0.0000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5241  hypothetical protein  34.46 
 
 		 429 aa  75.9  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0582778  normal  0.347235 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3693  protein of unknown function DUF201  31.6 
 
 		 354 aa  73.6  0.000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0184207  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1598  ATP-grasp enzyme-like protein  29.28 
 
 		 383 aa  73.6  0.000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.116073  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2623  hypothetical protein  28.36 
 
 		 341 aa  73.2  0.000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0711  hypothetical protein  30 
 
 		 356 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.283238 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1541  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  28.64 
 
 		 1077 aa  70.5  0.00000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0724  protein of unknown function DUF201  30 
 
 		 356 aa  70.9  0.00000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.255037  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0384  ATP-grasp enzyme-like  25 
 
 		 346 aa  70.5  0.00000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0958371 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1569  hypothetical protein  29.08 
 
 		 412 aa  69.7  0.00000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18730  hypothetical protein  30.36 
 
 		 371 aa  69.3  0.00000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.379343 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0896  hypothetical protein  28.21 
 
 		 335 aa  69.3  0.00000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2618  carbamoylphosphate synthase large subunit (split gene in MJ)-like  22.26 
 
 		 387 aa  69.3  0.00000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1349  ATP-grasp domain protein  30.1 
 
 		 352 aa  68.9  0.0000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.204009  normal  0.65425 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2200  ATP-grasp protein-like protein  26.71 
 
 		 390 aa  68.2  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2881  ATP-grasp protein-like protein  20.23 
 
 		 399 aa  68.2  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000202032  hitchhiker  0.00373255 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2335  hypothetical protein  33 
 
 		 404 aa  67.8  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_11  predicted protein  27.69 
 
 		 1994 aa  67.4  0.0000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3950  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  26.62 
 
 		 653 aa  66.2  0.0000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.13606  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0684  protein of unknown function DUF201  30.29 
 
 		 356 aa  65.5  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.401732 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0661  hypothetical protein  31.02 
 
 		 352 aa  65.1  0.000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.015179  normal  0.248709 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3878  hypothetical protein  30.88 
 
 		 353 aa  64.3  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0188025  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0668  ATP-grasp protein-like protein  27.06 
 
 		 393 aa  63.9  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2070  protein of unknown function DUF201  28.88 
 
 		 355 aa  63.9  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3790  hypothetical protein  38.71 
 
 		 353 aa  63.5  0.000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000713822  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4985  hypothetical protein  30.93 
 
 		 395 aa  63.2  0.000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.076001  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1350  ATP-grasp protein-like protein  27.3 
 
 		 440 aa  62.8  0.000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0421  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  28.28 
 
 		 448 aa  62.8  0.000000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00711  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  25.78 
 
 		 449 aa  62.8  0.000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2016  ATP-grasp protein-like protein  26.67 
 
 		 427 aa  61.2  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.943806 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1287  carbamoyl phosphate synthase large subunit  27.73 
 
 		 1057 aa  61.6  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.867856  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0759  hypothetical protein  26.04 
 
 		 391 aa  61.2  0.00000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.227198 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1423  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  26.41 
 
 		 447 aa  61.6  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02890  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  29.63 
 
 		 1067 aa  61.6  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0189  hypothetical protein  27.65 
 
 		 391 aa  61.2  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1262  carbamoyl phosphate synthase large subunit  27.73 
 
 		 1057 aa  61.6  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0139  hypothetical protein  27.52 
 
 		 410 aa  61.2  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0373  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  29.94 
 
 		 1075 aa  60.8  0.00000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2259  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  26.64 
 
 		 448 aa  60.8  0.00000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.571536  normal  0.652272 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2263  putative biotin carboxylase/biotin carboxyl carrier protein  26.09 
 
 		 661 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2591  pyruvate carboxylase subunit A  27.88 
 
 		 471 aa  60.5  0.00000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00721  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  25 
 
 		 449 aa  59.7  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.249054  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00681  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  26.11 
 
 		 448 aa  59.7  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1700  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  25.11 
 
 		 1496 aa  59.7  0.00000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01241  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  25.91 
 
 		 447 aa  59.3  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.114391  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2484  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  24.45 
 
 		 1063 aa  58.9  0.0000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1643  D-alanine--D-alanine ligase  22.12 
 
 		 298 aa  59.3  0.0000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0062  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  26.58 
 
 		 448 aa  58.5  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03221  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  25.94 
 
 		 448 aa  58.9  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0081  hypothetical protein  24.51 
 
 		 372 aa  57.8  0.0000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2536  protein of unknown function DUF201  32.87 
 
 		 359 aa  57.8  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.505707  normal  0.139385 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3200  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  27.76 
 
 		 664 aa  58.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0237038  normal  0.361734 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26670  putative biotin carboxylase/biotin carboxyl carrier protein  27.17 
 
 		 661 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.795664  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1207  carbamoyl-phosphate synthase large subunit  27.92 
 
 		 1059 aa  58.2  0.0000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0791  biotin carboxylase  30.03 
 
 		 411 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0170  phosphoribosylglycinamide synthetase ATP-grasp domain-containing protein  26.77 
 
 		 407 aa  57.8  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0292  phosphoribosylglycinamide synthetase, ATP-grasp  26.77 
 
 		 407 aa  57.8  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0882  carbamoyl-phosphate synthase large subunit  30.65 
 
 		 1063 aa  57  0.0000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1553  phosphoribosylglycinamide synthetase, ATP-grasp, putative  25.14 
 
 		 267 aa  57  0.0000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06126  Acetyl-CoA carboxylasePutative uncharacterized protein (EC 6.4.1.2); [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:O60033]  28.14 
 
 		 2288 aa  57  0.0000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.353835 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3093  hypothetical protein  30.91 
 
 		 440 aa  57  0.0000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0769  carbamoyl phosphate synthase large subunit  27.56 
 
 		 1057 aa  56.6  0.0000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2807  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  25.68 
 
 		 652 aa  56.6  0.0000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.167198  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>