25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_2607 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_2607  hypothetical protein  100 
 
 
439 aa  875    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.954723 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3467  hypothetical protein  35 
 
 
407 aa  248  2e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7724  putative biotin carboxylase  35.52 
 
 
430 aa  144  4e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.211642  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0791  biotin carboxylase  32.23 
 
 
411 aa  108  1e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06054  hypothetical protein  27.95 
 
 
329 aa  85.5  0.000000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4524  Biotin carboxylase-like protein  27.91 
 
 
403 aa  78.2  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.799309  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6150  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  26.37 
 
 
410 aa  76.3  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.639194 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6148  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  30.23 
 
 
408 aa  72  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.631903 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0874  nikkomycin biosynthesis domain protein  24.17 
 
 
417 aa  71.2  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2023  hypothetical protein  27.8 
 
 
408 aa  69.3  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0162  hypothetical protein  20.47 
 
 
414 aa  62.8  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2846  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain- containing protein  26.3 
 
 
404 aa  61.2  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.435021  normal  0.117516 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3759  protein of unknown function DUF201  30.1 
 
 
425 aa  58.9  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2026  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  30.53 
 
 
423 aa  57.4  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8363  putative siderophore biosynthesis protein  28.76 
 
 
401 aa  56.6  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0875  hypothetical protein  26.67 
 
 
414 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3673  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  25.89 
 
 
407 aa  53.5  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1642  hypothetical protein  22.8 
 
 
392 aa  50.1  0.00007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0875  hypothetical protein  26.13 
 
 
420 aa  50.1  0.00009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.728931 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6153  protein of unknown function DUF201  25.09 
 
 
397 aa  49.3  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.496627  normal  0.0716856 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0573  phosphoribosylglycinamide synthetase  26.8 
 
 
420 aa  47  0.0007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.23534  normal  0.22349 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0877  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain-containing protein ATP-grasp  25 
 
 
386 aa  46.2  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.656066  normal  0.993359 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1164  protein of unknown function DUF201  27.43 
 
 
437 aa  45.4  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2969  hypothetical protein  27.4 
 
 
402 aa  45.1  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0996  phosphoribosylglycinamide synthetase  27.21 
 
 
541 aa  43.9  0.006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000037072 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>