More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_6150 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_6150  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  100 
 
 		 410 aa  853    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.639194 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6148  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  35.54 
 
 		 408 aa  251  1e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.631903 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2023  hypothetical protein  35.51 
 
 		 408 aa  248  2e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7724  putative biotin carboxylase  30.05 
 
 		 430 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.211642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0791  biotin carboxylase  33.46 
 
 		 411 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2846  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain- containing protein  25.8 
 
 		 404 aa  99.8  8e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.435021  normal  0.117516 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3673  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  26.59 
 
 		 407 aa  94.7  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2026  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  25.47 
 
 		 423 aa  89.4  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4524  Biotin carboxylase-like protein  28.02 
 
 		 403 aa  84.3  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.799309  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0874  nikkomycin biosynthesis domain protein  26.32 
 
 		 417 aa  80.5  0.00000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0875  hypothetical protein  24.81 
 
 		 414 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2020  phosphoribosylglycinamide synthetase  26.95 
 
 		 407 aa  79.3  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3467  hypothetical protein  24.28 
 
 		 407 aa  77  0.0000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2607  hypothetical protein  26.37 
 
 		 439 aa  76.3  0.000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.954723 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0875  hypothetical protein  25.35 
 
 		 420 aa  73.6  0.000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.728931 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2668  phosphoribosylglycinamide synthetase  26.67 
 
 		 415 aa  73.2  0.000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3759  protein of unknown function DUF201  25.39 
 
 		 425 aa  73.2  0.000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06054  hypothetical protein  27.18 
 
 		 329 aa  71.6  0.00000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0162  hypothetical protein  24.29 
 
 		 414 aa  70.5  0.00000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0202  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  28.06 
 
 		 388 aa  64.7  0.000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.658271  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0619  phosphoribosylglycinamide synthetase  27.33 
 
 		 410 aa  63.9  0.000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.241949  hitchhiker  0.00233057 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2162  hypothetical protein  28.92 
 
 		 414 aa  62.8  0.00000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.337945  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2144  phosphoribosylglycinamide synthetase  25.55 
 
 		 416 aa  62.8  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0250211 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2135  phosphoribosylglycinamide synthetase  26.26 
 
 		 412 aa  61.6  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.165665  normal  0.504192 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0906  biotin carboxylase-like protein  28.36 
 
 		 386 aa  61.6  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.17944  hitchhiker  0.00104382 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2251  phosphoribosylglycinamide synthetase  31.1 
 
 		 418 aa  62  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000511987 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2148  hypothetical protein  25.38 
 
 		 414 aa  61.2  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.149546 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1164  protein of unknown function DUF201  23.93 
 
 		 437 aa  60.8  0.00000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2328  hypothetical protein  27.21 
 
 		 385 aa  59.3  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6149  hypothetical protein  25.17 
 
 		 441 aa  58.5  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.669475 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4094  biotin carboxylase-like protein  30.72 
 
 		 389 aa  58.5  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.138669  normal  0.680577 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2524  D-alanine--D-alanine ligase  30.82 
 
 		 311 aa  58.5  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0109792  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2627  D-alanine--D-alanine ligase  34.55 
 
 		 304 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000105454 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4069  phosphoribosylglycinamide synthetase ATP-grasp domain-containing protein  23.53 
 
 		 389 aa  58.9  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2741  D-alanine--D-alanine ligase  34.45 
 
 		 304 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.199895  hitchhiker  0.00000666317 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2435  D-alanine--D-alanine ligase  34.55 
 
 		 304 aa  58.2  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.470821  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2610  D-alanine--D-alanine ligase  34.55 
 
 		 304 aa  58.2  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.5132  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2582  D-alanine--D-alanine ligase  34.45 
 
 		 304 aa  58.2  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2158  argininosuccinate lyase  25.51 
 
 		 914 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1642  hypothetical protein  25.15 
 
 		 392 aa  57.4  0.0000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2002  argininosuccinate lyase  25.51 
 
 		 900 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.848902  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1401  protein of unknown function DUF201  30.08 
 
 		 409 aa  57.4  0.0000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1929  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  26.89 
 
 		 411 aa  57.4  0.0000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2628  D-alanine--D-alanine ligase  34.58 
 
 		 304 aa  57  0.0000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.292335  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2390  D-alanine--D-alanine ligase  33.64 
 
 		 304 aa  57  0.0000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.593473  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2666  D-alanine--D-alanine ligase  34.58 
 
 		 304 aa  57  0.0000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.555621  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2356  D-alanine--D-alanine ligase  33.64 
 
 		 304 aa  56.6  0.0000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0755  protein of unknown function DUF201  25.1 
 
 		 398 aa  57  0.0000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06063  hypothetical protein  26.88 
 
 		 349 aa  56.6  0.0000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3265  hypothetical protein  24.37 
 
 		 412 aa  56.6  0.0000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0877  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain-containing protein ATP-grasp  27.37 
 
 		 386 aa  56.6  0.0000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.656066  normal  0.993359 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0466  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  28.57 
 
 		 1862 aa  56.2  0.0000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.140739  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3626  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  22.62 
 
 		 432 aa  55.8  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7725  hypothetical protein  28.63 
 
 		 411 aa  55.8  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.10668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2022  argininosuccinate lyase  25.51 
 
 		 900 aa  55.8  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.10658  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2612  D-alanine--D-alanine ligase  29.59 
 
 		 317 aa  55.1  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000431315  unclonable  0.00000000000418412 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3597  lysine biosynthesis enzyme LysX  27.53 
 
 		 283 aa  55.5  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.109467 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0418  hypothetical protein  24.66 
 
 		 411 aa  55.5  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03256  D-alanine--D-alanine ligase  26.42 
 
 		 322 aa  55.5  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.130136  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4102  D-alanine--D-alanine ligase  35.14 
 
 		 311 aa  55.1  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.422713 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_37283  predicted protein  24.9 
 
 		 1033 aa  54.7  0.000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2342  D-alanyl-alanine synthetase A  34.95 
 
 		 358 aa  54.7  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.958781 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0139  D-alanine--D-alanine ligase  26.56 
 
 		 285 aa  54.7  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.517972 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1491  hypothetical protein  23.77 
 
 		 409 aa  54.3  0.000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3192  argininosuccinate lyase  27.92 
 
 		 924 aa  54.3  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.655648  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2101  D-alanyl-alanine synthetase A  34.31 
 
 		 357 aa  54.3  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0423676 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0912  biotin carboxylase-like protein  24.6 
 
 		 410 aa  53.9  0.000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.527326 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2987  phosphoribosylglycinamide synthetase  20.42 
 
 		 410 aa  53.9  0.000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.0000000000875543  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6412  3-methylcrotonoyl-CoA carboxylase, alpha subunit  31.78 
 
 		 656 aa  53.5  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.792756  normal  0.0296411 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0432  phosphoribosylaminoimidazole carboxylase ATPase subunit  26.07 
 
 		 386 aa  53.5  0.000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000276786  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1396  argininosuccinate lyase  27.69 
 
 		 926 aa  53.5  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0754  protein of unknown function DUF201  23.21 
 
 		 409 aa  53.5  0.000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1043  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  24.35 
 
 		 476 aa  53.1  0.000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0996  phosphoribosylglycinamide synthetase  23.58 
 
 		 541 aa  53.1  0.000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000037072 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2663  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  24.92 
 
 		 413 aa  52.8  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0585  D-alanine--D-alanine ligase  33.02 
 
 		 313 aa  52.4  0.00001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.034882  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0573  phosphoribosylglycinamide synthetase  25.43 
 
 		 420 aa  52.4  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.23534  normal  0.22349 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1005  cyanophycin synthetase  39.8 
 
 		 862 aa  52.8  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.623044 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6388  phosphoribosylglycinamide synthetase  26.73 
 
 		 422 aa  52.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.357309  normal  0.160447 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0177  hypothetical protein  23.38 
 
 		 411 aa  52  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2560  argininosuccinate lyase  27.24 
 
 		 904 aa  52  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1457  hypothetical protein  22.12 
 
 		 407 aa  51.6  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.939415  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0975  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  21.43 
 
 		 389 aa  52.4  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.976335  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1119  phosphoribosylaminoimidazole carboxylase, ATPase subunit  27.96 
 
 		 387 aa  52  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37420  biotin carboxylase  22.81 
 
 		 405 aa  52  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.442231 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2585  cyanophycin synthetase  35.14 
 
 		 878 aa  51.6  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.588307  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2426  pyruvate carboxylase subunit A  30.48 
 
 		 498 aa  51.2  0.00003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1642  pyruvate carboxylase subunit A  31.25 
 
 		 491 aa  51.2  0.00003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.892085  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0511  D-alanine/D-alanine ligase  27.75 
 
 		 305 aa  50.8  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2646  argininosuccinate lyase  27.24 
 
 		 904 aa  51.2  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2441  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  30.48 
 
 		 450 aa  50.8  0.00004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4982  D-alanine--D-alanine ligase  27.27 
 
 		 319 aa  50.8  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.380222  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1514  hypothetical protein  24.03 
 
 		 412 aa  50.4  0.00005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2153  carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP- binding protein  31.78 
 
 		 643 aa  50.4  0.00005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1342  pyruvate carboxylase subunit A  28.16 
 
 		 494 aa  50.8  0.00005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.492096  normal  0.0929613 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2507  argininosuccinate lyase  27.02 
 
 		 912 aa  50.4  0.00005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3066  D-alanine--D-alanine ligase  24.83 
 
 		 316 aa  50.4  0.00006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0434  D-alanyl-alanine synthetase A  32.71 
 
 		 364 aa  50.1  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0552987  normal  0.545444 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3830  D-alanine--D-alanine ligase  27.01 
 
 		 308 aa  50.4  0.00006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0416  D-alanyl-alanine synthetase A  32.71 
 
 		 364 aa  50.1  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.532787  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>