21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_06054 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_06054  hypothetical protein  100 
 
 		 329 aa  677    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7724  putative biotin carboxylase  31.58 
 
 		 430 aa  90.9  3e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.211642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2607  hypothetical protein  26.71 
 
 		 439 aa  86.3  6e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.954723 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0791  biotin carboxylase  24.83 
 
 		 411 aa  86.3  6e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6148  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  23.96 
 
 		 408 aa  85.1  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.631903 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3467  hypothetical protein  26.21 
 
 		 407 aa  77.4  0.0000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6150  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  27.18 
 
 		 410 aa  71.6  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.639194 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0006  hypothetical protein  26.78 
 
 		 387 aa  70.1  0.00000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2023  hypothetical protein  23.59 
 
 		 408 aa  66.2  0.0000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4524  Biotin carboxylase-like protein  26.21 
 
 		 403 aa  65.1  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.799309  normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0010  hypothetical protein  24.69 
 
 		 392 aa  65.5  0.000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  decreased coverage  0.00788782  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0875  hypothetical protein  25.45 
 
 		 414 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0162  hypothetical protein  25.68 
 
 		 414 aa  60.8  0.00000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3673  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  25.46 
 
 		 407 aa  61.2  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2846  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain- containing protein  26.6 
 
 		 404 aa  58.5  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.435021  normal  0.117516 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0874  nikkomycin biosynthesis domain protein  24.28 
 
 		 417 aa  56.2  0.0000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2026  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  22.75 
 
 		 423 aa  53.1  0.000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0503  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  25.79 
 
 		 387 aa  48.1  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.333912  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_12301  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  25.26 
 
 		 387 aa  46.6  0.0007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.795061  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2737  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  25.71 
 
 		 723 aa  44.3  0.003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3265  hypothetical protein  20.54 
 
 		 412 aa  43.5  0.005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>