102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_1642 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008309  HS_1642  hypothetical protein  100 
 
 		 392 aa  817    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0202  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  46.53 
 
 		 388 aa  380  1e-104  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.658271  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0877  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain-containing protein ATP-grasp  46.65 
 
 		 386 aa  359  5e-98  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.656066  normal  0.993359 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4094  biotin carboxylase-like protein  44.04 
 
 		 389 aa  320  3.9999999999999996e-86  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.138669  normal  0.680577 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0906  biotin carboxylase-like protein  43.52 
 
 		 386 aa  317  2e-85  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.17944  hitchhiker  0.00104382 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2328  hypothetical protein  40.16 
 
 		 385 aa  297  2e-79  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0791  biotin carboxylase  26.95 
 
 		 411 aa  110  5e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2846  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain- containing protein  22.61 
 
 		 404 aa  71.2  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.435021  normal  0.117516 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7724  putative biotin carboxylase  24.71 
 
 		 430 aa  69.7  0.00000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.211642  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4524  Biotin carboxylase-like protein  23.94 
 
 		 403 aa  66.2  0.0000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.799309  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3673  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  24.76 
 
 		 407 aa  65.1  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0162  hypothetical protein  24.73 
 
 		 414 aa  61.2  0.00000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2158  argininosuccinate lyase  22.07 
 
 		 914 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2002  argininosuccinate lyase  22.07 
 
 		 900 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.848902  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2022  argininosuccinate lyase  22.07 
 
 		 900 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.10658  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2026  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  23.87 
 
 		 423 aa  58.9  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6150  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  23.51 
 
 		 410 aa  58.2  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.639194 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0874  nikkomycin biosynthesis domain protein  22.89 
 
 		 417 aa  57.4  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2607  hypothetical protein  22.32 
 
 		 439 aa  55.8  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.954723 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0875  hypothetical protein  24.42 
 
 		 414 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2070  carbamoyl phosphate synthase large subunit  23.51 
 
 		 1029 aa  54.3  0.000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3857  protein of unknown function DUF201  26.82 
 
 		 430 aa  54.3  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.214933 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3136  putative siderophore biosynthesis protein  25.23 
 
 		 388 aa  53.9  0.000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2251  phosphoribosylglycinamide synthetase  20.45 
 
 		 418 aa  53.5  0.000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000511987 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1929  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  19.77 
 
 		 411 aa  52.8  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0975  carbamoyl-phosphate synthase large subunit  21.36 
 
 		 1098 aa  52  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3064  hypothetical protein  22.13 
 
 		 441 aa  52.4  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000514586 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6148  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  25.23 
 
 		 408 aa  51.2  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.631903 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3467  hypothetical protein  24.25 
 
 		 407 aa  50.4  0.00005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0755  protein of unknown function DUF201  24.29 
 
 		 398 aa  50.1  0.00007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1700  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  23.39 
 
 		 1496 aa  49.7  0.00008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2020  phosphoribosylglycinamide synthetase  16.74 
 
 		 407 aa  49.3  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09340  hypothetical protein  25.89 
 
 		 399 aa  48.9  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.035454  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0662  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  23.03 
 
 		 1072 aa  48.5  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4016  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  22.73 
 
 		 1065 aa  48.5  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3093  hypothetical protein  26.62 
 
 		 440 aa  48.9  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001066  vibrioferrin ligase/carboxylase protein PvsA  24.77 
 
 		 403 aa  48.9  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2230  carbamoyl phosphate synthase large subunit  21.94 
 
 		 1107 aa  48.1  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.497608  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03221  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  24.73 
 
 		 448 aa  47.8  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2046  D-alanine--D-alanine ligase  32.46 
 
 		 320 aa  47.8  0.0003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000802497  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3211  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  25.95 
 
 		 1082 aa  48.1  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2023  hypothetical protein  26.32 
 
 		 408 aa  47.4  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0588  carbamoyl phosphate synthase-like protein  46.03 
 
 		 320 aa  47.4  0.0004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2806  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  29.35 
 
 		 1077 aa  47.4  0.0005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10451  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  20.39 
 
 		 1098 aa  47.4  0.0005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10451  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  20.39 
 
 		 1098 aa  47  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3091  PvsA  26.79 
 
 		 394 aa  47  0.0005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.324185  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0573  phosphoribosylglycinamide synthetase  22.02 
 
 		 420 aa  47.4  0.0005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.23534  normal  0.22349 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0769  carbamoyl phosphate synthase large subunit  23.29 
 
 		 1057 aa  47  0.0006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1047  carbamoyl phosphate synthase large subunit  21.58 
 
 		 1065 aa  47  0.0006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1057  carbamoyl-phosphate synthase large subunit  24.88 
 
 		 1103 aa  46.6  0.0007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.614826  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0380  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  22.51 
 
 		 1099 aa  46.6  0.0007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0333  carbamoyl-phosphate synthase large subunit  27.27 
 
 		 1087 aa  45.8  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.639877  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06063  hypothetical protein  23.16 
 
 		 349 aa  46.2  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1967  D-alanine--D-alanine ligase  31.58 
 
 		 320 aa  46.2  0.001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000254256  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4206  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  25 
 
 		 1077 aa  46.2  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.412079  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2737  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  23.2 
 
 		 723 aa  46.2  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0836  carbamoyl phosphate synthase large subunit  21.51 
 
 		 1106 aa  45.4  0.002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1379  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  26.89 
 
 		 453 aa  45.4  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.34087  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13841  carbamoyl phosphate synthase large subunit  21.01 
 
 		 1102 aa  45.1  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.19323 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3743  carbamoyl phosphate synthase large subunit  22.73 
 
 		 1112 aa  45.4  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0558638 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06054  hypothetical protein  27.19 
 
 		 329 aa  45.4  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5803  cyanophycin synthetase  25.64 
 
 		 910 aa  45.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0493543  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1093  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP- binding  27.1 
 
 		 459 aa  45.1  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2088  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP- binding protein  37.14 
 
 		 452 aa  45.1  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2986  carbamoyl-phosphate synthase large chain  28.33 
 
 		 431 aa  44.7  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.556183  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2392  putative carbamoylphosphate synthase large subunit short form  26.71 
 
 		 428 aa  44.7  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000165669  hitchhiker  0.0000484341 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1298  carbamoyl-phosphate synthase large subunit  23.93 
 
 		 1093 aa  44.7  0.003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0243124 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1005  cyanophycin synthetase  29.49 
 
 		 862 aa  44.7  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.623044 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1096  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  27.03 
 
 		 1080 aa  44.3  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.528087  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6412  3-methylcrotonoyl-CoA carboxylase, alpha subunit  27.27 
 
 		 656 aa  44.7  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.792756  normal  0.0296411 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0194  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain-containing protein ATP-grasp  22.71 
 
 		 419 aa  45.1  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.296569  normal  0.160479 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3626  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  23.5 
 
 		 432 aa  44.7  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0534  hypothetical protein  22.6 
 
 		 380 aa  43.9  0.004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0335  cyanophycin synthetase  36.25 
 
 		 636 aa  44.3  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.609672 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0779  phosphoribosylamine/glycine ligase  22.58 
 
 		 428 aa  44.3  0.004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.00193673  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0147  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  30.83 
 
 		 510 aa  43.9  0.004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.012 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0363  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  22.95 
 
 		 1099 aa  43.9  0.004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.948928  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09421  carbamoyl phosphate synthase large subunit  21.05 
 
 		 1102 aa  44.3  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.48338  hitchhiker  0.00020479 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2306  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  26.13 
 
 		 1078 aa  44.3  0.004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2663  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  20.14 
 
 		 413 aa  44.3  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1315  cyanophycin synthetase  32.1 
 
 		 722 aa  43.9  0.005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.943879  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00681  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  26.05 
 
 		 448 aa  43.9  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3256  putative carbamoyl-phosphate synthase large chain  28.33 
 
 		 420 aa  43.9  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.077916  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3007  cyanophycin synthetase domain-containing protein  29.89 
 
 		 302 aa  43.5  0.006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.402225  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1819  carbamoyl phosphate synthase large subunit  20.29 
 
 		 1107 aa  43.5  0.006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5709  cyanophycin synthetase  26.36 
 
 		 730 aa  43.5  0.006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0197645 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3012  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  24.08 
 
 		 1107 aa  43.5  0.006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.541011  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1355  carbamoyl-phosphate synthase large subunit  22.34 
 
 		 1092 aa  43.5  0.006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0316249 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42572  Carbamoyl-phosphate synthase L chain  24.89 
 
 		 1105 aa  43.5  0.007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0674343 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3202  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  17.65 
 
 		 1079 aa  43.5  0.007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37420  biotin carboxylase  27.36 
 
 		 405 aa  43.5  0.007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.442231 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2153  carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP- binding protein  25.76 
 
 		 643 aa  43.5  0.007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6302  hypothetical protein  23.19 
 
 		 401 aa  43.1  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0344575  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2175  carbamoyl phosphate synthase large subunit  22.71 
 
 		 1082 aa  43.1  0.009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.321083  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0421  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  26.17 
 
 		 448 aa  43.1  0.009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0875  hypothetical protein  20.45 
 
 		 420 aa  43.1  0.009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.728931 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0583  MGS domain protein  23.44 
 
 		 530 aa  43.1  0.009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.774187  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0636  cyanophycin synthetase  29.11 
 
 		 723 aa  43.1  0.009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.698291  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0619  phosphoribosylglycinamide synthetase  22.45 
 
 		 410 aa  43.1  0.009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.241949  hitchhiker  0.00233057 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>