37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_4094 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_4094  biotin carboxylase-like protein  100 
 
 		 389 aa  805    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.138669  normal  0.680577 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0906  biotin carboxylase-like protein  82.38 
 
 		 386 aa  640    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.17944  hitchhiker  0.00104382 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0202  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  59.02 
 
 		 388 aa  470  1.0000000000000001e-131  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.658271  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0877  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain-containing protein ATP-grasp  58.49 
 
 		 386 aa  427  1e-118  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.656066  normal  0.993359 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2328  hypothetical protein  48.68 
 
 		 385 aa  378  1e-103  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1642  hypothetical protein  44.04 
 
 		 392 aa  320  3e-86  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0791  biotin carboxylase  27.44 
 
 		 411 aa  95.1  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6150  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  28.73 
 
 		 410 aa  69.3  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.639194 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3673  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  28.25 
 
 		 407 aa  67.8  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7724  putative biotin carboxylase  27.03 
 
 		 430 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.211642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2023  hypothetical protein  27.03 
 
 		 408 aa  62.8  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2026  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  26.19 
 
 		 423 aa  62.8  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0194  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain-containing protein ATP-grasp  27.2 
 
 		 419 aa  59.7  0.00000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.296569  normal  0.160479 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0162  hypothetical protein  21.91 
 
 		 414 aa  54.3  0.000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6148  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  25.79 
 
 		 408 aa  53.5  0.000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.631903 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3626  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  24.85 
 
 		 432 aa  52  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3467  hypothetical protein  23.81 
 
 		 407 aa  48.9  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3202  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  24.35 
 
 		 1079 aa  48.9  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06063  hypothetical protein  24.21 
 
 		 349 aa  48.5  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0755  protein of unknown function DUF201  19.13 
 
 		 398 aa  48.1  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2158  argininosuccinate lyase  23.86 
 
 		 914 aa  47.8  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2002  argininosuccinate lyase  23.86 
 
 		 900 aa  47.4  0.0004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.848902  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1114  cyanophycin synthetase  27.33 
 
 		 879 aa  47  0.0005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.654809  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13841  carbamoyl phosphate synthase large subunit  24.44 
 
 		 1102 aa  47.4  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.19323 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2022  argininosuccinate lyase  23.86 
 
 		 900 aa  47.4  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.10658  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0711  carbamoyl phosphate synthase large subunit  32.32 
 
 		 1097 aa  46.6  0.0008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1504  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  27.33 
 
 		 1049 aa  45.8  0.001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000277903  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0916  carbamoyl-phosphate synthase large subunit  26.82 
 
 		 1038 aa  46.2  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.150361 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3064  hypothetical protein  21.45 
 
 		 441 aa  45.8  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000514586 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5770  hypothetical protein  28.15 
 
 		 453 aa  45.4  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0282385 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5090  hypothetical protein  28.15 
 
 		 453 aa  45.4  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1262  carbamoyl phosphate synthase large subunit  27.59 
 
 		 1057 aa  43.5  0.006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1287  carbamoyl phosphate synthase large subunit  27.59 
 
 		 1057 aa  43.5  0.006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.867856  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5709  cyanophycin synthetase  34.48 
 
 		 730 aa  43.5  0.006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0197645 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10451  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  22.22 
 
 		 1098 aa  43.1  0.007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0121  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  29.57 
 
 		 1075 aa  43.1  0.008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1700  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  29.47 
 
 		 1496 aa  43.1  0.009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>