80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_2023 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_2023  hypothetical protein  100 
 
 
408 aa  835    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6148  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  37.44 
 
 
408 aa  278  2e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.631903 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6150  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  35.51 
 
 
410 aa  248  2e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.639194 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7724  putative biotin carboxylase  33.23 
 
 
430 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.211642  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0791  biotin carboxylase  31.03 
 
 
411 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2846  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain- containing protein  28.27 
 
 
404 aa  97.8  3e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.435021  normal  0.117516 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3673  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  30.47 
 
 
407 aa  82.8  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2595  putative carbamoyl-phosphate-synthetase  23.8 
 
 
398 aa  80.9  0.00000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.605395  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4524  Biotin carboxylase-like protein  27.35 
 
 
403 aa  77.8  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.799309  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2026  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  27.05 
 
 
423 aa  78.2  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3467  hypothetical protein  27.11 
 
 
407 aa  76.6  0.0000000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2607  hypothetical protein  27.13 
 
 
439 aa  69.3  0.0000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.954723 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0874  nikkomycin biosynthesis domain protein  26.01 
 
 
417 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06054  hypothetical protein  27.14 
 
 
329 aa  65.1  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1396  argininosuccinate lyase  24.3 
 
 
926 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0875  hypothetical protein  23.28 
 
 
414 aa  63.2  0.000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0875  hypothetical protein  25.97 
 
 
420 aa  62.4  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.728931 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3192  argininosuccinate lyase  23.29 
 
 
924 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.655648  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2328  hypothetical protein  26.47 
 
 
385 aa  61.6  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1620  argininosuccinate lyase  24.7 
 
 
896 aa  62  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7725  hypothetical protein  24.23 
 
 
411 aa  60.1  0.00000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.10668  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2560  argininosuccinate lyase  22.96 
 
 
904 aa  59.7  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1971  argininosuccinate lyase  23.71 
 
 
891 aa  59.7  0.00000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2122  argininosuccinate lyase  23.69 
 
 
894 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1915  hypothetical protein  26.52 
 
 
432 aa  58.9  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.402909  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2020  phosphoribosylglycinamide synthetase  24.35 
 
 
407 aa  58.5  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0573  phosphoribosylglycinamide synthetase  24.23 
 
 
420 aa  58.5  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.23534  normal  0.22349 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2646  argininosuccinate lyase  22.96 
 
 
904 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2507  argininosuccinate lyase  27.22 
 
 
912 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0619  phosphoribosylglycinamide synthetase  24.36 
 
 
410 aa  58.9  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.241949  hitchhiker  0.00233057 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0754  protein of unknown function DUF201  23.43 
 
 
409 aa  58.5  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0202  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  24.8 
 
 
388 aa  56.6  0.0000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.658271  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1491  hypothetical protein  24.69 
 
 
409 aa  56.2  0.000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1457  hypothetical protein  24.78 
 
 
407 aa  55.5  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.939415  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06063  hypothetical protein  25.13 
 
 
349 aa  53.9  0.000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0418  hypothetical protein  22.51 
 
 
411 aa  53.5  0.000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0906  biotin carboxylase-like protein  26.21 
 
 
386 aa  53.5  0.000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.17944  hitchhiker  0.00104382 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6153  protein of unknown function DUF201  25.38 
 
 
397 aa  53.1  0.000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.496627  normal  0.0716856 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3759  protein of unknown function DUF201  22.26 
 
 
425 aa  53.1  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2251  phosphoribosylglycinamide synthetase  24.31 
 
 
418 aa  53.1  0.000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000511987 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1514  hypothetical protein  24.65 
 
 
412 aa  52.8  0.00001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1388  hypothetical protein  21.71 
 
 
395 aa  52.8  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0314212 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0877  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain-containing protein ATP-grasp  24.38 
 
 
386 aa  52.4  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.656066  normal  0.993359 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0162  hypothetical protein  23.83 
 
 
414 aa  53.1  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2663  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  27.4 
 
 
413 aa  52.8  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2959  phosphoribosylglycinamide synthetase  22.89 
 
 
405 aa  52.8  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1401  protein of unknown function DUF201  27.56 
 
 
409 aa  52  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2438  hypothetical protein  26.67 
 
 
410 aa  52  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.658373 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4094  biotin carboxylase-like protein  29.31 
 
 
389 aa  50.8  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.138669  normal  0.680577 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4069  phosphoribosylglycinamide synthetase ATP-grasp domain-containing protein  22.12 
 
 
389 aa  50.1  0.00008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0292  phosphoribosylglycinamide synthetase, ATP-grasp  20.54 
 
 
407 aa  49.7  0.00008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0170  phosphoribosylglycinamide synthetase ATP-grasp domain-containing protein  20.54 
 
 
407 aa  49.7  0.00008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006366  plpl0006  hypothetical protein  21.09 
 
 
387 aa  49.7  0.00009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1164  protein of unknown function DUF201  22.39 
 
 
437 aa  49.3  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1475  hypothetical protein  22.9 
 
 
407 aa  49.7  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.843921 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1119  biotin carboxylase  22.26 
 
 
411 aa  49.7  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1432  hypothetical protein  21.96 
 
 
424 aa  49.3  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.502147  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3255  protein of unknown function DUF201  27.04 
 
 
327 aa  48.9  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2737  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  25.88 
 
 
723 aa  48.5  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0010  hypothetical protein  21.41 
 
 
392 aa  48.5  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  decreased coverage  0.00788782  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0177  hypothetical protein  22.96 
 
 
411 aa  47.8  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2022  argininosuccinate lyase  23.37 
 
 
900 aa  47.8  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.10658  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5946  D-alanyl-alanine synthetase A  33.06 
 
 
329 aa  47.8  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.588243  normal  0.0506502 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1119  phosphoribosylaminoimidazole carboxylase, ATPase subunit  24.19 
 
 
387 aa  47.4  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2428  protein of unknown function DUF201  22.18 
 
 
402 aa  47.4  0.0005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.281403  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2148  hypothetical protein  23.32 
 
 
414 aa  47.4  0.0005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.149546 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1642  hypothetical protein  26.32 
 
 
392 aa  47  0.0005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2158  argininosuccinate lyase  23.37 
 
 
914 aa  46.6  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2002  argininosuccinate lyase  23.37 
 
 
900 aa  46.6  0.0008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.848902  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0755  protein of unknown function DUF201  22.81 
 
 
398 aa  46.6  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2209  CarB family protein  27.73 
 
 
543 aa  45.8  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.304362  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3265  hypothetical protein  29.46 
 
 
412 aa  45.1  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6149  hypothetical protein  24.68 
 
 
441 aa  45.1  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.669475 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0136  D-alanine/D-alanine ligase  30.33 
 
 
302 aa  45.1  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.444809  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37420  biotin carboxylase  23.04 
 
 
405 aa  43.9  0.005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.442231 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1929  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  23.63 
 
 
411 aa  43.5  0.007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0912  biotin carboxylase-like protein  22.83 
 
 
410 aa  43.5  0.007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.527326 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1518  protein of unknown function DUF201  26 
 
 
424 aa  43.1  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1423  protein of unknown function DUF201  25.25 
 
 
424 aa  43.1  0.008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.369206  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2986  carbamoyl-phosphate synthase large chain  24.1 
 
 
431 aa  43.1  0.009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.556183  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>