131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_0755 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_0755  protein of unknown function DUF201  100 
 
 
398 aa  824    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1270  protein of unknown function DUF201  28 
 
 
399 aa  127  3e-28  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.964812  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2428  protein of unknown function DUF201  29.56 
 
 
402 aa  125  1e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.281403  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2020  phosphoribosylglycinamide synthetase  25.18 
 
 
407 aa  119  6e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2737  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  25.06 
 
 
723 aa  119  9e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2987  phosphoribosylglycinamide synthetase  28.53 
 
 
410 aa  119  9.999999999999999e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.0000000000875543  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0170  phosphoribosylglycinamide synthetase ATP-grasp domain-containing protein  29.64 
 
 
407 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0292  phosphoribosylglycinamide synthetase, ATP-grasp  29.64 
 
 
407 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4069  phosphoribosylglycinamide synthetase ATP-grasp domain-containing protein  26.7 
 
 
389 aa  111  2.0000000000000002e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3759  protein of unknown function DUF201  26.55 
 
 
425 aa  107  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2158  argininosuccinate lyase  25.72 
 
 
914 aa  107  4e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2002  argininosuccinate lyase  25.72 
 
 
900 aa  107  4e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.848902  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2022  argininosuccinate lyase  25.72 
 
 
900 aa  106  9e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.10658  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3245  hypothetical protein  26.56 
 
 
419 aa  100  4e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.837509  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2986  carbamoyl-phosphate synthase large chain  26.4 
 
 
431 aa  99  1e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.556183  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3256  putative carbamoyl-phosphate synthase large chain  27.02 
 
 
420 aa  97.4  4e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.077916  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3192  argininosuccinate lyase  25.78 
 
 
924 aa  96.7  6e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.655648  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4500  Cysteine synthase  23.82 
 
 
756 aa  96.7  7e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.632569  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1396  argininosuccinate lyase  25.63 
 
 
926 aa  95.9  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2646  argininosuccinate lyase  25.35 
 
 
904 aa  94.4  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2507  argininosuccinate lyase  25.27 
 
 
912 aa  94  4e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2560  argininosuccinate lyase  25.35 
 
 
904 aa  94.4  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2122  argininosuccinate lyase  25.14 
 
 
894 aa  90.1  5e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1971  argininosuccinate lyase  28.72 
 
 
891 aa  90.1  6e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1514  hypothetical protein  26 
 
 
412 aa  90.1  6e-17  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1620  argininosuccinate lyase  25.35 
 
 
896 aa  89.4  9e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7725  hypothetical protein  25.42 
 
 
411 aa  89.4  9e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.10668  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0449  putative glycolate oxidase  25.39 
 
 
404 aa  88.2  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2959  phosphoribosylglycinamide synthetase  25.06 
 
 
405 aa  88.2  2e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6153  protein of unknown function DUF201  26.65 
 
 
397 aa  88.6  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.496627  normal  0.0716856 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0754  protein of unknown function DUF201  23.74 
 
 
409 aa  85.9  0.000000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3265  hypothetical protein  24.15 
 
 
412 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4068  hypothetical protein  25.61 
 
 
413 aa  83.6  0.000000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0573  phosphoribosylglycinamide synthetase  25.65 
 
 
420 aa  81.6  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.23534  normal  0.22349 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33390  biotin carboxylase  24.64 
 
 
428 aa  80.1  0.00000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.465269 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2438  hypothetical protein  32.91 
 
 
410 aa  79.3  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.658373 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_37283  predicted protein  26.59 
 
 
1033 aa  79  0.0000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2251  phosphoribosylglycinamide synthetase  24.37 
 
 
418 aa  77.8  0.0000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000511987 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2432  hypothetical protein  25.48 
 
 
430 aa  74.7  0.000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6149  hypothetical protein  26.22 
 
 
441 aa  73.9  0.000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.669475 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1401  protein of unknown function DUF201  23.84 
 
 
409 aa  73.2  0.000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4856  protein of unknown function DUF201  25.22 
 
 
396 aa  72.4  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0194  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain-containing protein ATP-grasp  26.95 
 
 
419 aa  70.5  0.00000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.296569  normal  0.160479 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3093  hypothetical protein  27.36 
 
 
440 aa  70.5  0.00000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0619  phosphoribosylglycinamide synthetase  24.81 
 
 
410 aa  68.2  0.0000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.241949  hitchhiker  0.00233057 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5515  phosphoribosylglycinamide synthetase  23.64 
 
 
422 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.330375  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5879  phosphoribosylglycinamide synthetase  23.64 
 
 
422 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.521142  normal  0.293972 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6388  phosphoribosylglycinamide synthetase  23.18 
 
 
422 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.357309  normal  0.160447 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4648  protein of unknown function DUF201  25.85 
 
 
404 aa  68.2  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.896666  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0721  hypothetical protein  24.52 
 
 
402 aa  67.4  0.0000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.446517 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0200  hypothetical protein  27.47 
 
 
405 aa  66.6  0.0000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.214933  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1553  phosphoribosylglycinamide synthetase, ATP-grasp, putative  24.81 
 
 
267 aa  65.5  0.000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2209  CarB family protein  24.02 
 
 
543 aa  65.1  0.000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.304362  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4786  hypothetical protein  25.18 
 
 
398 aa  65.1  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06063  hypothetical protein  25.47 
 
 
349 aa  65.1  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3626  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  24.51 
 
 
432 aa  65.5  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1432  hypothetical protein  24.79 
 
 
424 aa  64.7  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.502147  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3660  hypothetical protein  29.13 
 
 
411 aa  62.8  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.853995  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0996  phosphoribosylglycinamide synthetase  26.51 
 
 
541 aa  62  0.00000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000037072 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2663  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  21.57 
 
 
413 aa  62  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2148  hypothetical protein  21.11 
 
 
414 aa  60.8  0.00000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.149546 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3748  protein of unknown function DUF201  26.18 
 
 
388 aa  60.1  0.00000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.277412  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1724  protein of unknown function DUF201  22.56 
 
 
401 aa  60.1  0.00000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0416  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.42 
 
 
726 aa  59.7  0.00000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0147603  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1119  biotin carboxylase  25.4 
 
 
411 aa  59.7  0.00000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3136  putative siderophore biosynthesis protein  23.72 
 
 
388 aa  58.9  0.0000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2595  putative carbamoyl-phosphate-synthetase  21.53 
 
 
398 aa  58.5  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.605395  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1164  protein of unknown function DUF201  21.78 
 
 
437 aa  58.9  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6150  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  25.1 
 
 
410 aa  57  0.0000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.639194 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0769  carbamoyl phosphate synthase large subunit  23.16 
 
 
1057 aa  56.6  0.0000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1268  phosphoribosylglycinamide synthetase  22.94 
 
 
400 aa  56.6  0.0000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.584392  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2135  phosphoribosylglycinamide synthetase  23.14 
 
 
412 aa  56.2  0.0000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.165665  normal  0.504192 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3091  PvsA  22.82 
 
 
394 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.324185  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37420  biotin carboxylase  21.66 
 
 
405 aa  56.2  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.442231 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1717  hypothetical protein  24.57 
 
 
468 aa  55.5  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000202258 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0420  D-alanine/D-alanine ligase  30.95 
 
 
299 aa  55.1  0.000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000379989  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01931  vibrioferrin biosynthesis protein PvsA  24.62 
 
 
399 aa  54.3  0.000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09340  hypothetical protein  24.17 
 
 
399 aa  54.7  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.035454  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1007  hypothetical protein  24.77 
 
 
427 aa  54.3  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2440  biotin carboxylase-like  20.66 
 
 
424 aa  54.3  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.459774  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0029  protein of unknown function DUF201  23.93 
 
 
386 aa  54.3  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1498  biotin carboxylase-like  24.43 
 
 
428 aa  53.9  0.000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0418  hypothetical protein  25 
 
 
411 aa  53.5  0.000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0261  carbamoyl-phosphate synthase large subunit  23.45 
 
 
1064 aa  52.4  0.00001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2969  hypothetical protein  25.25 
 
 
402 aa  52.8  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0875  hypothetical protein  26.05 
 
 
414 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0240  hypothetical protein  23.01 
 
 
410 aa  52  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1423  protein of unknown function DUF201  21.26 
 
 
424 aa  52  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.369206  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1518  protein of unknown function DUF201  20.96 
 
 
424 aa  52  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0899  hypothetical protein  21.74 
 
 
406 aa  51.2  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0718  hypothetical protein  21.74 
 
 
406 aa  51.2  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.555879  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0732  hypothetical protein  21.74 
 
 
406 aa  51.2  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2144  phosphoribosylglycinamide synthetase  27.46 
 
 
416 aa  51.2  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0250211 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1388  hypothetical protein  21.88 
 
 
395 aa  50.8  0.00005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0314212 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001066  vibrioferrin ligase/carboxylase protein PvsA  23.41 
 
 
403 aa  50.4  0.00005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0912  biotin carboxylase-like protein  21.79 
 
 
410 aa  50.1  0.00007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.527326 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1642  hypothetical protein  24.29 
 
 
392 aa  49.7  0.00009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0021  hypothetical protein  25.1 
 
 
382 aa  48.5  0.0002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0363  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  24.41 
 
 
1099 aa  48.1  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.948928  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2668  phosphoribosylglycinamide synthetase  22 
 
 
415 aa  48.5  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>