30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2328 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_2328  hypothetical protein  100 
 
 		 385 aa  794    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0877  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain-containing protein ATP-grasp  48.45 
 
 		 386 aa  369  1e-101  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.656066  normal  0.993359 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0202  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  46.77 
 
 		 388 aa  368  1e-100  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.658271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4094  biotin carboxylase-like protein  48.68 
 
 		 389 aa  351  1e-95  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.138669  normal  0.680577 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0906  biotin carboxylase-like protein  50.79 
 
 		 386 aa  350  2e-95  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.17944  hitchhiker  0.00104382 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1642  hypothetical protein  40.16 
 
 		 392 aa  271  2e-71  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0791  biotin carboxylase  25.78 
 
 		 411 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7724  putative biotin carboxylase  27.46 
 
 		 430 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.211642  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4524  Biotin carboxylase-like protein  25.5 
 
 		 403 aa  63.2  0.000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.799309  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2846  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain- containing protein  24.67 
 
 		 404 aa  62.8  0.000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.435021  normal  0.117516 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2623  hypothetical protein  30.57 
 
 		 341 aa  63.2  0.000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2023  hypothetical protein  26.47 
 
 		 408 aa  61.6  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6150  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  27.21 
 
 		 410 aa  59.3  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.639194 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0162  hypothetical protein  25 
 
 		 414 aa  55.8  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3997  phosphoribosylamine/glycine ligase  32.54 
 
 		 423 aa  53.5  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4039  phosphoribosylamine/glycine ligase  32.54 
 
 		 423 aa  53.5  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.324775  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3673  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  25.93 
 
 		 407 aa  53.1  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0573  phosphoribosylglycinamide synthetase  24.58 
 
 		 420 aa  48.9  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.23534  normal  0.22349 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1100  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  28.32 
 
 		 449 aa  48.5  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00140255  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0950  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  28.32 
 
 		 449 aa  47.8  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1495  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  28.32 
 
 		 454 aa  46.2  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6148  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  24.77 
 
 		 408 aa  46.2  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.631903 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3638  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  34.92 
 
 		 449 aa  45.1  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3352  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  36.51 
 
 		 449 aa  45.1  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.610074  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2948  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  34.92 
 
 		 449 aa  45.1  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3391  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  25.66 
 
 		 449 aa  45.1  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.40386 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0858  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  27.43 
 
 		 449 aa  44.3  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.140666 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0172  phosphoribosylamine--glycine ligase  29.76 
 
 		 429 aa  43.5  0.006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1983  phosphoribosylamine/glycine ligase  32.87 
 
 		 423 aa  43.1  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.853313 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0875  hypothetical protein  26.77 
 
 		 414 aa  43.1  0.008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>