98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_09340 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_09340  hypothetical protein  100 
 
 
399 aa  803    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.035454  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3091  PvsA  72.84 
 
 
394 aa  540  9.999999999999999e-153  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.324185  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01931  vibrioferrin biosynthesis protein PvsA  55.58 
 
 
399 aa  402  1e-111  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3136  putative siderophore biosynthesis protein  54.41 
 
 
388 aa  400  9.999999999999999e-111  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001066  vibrioferrin ligase/carboxylase protein PvsA  51.17 
 
 
403 aa  378  1e-103  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4786  hypothetical protein  50.75 
 
 
398 aa  368  1e-100  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0721  hypothetical protein  50.25 
 
 
402 aa  362  8e-99  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.446517 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1279  hypothetical protein  43.55 
 
 
411 aa  328  1.0000000000000001e-88  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.406455  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8363  putative siderophore biosynthesis protein  42.86 
 
 
401 aa  260  3e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2969  hypothetical protein  39.61 
 
 
402 aa  241  2e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3748  protein of unknown function DUF201  41.21 
 
 
388 aa  227  2e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.277412  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1971  argininosuccinate lyase  24.78 
 
 
891 aa  92.4  1e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2122  argininosuccinate lyase  28.03 
 
 
894 aa  91.3  3e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1620  argininosuccinate lyase  28.03 
 
 
896 aa  91.3  3e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3192  argininosuccinate lyase  28.03 
 
 
924 aa  91.3  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.655648  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1396  argininosuccinate lyase  28.03 
 
 
926 aa  91.3  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2560  argininosuccinate lyase  28.03 
 
 
904 aa  91.3  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2646  argininosuccinate lyase  28.03 
 
 
904 aa  90.1  6e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2507  argininosuccinate lyase  28.03 
 
 
912 aa  90.1  6e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1270  protein of unknown function DUF201  30 
 
 
399 aa  88.6  2e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.964812  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2022  argininosuccinate lyase  25.69 
 
 
900 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.10658  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2158  argininosuccinate lyase  25.69 
 
 
914 aa  83.2  0.000000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2002  argininosuccinate lyase  25.69 
 
 
900 aa  83.2  0.000000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.848902  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3265  hypothetical protein  28.57 
 
 
412 aa  82  0.00000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3759  protein of unknown function DUF201  30.11 
 
 
425 aa  79  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0170  phosphoribosylglycinamide synthetase ATP-grasp domain-containing protein  22.89 
 
 
407 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0292  phosphoribosylglycinamide synthetase, ATP-grasp  22.89 
 
 
407 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7725  hypothetical protein  29.8 
 
 
411 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.10668  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0730  hypothetical protein  26.28 
 
 
436 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4500  Cysteine synthase  26.87 
 
 
756 aa  74.3  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.632569  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1401  protein of unknown function DUF201  25.47 
 
 
409 aa  73.9  0.000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2428  protein of unknown function DUF201  27.19 
 
 
402 aa  69.3  0.0000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.281403  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2737  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  25 
 
 
723 aa  68.2  0.0000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0200  hypothetical protein  24.63 
 
 
405 aa  66.6  0.0000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.214933  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0718  hypothetical protein  26.94 
 
 
406 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.555879  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0899  hypothetical protein  26.94 
 
 
406 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0732  hypothetical protein  26.94 
 
 
406 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2020  phosphoribosylglycinamide synthetase  29.41 
 
 
407 aa  65.1  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33390  biotin carboxylase  27.62 
 
 
428 aa  64.3  0.000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.465269 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0875  hypothetical protein  24.19 
 
 
420 aa  64.3  0.000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.728931 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0912  biotin carboxylase-like protein  25.94 
 
 
410 aa  63.2  0.000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.527326 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3626  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  27.01 
 
 
432 aa  62.8  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1164  protein of unknown function DUF201  25.7 
 
 
437 aa  60.5  0.00000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5515  phosphoribosylglycinamide synthetase  28.36 
 
 
422 aa  59.7  0.00000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.330375  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5879  phosphoribosylglycinamide synthetase  28.36 
 
 
422 aa  59.7  0.00000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.521142  normal  0.293972 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2440  biotin carboxylase-like  31.09 
 
 
424 aa  59.7  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.459774  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1518  protein of unknown function DUF201  31.29 
 
 
424 aa  58.9  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1929  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  25.75 
 
 
411 aa  59.7  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6388  phosphoribosylglycinamide synthetase  28.06 
 
 
422 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.357309  normal  0.160447 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1423  protein of unknown function DUF201  31.29 
 
 
424 aa  57.8  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.369206  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0194  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain-containing protein ATP-grasp  30.73 
 
 
419 aa  57.4  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.296569  normal  0.160479 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2135  phosphoribosylglycinamide synthetase  23.89 
 
 
412 aa  56.6  0.0000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.165665  normal  0.504192 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44930  predicted protein  26.83 
 
 
575 aa  56.2  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.541672  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2987  phosphoribosylglycinamide synthetase  24.76 
 
 
410 aa  56.2  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.0000000000875543  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1007  hypothetical protein  23.69 
 
 
427 aa  55.1  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0755  protein of unknown function DUF201  24.17 
 
 
398 aa  54.7  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0996  phosphoribosylglycinamide synthetase  22.03 
 
 
541 aa  54.7  0.000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000037072 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0754  protein of unknown function DUF201  26.36 
 
 
409 aa  53.9  0.000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0344  phosphoribosylglycinamide synthetase  24.22 
 
 
424 aa  53.1  0.000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2272  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  26.71 
 
 
1030 aa  52.8  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4648  protein of unknown function DUF201  29.22 
 
 
404 aa  52.4  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.896666  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2209  CarB family protein  25.81 
 
 
543 aa  52.8  0.00001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.304362  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2959  phosphoribosylglycinamide synthetase  23.53 
 
 
405 aa  52.4  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1514  hypothetical protein  25.39 
 
 
412 aa  51.6  0.00002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0449  putative glycolate oxidase  24.07 
 
 
404 aa  50.4  0.00005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1119  biotin carboxylase  25.32 
 
 
411 aa  49.7  0.00009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2251  phosphoribosylglycinamide synthetase  27.48 
 
 
418 aa  49.3  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000511987 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0916  carbamoyl-phosphate synthase large subunit  27.33 
 
 
1038 aa  49.3  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.150361 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1432  hypothetical protein  28.75 
 
 
424 aa  49.3  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.502147  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2070  carbamoyl phosphate synthase large subunit  34.26 
 
 
1029 aa  48.5  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1642  hypothetical protein  25.89 
 
 
392 aa  48.9  0.0002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2162  hypothetical protein  26.84 
 
 
414 aa  48.5  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.337945  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2084  hypothetical protein  23.24 
 
 
362 aa  47.4  0.0005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0903485  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2846  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain- containing protein  22.51 
 
 
404 aa  47  0.0006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.435021  normal  0.117516 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4090  hypothetical protein  27.64 
 
 
414 aa  47  0.0006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.572464  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0072  hypothetical protein  27.64 
 
 
414 aa  46.6  0.0007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4142  hypothetical protein  27.64 
 
 
414 aa  47  0.0007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.16964  normal  0.023954 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2663  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  28.44 
 
 
413 aa  46.2  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_37283  predicted protein  26.71 
 
 
1033 aa  46.2  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1298  carbamoyl-phosphate synthase large subunit  25.61 
 
 
1093 aa  46.2  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0243124 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06063  hypothetical protein  27.56 
 
 
349 aa  45.8  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3064  hypothetical protein  26.45 
 
 
441 aa  45.8  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000514586 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13270  D-alanine--D-alanine ligase  32.8 
 
 
315 aa  45.4  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.122637  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1426  D-alanine--D-alanine ligase  33.33 
 
 
313 aa  45.1  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5882  phosphoribosylglycinamide synthetase  25.69 
 
 
403 aa  44.7  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.47867 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5518  phosphoribosylglycinamide synthetase  25.69 
 
 
403 aa  44.7  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.398662  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1498  biotin carboxylase-like  27.99 
 
 
428 aa  44.7  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0791  biotin carboxylase  25.93 
 
 
411 aa  43.9  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2438  hypothetical protein  25.86 
 
 
410 aa  44.3  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.658373 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0573  phosphoribosylglycinamide synthetase  25.79 
 
 
420 aa  43.9  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.23534  normal  0.22349 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6391  phosphoribosylglycinamide synthetase  24.4 
 
 
403 aa  44.3  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.782672  normal  0.167257 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2365  hypothetical protein  28.17 
 
 
260 aa  43.9  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2713  biotin carboxylase  28.17 
 
 
260 aa  43.9  0.005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0098  protein of unknown function DUF201  29.46 
 
 
334 aa  43.9  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4069  phosphoribosylglycinamide synthetase ATP-grasp domain-containing protein  23.28 
 
 
389 aa  43.9  0.006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6153  protein of unknown function DUF201  24.41 
 
 
397 aa  43.5  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.496627  normal  0.0716856 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0619  phosphoribosylglycinamide synthetase  21.51 
 
 
410 aa  43.5  0.007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.241949  hitchhiker  0.00233057 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1917  carbamoyl phosphate synthase large subunit  19.35 
 
 
1065 aa  43.1  0.008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>