195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_0791 on replicon NC_009074
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009074  BURPS668_0791  biotin carboxylase  100 
 
 		 411 aa  819    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7724  putative biotin carboxylase  36.76 
 
 		 430 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.211642  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3467  hypothetical protein  32.08 
 
 		 407 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6150  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  29.75 
 
 		 410 aa  123  6e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.639194 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6148  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  32.46 
 
 		 408 aa  117  5e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.631903 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2023  hypothetical protein  30.45 
 
 		 408 aa  114  3e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2026  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  32 
 
 		 423 aa  112  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4524  Biotin carboxylase-like protein  34.04 
 
 		 403 aa  111  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.799309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2607  hypothetical protein  30.56 
 
 		 439 aa  108  2e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.954723 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0202  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  27.87 
 
 		 388 aa  105  1e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.658271  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2846  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain- containing protein  29.64 
 
 		 404 aa  98.2  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.435021  normal  0.117516 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1642  hypothetical protein  25.78 
 
 		 392 aa  94.7  2e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0877  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain-containing protein ATP-grasp  27.06 
 
 		 386 aa  92.4  1e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.656066  normal  0.993359 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0874  nikkomycin biosynthesis domain protein  26.51 
 
 		 417 aa  90.5  5e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3673  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  30.26 
 
 		 407 aa  85.5  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0906  biotin carboxylase-like protein  26.04 
 
 		 386 aa  84.7  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.17944  hitchhiker  0.00104382 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06054  hypothetical protein  25.63 
 
 		 329 aa  83.6  0.000000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4094  biotin carboxylase-like protein  26.13 
 
 		 389 aa  82.8  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.138669  normal  0.680577 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2251  phosphoribosylglycinamide synthetase  26.32 
 
 		 418 aa  77.8  0.0000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000511987 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2328  hypothetical protein  25.78 
 
 		 385 aa  77  0.0000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0754  protein of unknown function DUF201  27.73 
 
 		 409 aa  75.5  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1164  protein of unknown function DUF201  24.74 
 
 		 437 aa  75.1  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0194  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain-containing protein ATP-grasp  28.4 
 
 		 419 aa  74.7  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.296569  normal  0.160479 
 
 
-
 
NC_003296  RS03057  hypothetical protein  27.05 
 
 		 449 aa  73.2  0.000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.450613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0162  hypothetical protein  21.55 
 
 		 414 aa  70.5  0.00000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2020  phosphoribosylglycinamide synthetase  23.1 
 
 		 407 aa  68.6  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0619  phosphoribosylglycinamide synthetase  27.56 
 
 		 410 aa  67.8  0.0000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.241949  hitchhiker  0.00233057 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7725  hypothetical protein  27.16 
 
 		 411 aa  67.8  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.10668  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0875  hypothetical protein  27.08 
 
 		 414 aa  67  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3256  putative carbamoyl-phosphate synthase large chain  22.15 
 
 		 420 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.077916  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0573  phosphoribosylglycinamide synthetase  24.8 
 
 		 420 aa  65.1  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.23534  normal  0.22349 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3245  hypothetical protein  21.81 
 
 		 419 aa  63.9  0.000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.837509  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37420  biotin carboxylase  28.76 
 
 		 405 aa  63.5  0.000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.442231 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1929  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  24.1 
 
 		 411 aa  63.2  0.000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0730  hypothetical protein  25.7 
 
 		 436 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2986  carbamoyl-phosphate synthase large chain  22.15 
 
 		 431 aa  62.8  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.556183  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4069  phosphoribosylglycinamide synthetase ATP-grasp domain-containing protein  25.57 
 
 		 389 aa  62.8  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2158  argininosuccinate lyase  25.19 
 
 		 914 aa  62  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2002  argininosuccinate lyase  25.19 
 
 		 900 aa  62  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.848902  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2144  phosphoribosylglycinamide synthetase  26.29 
 
 		 416 aa  61.2  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0250211 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1724  protein of unknown function DUF201  24.79 
 
 		 401 aa  61.2  0.00000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2022  argininosuccinate lyase  25.19 
 
 		 900 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.10658  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3064  hypothetical protein  26.86 
 
 		 441 aa  60.8  0.00000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000514586 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2148  hypothetical protein  29.44 
 
 		 414 aa  59.7  0.00000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.149546 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2595  putative carbamoyl-phosphate-synthetase  27.43 
 
 		 398 aa  59.7  0.00000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.605395  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3626  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  28.12 
 
 		 432 aa  59.3  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0200  hypothetical protein  23.38 
 
 		 405 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.214933  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2438  hypothetical protein  29.92 
 
 		 410 aa  58.5  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.658373 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3192  argininosuccinate lyase  27.48 
 
 		 924 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.655648  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3748  protein of unknown function DUF201  27.53 
 
 		 388 aa  58.9  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.277412  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1432  hypothetical protein  27.03 
 
 		 424 aa  58.5  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.502147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1119  biotin carboxylase  25.25 
 
 		 411 aa  58.2  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1396  argininosuccinate lyase  27.27 
 
 		 926 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1914  phosphoribosylaminoimidazole carboxylase, ATPase subunit  25.37 
 
 		 387 aa  57.4  0.0000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1514  hypothetical protein  21.78 
 
 		 412 aa  56.6  0.0000007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1401  protein of unknown function DUF201  25.34 
 
 		 409 aa  56.6  0.0000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3501  biotin carboxylase  35.07 
 
 		 159 aa  56.2  0.0000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2646  argininosuccinate lyase  26.89 
 
 		 904 aa  56.2  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2668  phosphoribosylglycinamide synthetase  31.82 
 
 		 415 aa  55.8  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2507  argininosuccinate lyase  26.69 
 
 		 912 aa  55.8  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2560  argininosuccinate lyase  26.87 
 
 		 904 aa  55.8  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1971  argininosuccinate lyase  25.19 
 
 		 891 aa  55.5  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2969  hypothetical protein  24.68 
 
 		 402 aa  53.9  0.000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0875  hypothetical protein  28.86 
 
 		 420 aa  53.9  0.000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.728931 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0006  hypothetical protein  19.64 
 
 		 387 aa  53.5  0.000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3759  protein of unknown function DUF201  28.06 
 
 		 425 aa  53.5  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33390  biotin carboxylase  25.38 
 
 		 428 aa  53.1  0.000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.465269 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3265  hypothetical protein  26.27 
 
 		 412 aa  52.4  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6388  phosphoribosylglycinamide synthetase  28.24 
 
 		 422 aa  52.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.357309  normal  0.160447 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0882  carbamoyl-phosphate synthase large subunit  25.29 
 
 		 1063 aa  52.4  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3468  hypothetical protein  28.43 
 
 		 425 aa  52  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4648  protein of unknown function DUF201  27.67 
 
 		 404 aa  52  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.896666  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0708  phosphoribosylaminoimidazole carboxylase, ATPase subunit  31.58 
 
 		 398 aa  51.6  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2122  argininosuccinate lyase  27.1 
 
 		 894 aa  52.4  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2135  phosphoribosylglycinamide synthetase  27.65 
 
 		 412 aa  52  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.165665  normal  0.504192 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0259  phosphoribosylaminoimidazole carboxylase, ATPase subunit  27.54 
 
 		 371 aa  52  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.982259  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1620  argininosuccinate lyase  26.89 
 
 		 896 aa  51.6  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2737  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  26.38 
 
 		 723 aa  50.8  0.00004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5515  phosphoribosylglycinamide synthetase  29.81 
 
 		 422 aa  51.2  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.330375  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5879  phosphoribosylglycinamide synthetase  29.81 
 
 		 422 aa  51.2  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.521142  normal  0.293972 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2138  carbamoyl phosphate synthase large subunit  24.44 
 
 		 1085 aa  50.4  0.00005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0923584 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6149  hypothetical protein  28.71 
 
 		 441 aa  50.4  0.00006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.669475 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0912  biotin carboxylase-like protein  22.68 
 
 		 410 aa  50.1  0.00007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.527326 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2628  D-alanine--D-alanine ligase  38.82 
 
 		 304 aa  49.7  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.292335  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2390  D-alanine--D-alanine ligase  38.82 
 
 		 304 aa  49.3  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.593473  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2356  D-alanine--D-alanine ligase  38.82 
 
 		 304 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2666  D-alanine--D-alanine ligase  38.82 
 
 		 304 aa  49.7  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.555621  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3660  hypothetical protein  25.29 
 
 		 411 aa  49.3  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.853995  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10931  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  26.32 
 
 		 391 aa  48.9  0.0001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.673369  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1270  protein of unknown function DUF201  31.1 
 
 		 322 aa  48.1  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.462862 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2136  phosphoribosylaminoimidazole carboxylase ATPase subunit  28.99 
 
 		 394 aa  48.5  0.0002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.955707  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6153  protein of unknown function DUF201  25 
 
 		 397 aa  48.5  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.496627  normal  0.0716856 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2440  biotin carboxylase-like  28.52 
 
 		 424 aa  48.5  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.459774  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3469  hypothetical protein  23.32 
 
 		 429 aa  48.5  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0344  phosphoribosylglycinamide synthetase  27.37 
 
 		 424 aa  48.1  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1093  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP- binding  27.08 
 
 		 459 aa  48.5  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0721  hypothetical protein  24.81 
 
 		 402 aa  48.1  0.0003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.446517 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2006  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  23.64 
 
 		 1098 aa  47.8  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.488825  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0755  protein of unknown function DUF201  21.24 
 
 		 398 aa  48.1  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2226  phosphoribosylaminoimidazole carboxylase ATPase subunit  28.99 
 
 		 394 aa  48.1  0.0003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>