58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_0875 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_0875  hypothetical protein  100 
 
 		 414 aa  856    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0874  nikkomycin biosynthesis domain protein  54.09 
 
 		 417 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6148  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  27.27 
 
 		 408 aa  89.4  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.631903 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0170  phosphoribosylglycinamide synthetase ATP-grasp domain-containing protein  26.07 
 
 		 407 aa  87.8  3e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0292  phosphoribosylglycinamide synthetase, ATP-grasp  26.07 
 
 		 407 aa  87.8  3e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7724  putative biotin carboxylase  29.24 
 
 		 430 aa  79.7  0.00000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.211642  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6150  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  24.81 
 
 		 410 aa  79.3  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.639194 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4524  Biotin carboxylase-like protein  28.15 
 
 		 403 aa  75.9  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.799309  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2846  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain- containing protein  28.1 
 
 		 404 aa  73.9  0.000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.435021  normal  0.117516 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2026  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  26.67 
 
 		 423 aa  71.2  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3467  hypothetical protein  24.23 
 
 		 407 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0791  biotin carboxylase  26.28 
 
 		 411 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2023  hypothetical protein  23.28 
 
 		 408 aa  63.2  0.000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3673  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  25.96 
 
 		 407 aa  62.8  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2668  phosphoribosylglycinamide synthetase  25.94 
 
 		 415 aa  62  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06054  hypothetical protein  25.45 
 
 		 329 aa  60.5  0.00000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2020  phosphoribosylglycinamide synthetase  27.31 
 
 		 407 aa  58.9  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2144  phosphoribosylglycinamide synthetase  26.58 
 
 		 416 aa  57.4  0.0000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0250211 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2607  hypothetical protein  27.63 
 
 		 439 aa  54.7  0.000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.954723 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1514  hypothetical protein  24.52 
 
 		 412 aa  54.7  0.000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0162  hypothetical protein  24.79 
 
 		 414 aa  54.3  0.000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3093  hypothetical protein  26.2 
 
 		 440 aa  54.3  0.000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3626  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  26.6 
 
 		 432 aa  53.9  0.000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1401  protein of unknown function DUF201  24.58 
 
 		 409 aa  52.8  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1915  hypothetical protein  28.44 
 
 		 432 aa  52.4  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.402909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0755  protein of unknown function DUF201  26.05 
 
 		 398 aa  51.6  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2987  phosphoribosylglycinamide synthetase  23.02 
 
 		 410 aa  52  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.0000000000875543  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13270  D-alanine--D-alanine ligase  27.27 
 
 		 315 aa  51.2  0.00004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.122637  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7725  hypothetical protein  25.09 
 
 		 411 aa  50.8  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.10668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4385  D-alanine--D-alanine ligase  28.37 
 
 		 318 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0215233  normal  0.165436 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1498  biotin carboxylase-like  27.86 
 
 		 428 aa  49.3  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0924  D-alanine--D-alanine ligase  27.93 
 
 		 313 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.783773  normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0010  hypothetical protein  23.67 
 
 		 392 aa  48.5  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  decreased coverage  0.00788782  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4510  D-alanine--D-alanine ligase  28.37 
 
 		 318 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.926971  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1339  D-alanine--D-alanine ligase  29.17 
 
 		 318 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.266833  normal  0.0340242 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2135  phosphoribosylglycinamide synthetase  24.49 
 
 		 412 aa  48.1  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.165665  normal  0.504192 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0946  D-alanine--D-alanine ligase  28.37 
 
 		 318 aa  47.4  0.0005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.427679  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2209  CarB family protein  24.46 
 
 		 543 aa  47.4  0.0005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.304362  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0912  biotin carboxylase-like protein  25.48 
 
 		 410 aa  47.4  0.0005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.527326 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3759  protein of unknown function DUF201  27.27 
 
 		 425 aa  47.4  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1584  putative carbamoyl-phosphate-synthetase protein  20.12 
 
 		 393 aa  47  0.0006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1642  hypothetical protein  23.99 
 
 		 392 aa  46.6  0.0008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1491  hypothetical protein  24.64 
 
 		 409 aa  46.6  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2022  argininosuccinate lyase  23.79 
 
 		 900 aa  45.8  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.10658  n/a   
 
 
-
 
NC_006366  plpl0006  hypothetical protein  23.48 
 
 		 387 aa  45.8  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2158  argininosuccinate lyase  23.79 
 
 		 914 aa  45.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2002  argininosuccinate lyase  23.79 
 
 		 900 aa  45.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.848902  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0875  hypothetical protein  25.96 
 
 		 420 aa  45.1  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.728931 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0200  hypothetical protein  23.5 
 
 		 405 aa  44.3  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.214933  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6153  protein of unknown function DUF201  22.83 
 
 		 397 aa  44.3  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.496627  normal  0.0716856 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4982  D-alanine--D-alanine ligase  28.17 
 
 		 319 aa  43.9  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.380222  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1971  argininosuccinate lyase  23.23 
 
 		 891 aa  43.9  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2251  phosphoribosylglycinamide synthetase  26.17 
 
 		 418 aa  44.3  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000511987 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3265  hypothetical protein  25 
 
 		 412 aa  43.5  0.006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2595  putative carbamoyl-phosphate-synthetase  22.39 
 
 		 398 aa  43.5  0.006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.605395  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4671  D-alanine--D-alanine ligase  27.47 
 
 		 324 aa  43.1  0.008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0129578  normal  0.448814 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2328  hypothetical protein  26.77 
 
 		 385 aa  43.1  0.009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0573  phosphoribosylglycinamide synthetase  22.63 
 
 		 420 aa  43.1  0.01  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.23534  normal  0.22349 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>