More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_3997 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_4039  phosphoribosylamine/glycine ligase  100 
 
 
423 aa  855    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.324775  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1983  phosphoribosylamine/glycine ligase  74.11 
 
 
423 aa  654    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.853313 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3997  phosphoribosylamine/glycine ligase  100 
 
 
423 aa  855    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0779  phosphoribosylamine/glycine ligase  67.45 
 
 
428 aa  601  1.0000000000000001e-171  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.00193673  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3227  phosphoribosylamine--glycine ligase  67.06 
 
 
425 aa  590  1e-167  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1775  phosphoribosylamine/glycine ligase  64.13 
 
 
433 aa  542  1e-153  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.780493 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1471  phosphoribosylamine--glycine ligase  62.95 
 
 
423 aa  533  1e-150  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0600936 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0925  phosphoribosylamine--glycine ligase  58.47 
 
 
433 aa  468  9.999999999999999e-131  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2361  phosphoribosylamine--glycine ligase  53.86 
 
 
422 aa  448  1e-125  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1628  phosphoribosylamine--glycine ligase  53.74 
 
 
425 aa  441  1e-123  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2231  phosphoribosylamine--glycine ligase  51.52 
 
 
423 aa  422  1e-117  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0735  phosphoribosylamine/glycine ligase  53.07 
 
 
425 aa  419  1e-116  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.525706  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0438  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.3 
 
 
430 aa  417  9.999999999999999e-116  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.199076  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0224  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.07 
 
 
428 aa  415  1e-114  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0267401  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0228  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.3 
 
 
428 aa  414  1e-114  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0316556  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2652  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.36 
 
 
429 aa  412  1e-114  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0292  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.06 
 
 
427 aa  414  1e-114  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00181025  normal  0.0133648 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2988  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.13 
 
 
428 aa  409  1e-113  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4506  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.65 
 
 
429 aa  409  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0278032 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002184  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.96 
 
 
429 aa  409  1e-113  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.25624  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0909  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.12 
 
 
432 aa  411  1e-113  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0266  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.3 
 
 
427 aa  410  1e-113  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000213794  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0221  phosphoribosylamine/glycine ligase  51.05 
 
 
427 aa  409  1e-113  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.529077 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3862  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.83 
 
 
429 aa  408  1e-113  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.256361  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0356  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.41 
 
 
428 aa  406  1.0000000000000001e-112  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0104682  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0361  phosphoribosylamine--glycine ligase  51.17 
 
 
427 aa  408  1.0000000000000001e-112  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.292405  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4508  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.42 
 
 
429 aa  407  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0778373 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4613  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.83 
 
 
431 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.302277 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0360  Phosphoribosylamine--glycine ligase  48.36 
 
 
430 aa  406  1.0000000000000001e-112  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0215  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.18 
 
 
430 aa  405  1.0000000000000001e-112  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0406099  normal  0.0125796 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3708  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.13 
 
 
428 aa  405  1.0000000000000001e-112  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0202463  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2180  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.23 
 
 
419 aa  407  1.0000000000000001e-112  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.900628  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4419  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.18 
 
 
429 aa  405  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.160091  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0707  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.83 
 
 
429 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4582  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.18 
 
 
429 aa  405  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.213422  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0464  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.41 
 
 
428 aa  405  1.0000000000000001e-112  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00032027  normal  0.0111484 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1245  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.04 
 
 
419 aa  405  1.0000000000000001e-112  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.495633  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3844  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.41 
 
 
428 aa  405  1.0000000000000001e-112  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000315171  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3451  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.66 
 
 
428 aa  405  1.0000000000000001e-112  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.264337  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3988  phosphoribosylamine/glycine ligase  48.72 
 
 
429 aa  402  1e-111  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0361396  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4823  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.36 
 
 
431 aa  402  1e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1753  phosphoribosylamine--glycine ligase  48 
 
 
437 aa  404  1e-111  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.528627  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4496  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.72 
 
 
429 aa  402  1e-111  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000225394  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1899  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.3 
 
 
428 aa  402  1e-111  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.543102  normal  0.253787 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2759  phosphoribosylamine--glycine ligase  51.76 
 
 
424 aa  404  1e-111  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000179977  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1704  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.3 
 
 
428 aa  403  1e-111  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.382123  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4698  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.36 
 
 
430 aa  403  1e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.744432  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2043  phosphoribosylamine--glycine ligase  53.07 
 
 
421 aa  404  1e-111  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.453314 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4386  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.18 
 
 
429 aa  405  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.677738 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00211  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.73 
 
 
429 aa  404  1e-111  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0612  phosphoribosylamine--glycine ligase  51.28 
 
 
430 aa  402  1e-111  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000692344  hitchhiker  0.00000110971 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4876  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.36 
 
 
431 aa  402  1e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0434  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.11 
 
 
424 aa  404  1e-111  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0617  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.83 
 
 
425 aa  401  9.999999999999999e-111  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1989  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.58 
 
 
422 aa  399  9.999999999999999e-111  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.187802  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1885  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.31 
 
 
425 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.132048  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1384  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.31 
 
 
425 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.563842  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2389  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.58 
 
 
422 aa  399  9.999999999999999e-111  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0612  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.13 
 
 
430 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.147919  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0793  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.31 
 
 
425 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.296273  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5622  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.9 
 
 
425 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4239  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.72 
 
 
429 aa  399  9.999999999999999e-111  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00124381  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5575  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.13 
 
 
429 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1014  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.54 
 
 
425 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4020  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.72 
 
 
429 aa  398  9.999999999999999e-111  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.0000927217  normal  0.0101467 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1480  phosphoribosylamine/glycine ligase  49.88 
 
 
419 aa  400  9.999999999999999e-111  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4548  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.72 
 
 
429 aa  398  9.999999999999999e-111  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.00000304372  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23090  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.65 
 
 
425 aa  400  9.999999999999999e-111  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.121893  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1074  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.31 
 
 
425 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.497421  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1427  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.71 
 
 
591 aa  399  9.999999999999999e-111  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1239  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.31 
 
 
425 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0277108  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1230  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.31 
 
 
425 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2342  phosphoribosylamine/glycine ligase  48.71 
 
 
428 aa  400  9.999999999999999e-111  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.51337  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06880  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.48 
 
 
426 aa  399  9.999999999999999e-111  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.285428  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64220  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.13 
 
 
429 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.88359  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0357  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.31 
 
 
425 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.659716  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03882  phosphoribosylamine-glycine ligase  48.72 
 
 
429 aa  397  1e-109  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000860274  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0610  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.88 
 
 
423 aa  397  1e-109  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00101284  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2191  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.89 
 
 
422 aa  396  1e-109  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4867  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.66 
 
 
431 aa  397  1e-109  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3845  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.83 
 
 
423 aa  395  1e-109  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000183828  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0529  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.95 
 
 
429 aa  397  1e-109  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.863272  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4453  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.72 
 
 
429 aa  397  1e-109  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0221711  hitchhiker  0.000392069 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4407  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.66 
 
 
431 aa  397  1e-109  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.357121 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0177  phosphoribosylamine/glycine ligase  49.65 
 
 
429 aa  397  1e-109  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.348487  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0646  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.53 
 
 
436 aa  397  1e-109  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5474  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.25 
 
 
429 aa  397  1e-109  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.13476  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1999  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.07 
 
 
429 aa  396  1e-109  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.00638776  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2076  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.83 
 
 
438 aa  398  1e-109  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.552059  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2323  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.65 
 
 
429 aa  395  1e-109  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.125717  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0784  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.06 
 
 
422 aa  398  1e-109  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.110869  normal  0.244609 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1419  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.36 
 
 
425 aa  397  1e-109  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1338  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.71 
 
 
430 aa  397  1e-109  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1626  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.53 
 
 
432 aa  397  1e-109  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03835  hypothetical protein  48.72 
 
 
429 aa  397  1e-109  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000931477  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1777  phosphoribosylamine/glycine ligase  48.72 
 
 
428 aa  395  1e-109  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3219  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.73 
 
 
429 aa  397  1e-109  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.708681 
 
 
-
 
NC_004310  BR0414  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.53 
 
 
427 aa  392  1e-108  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.31965  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2843  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.62 
 
 
430 aa  395  1e-108  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.294227  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0348  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.11 
 
 
422 aa  393  1e-108  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.6128 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>