More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_2148 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_2148  hypothetical protein  100 
 
 		 414 aa  835    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.149546 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2663  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  71.84 
 
 		 413 aa  587  1e-166  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2737  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  24.39 
 
 		 723 aa  115  2.0000000000000002e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1119  biotin carboxylase  27.39 
 
 		 411 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1270  protein of unknown function DUF201  29.02 
 
 		 399 aa  108  2e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.964812  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1432  hypothetical protein  30.06 
 
 		 424 aa  104  3e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.502147  normal  1 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2987  phosphoribosylglycinamide synthetase  29.88 
 
 		 410 aa  104  3e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.0000000000875543  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2251  phosphoribosylglycinamide synthetase  26.42 
 
 		 418 aa  103  4e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000511987 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0449  putative glycolate oxidase  26.25 
 
 		 404 aa  101  2e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1518  protein of unknown function DUF201  30.86 
 
 		 424 aa  101  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4648  protein of unknown function DUF201  27.22 
 
 		 404 aa  100  4e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.896666  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1423  protein of unknown function DUF201  30.56 
 
 		 424 aa  99  1e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.369206  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2440  biotin carboxylase-like  30.14 
 
 		 424 aa  98.2  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.459774  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0619  phosphoribosylglycinamide synthetase  28.46 
 
 		 410 aa  97.8  3e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.241949  hitchhiker  0.00233057 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0573  phosphoribosylglycinamide synthetase  29.41 
 
 		 420 aa  96.3  1e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.23534  normal  0.22349 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2428  protein of unknown function DUF201  25.07 
 
 		 402 aa  95.9  1e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.281403  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1164  protein of unknown function DUF201  24.78 
 
 		 437 aa  94  4e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5090  hypothetical protein  28.51 
 
 		 453 aa  91.3  3e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5770  hypothetical protein  28.51 
 
 		 453 aa  91.3  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0282385 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2209  CarB family protein  24.81 
 
 		 543 aa  90.1  6e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.304362  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0418  hypothetical protein  31.85 
 
 		 411 aa  89.4  1e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3626  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  27.71 
 
 		 432 aa  88.2  2e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1724  protein of unknown function DUF201  25.78 
 
 		 401 aa  87  5e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1388  hypothetical protein  25.86 
 
 		 395 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0314212 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0875  hypothetical protein  29.31 
 
 		 420 aa  85.1  0.000000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.728931 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4500  Cysteine synthase  26.7 
 
 		 756 aa  84  0.000000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.632569  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7725  hypothetical protein  30.15 
 
 		 411 aa  84  0.000000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.10668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2959  phosphoribosylglycinamide synthetase  21.96 
 
 		 405 aa  83.6  0.000000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2144  phosphoribosylglycinamide synthetase  27.84 
 
 		 416 aa  83.2  0.000000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0250211 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0170  phosphoribosylglycinamide synthetase ATP-grasp domain-containing protein  24.82 
 
 		 407 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0292  phosphoribosylglycinamide synthetase, ATP-grasp  24.82 
 
 		 407 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37420  biotin carboxylase  28.45 
 
 		 405 aa  80.9  0.00000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.442231 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3265  hypothetical protein  23.86 
 
 		 412 aa  79  0.0000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1929  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  25.78 
 
 		 411 aa  79  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6153  protein of unknown function DUF201  28.47 
 
 		 397 aa  77.4  0.0000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.496627  normal  0.0716856 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0755  protein of unknown function DUF201  21.11 
 
 		 398 aa  75.9  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1401  protein of unknown function DUF201  24.7 
 
 		 409 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3748  protein of unknown function DUF201  30.21 
 
 		 388 aa  70.1  0.00000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.277412  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3242  hypothetical protein  26.58 
 
 		 432 aa  70.5  0.00000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1514  hypothetical protein  26.02 
 
 		 412 aa  70.1  0.00000000007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0791  biotin carboxylase  28.98 
 
 		 411 aa  70.1  0.00000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1472  D-alanine--D-alanine ligase  30.09 
 
 		 326 aa  70.1  0.00000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.269509  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2986  carbamoyl-phosphate synthase large chain  21.7 
 
 		 431 aa  69.7  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.556183  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0177  hypothetical protein  23.11 
 
 		 411 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2020  phosphoribosylglycinamide synthetase  26.3 
 
 		 407 aa  68.9  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6150  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  26.15 
 
 		 410 aa  69.3  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.639194 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2438  hypothetical protein  28.9 
 
 		 410 aa  68.2  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.658373 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33390  biotin carboxylase  23.19 
 
 		 428 aa  68.2  0.0000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.465269 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2595  putative carbamoyl-phosphate-synthetase  25.97 
 
 		 398 aa  67.8  0.0000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.605395  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3759  protein of unknown function DUF201  27.52 
 
 		 425 aa  67.8  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4142  hypothetical protein  26.56 
 
 		 414 aa  66.6  0.0000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.16964  normal  0.023954 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0072  hypothetical protein  26.56 
 
 		 414 aa  66.6  0.0000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2668  phosphoribosylglycinamide synthetase  25.38 
 
 		 415 aa  66.6  0.0000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03057  hypothetical protein  29.8 
 
 		 449 aa  65.5  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.450613  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3093  hypothetical protein  26.72 
 
 		 440 aa  65.1  0.000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0194  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain-containing protein ATP-grasp  26.67 
 
 		 419 aa  64.7  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.296569  normal  0.160479 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4090  hypothetical protein  26.25 
 
 		 414 aa  64.7  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.572464  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1268  phosphoribosylglycinamide synthetase  17.99 
 
 		 400 aa  63.9  0.000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.584392  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5518  phosphoribosylglycinamide synthetase  26.09 
 
 		 403 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.398662  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5882  phosphoribosylglycinamide synthetase  26.09 
 
 		 403 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.47867 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3673  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  25.31 
 
 		 407 aa  63.2  0.000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3668  D-alanine--D-alanine ligase  29.2 
 
 		 332 aa  63.2  0.000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.497942  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2978  D-alanine--D-alanine ligase  28.32 
 
 		 332 aa  62.8  0.00000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00577366  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6391  phosphoribosylglycinamide synthetase  26.12 
 
 		 403 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.782672  normal  0.167257 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3245  hypothetical protein  21.33 
 
 		 419 aa  61.2  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.837509  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0730  hypothetical protein  24.52 
 
 		 436 aa  60.8  0.00000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2002  argininosuccinate lyase  29.28 
 
 		 900 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.848902  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2158  argininosuccinate lyase  29.28 
 
 		 914 aa  60.8  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6149  hypothetical protein  28.78 
 
 		 441 aa  60.5  0.00000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.669475 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4068  hypothetical protein  25.51 
 
 		 413 aa  60.5  0.00000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2022  argininosuccinate lyase  29.28 
 
 		 900 aa  60.1  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.10658  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0912  biotin carboxylase-like protein  30.94 
 
 		 410 aa  59.7  0.00000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.527326 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3192  argininosuccinate lyase  25.49 
 
 		 924 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.655648  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0754  protein of unknown function DUF201  23.81 
 
 		 409 aa  58.5  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1396  argininosuccinate lyase  25.29 
 
 		 926 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3256  putative carbamoyl-phosphate synthase large chain  20.22 
 
 		 420 aa  57.4  0.0000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.077916  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0416  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.26 
 
 		 726 aa  57  0.0000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0147603  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2560  argininosuccinate lyase  24.9 
 
 		 904 aa  57  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4069  phosphoribosylglycinamide synthetase ATP-grasp domain-containing protein  25.21 
 
 		 389 aa  56.6  0.0000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2507  argininosuccinate lyase  24.54 
 
 		 912 aa  56.2  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2646  argininosuccinate lyase  24.62 
 
 		 904 aa  56.2  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0344  phosphoribosylglycinamide synthetase  25.65 
 
 		 424 aa  56.2  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0985  carbamoyl phosphate synthase large subunit  26.42 
 
 		 1106 aa  56.2  0.000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.557617  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2162  hypothetical protein  24.24 
 
 		 414 aa  55.8  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.337945  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0823  D-alanine--D-alanine ligase  27.31 
 
 		 334 aa  55.8  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.595745 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2023  hypothetical protein  25.1 
 
 		 408 aa  55.1  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2808  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  26.51 
 
 		 1097 aa  54.7  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2135  phosphoribosylglycinamide synthetase  27.54 
 
 		 412 aa  55.1  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.165665  normal  0.504192 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6148  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  25.53 
 
 		 408 aa  54.7  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.631903 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3012  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  26.64 
 
 		 1107 aa  54.3  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.541011  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2122  argininosuccinate lyase  25.49 
 
 		 894 aa  54.3  0.000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12690  carbamoyl-phosphate synthase large subunit  27.83 
 
 		 1118 aa  53.9  0.000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0359466  normal  0.0639836 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0433  hypothetical protein  21.82 
 
 		 426 aa  53.9  0.000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1620  argininosuccinate lyase  25.29 
 
 		 896 aa  53.5  0.000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001066  vibrioferrin ligase/carboxylase protein PvsA  25.29 
 
 		 403 aa  53.5  0.000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3467  hypothetical protein  31.82 
 
 		 407 aa  53.5  0.000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0438  carbamoyl phosphate synthase large subunit  26.97 
 
 		 1110 aa  53.1  0.000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.561352  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0996  phosphoribosylglycinamide synthetase  23.04 
 
 		 541 aa  52.8  0.00001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000037072 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1971  argininosuccinate lyase  23.64 
 
 		 891 aa  52.8  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1253  hypothetical protein  23.11 
 
 		 444 aa  52.4  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.325224 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>