90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1498 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_1498  biotin carboxylase-like  100 
 
 		 428 aa  817    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7725  hypothetical protein  32.84 
 
 		 411 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.10668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4500  Cysteine synthase  35.88 
 
 		 756 aa  116  6e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.632569  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3093  hypothetical protein  30.81 
 
 		 440 aa  108  2e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3759  protein of unknown function DUF201  31.73 
 
 		 425 aa  108  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2020  phosphoribosylglycinamide synthetase  30.54 
 
 		 407 aa  103  7e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2438  hypothetical protein  37.36 
 
 		 410 aa  99  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.658373 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1270  protein of unknown function DUF201  23.51 
 
 		 399 aa  93.6  7e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.964812  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3265  hypothetical protein  27.3 
 
 		 412 aa  93.2  9e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2144  phosphoribosylglycinamide synthetase  32.66 
 
 		 416 aa  92.4  1e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0250211 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0619  phosphoribosylglycinamide synthetase  28.61 
 
 		 410 aa  92  2e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.241949  hitchhiker  0.00233057 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6153  protein of unknown function DUF201  27.74 
 
 		 397 aa  92  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.496627  normal  0.0716856 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2428  protein of unknown function DUF201  26.71 
 
 		 402 aa  91.7  3e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.281403  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0754  protein of unknown function DUF201  25.74 
 
 		 409 aa  89.4  1e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33390  biotin carboxylase  30.29 
 
 		 428 aa  89.4  1e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.465269 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1432  hypothetical protein  32.36 
 
 		 424 aa  88.6  2e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.502147  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2668  phosphoribosylglycinamide synthetase  33.33 
 
 		 415 aa  87.4  4e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2440  biotin carboxylase-like  32.7 
 
 		 424 aa  87.8  4e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.459774  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1423  protein of unknown function DUF201  32.97 
 
 		 424 aa  87  6e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.369206  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1518  protein of unknown function DUF201  32.69 
 
 		 424 aa  86.3  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0418  hypothetical protein  28.97 
 
 		 411 aa  85.1  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1401  protein of unknown function DUF201  27.81 
 
 		 409 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37420  biotin carboxylase  28.88 
 
 		 405 aa  84.7  0.000000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.442231 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2251  phosphoribosylglycinamide synthetase  29.94 
 
 		 418 aa  83.6  0.000000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000511987 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2987  phosphoribosylglycinamide synthetase  26.95 
 
 		 410 aa  82.4  0.00000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.0000000000875543  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3626  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  31.89 
 
 		 432 aa  82.8  0.00000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6149  hypothetical protein  28.28 
 
 		 441 aa  82  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.669475 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0573  phosphoribosylglycinamide synthetase  29.04 
 
 		 420 aa  80.5  0.00000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.23534  normal  0.22349 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3192  argininosuccinate lyase  29.19 
 
 		 924 aa  80.5  0.00000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.655648  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1396  argininosuccinate lyase  29.02 
 
 		 926 aa  79.7  0.00000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2646  argininosuccinate lyase  28.69 
 
 		 904 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2846  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain- containing protein  25.16 
 
 		 404 aa  79  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.435021  normal  0.117516 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2507  argininosuccinate lyase  28.53 
 
 		 912 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1119  biotin carboxylase  27.08 
 
 		 411 aa  78.6  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2560  argininosuccinate lyase  28.69 
 
 		 904 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0170  phosphoribosylglycinamide synthetase ATP-grasp domain-containing protein  25.07 
 
 		 407 aa  77.4  0.0000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0292  phosphoribosylglycinamide synthetase, ATP-grasp  25.07 
 
 		 407 aa  77.4  0.0000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2122  argininosuccinate lyase  28.9 
 
 		 894 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1971  argininosuccinate lyase  27.35 
 
 		 891 aa  73.9  0.000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1620  argininosuccinate lyase  28.74 
 
 		 896 aa  73.6  0.000000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1164  protein of unknown function DUF201  25.59 
 
 		 437 aa  73.2  0.000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0194  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain-containing protein ATP-grasp  29.05 
 
 		 419 aa  73.2  0.000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.296569  normal  0.160479 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2002  argininosuccinate lyase  32.48 
 
 		 900 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.848902  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1724  protein of unknown function DUF201  30.57 
 
 		 401 aa  71.6  0.00000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2022  argininosuccinate lyase  31.94 
 
 		 900 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.10658  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2158  argininosuccinate lyase  32.48 
 
 		 914 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4648  protein of unknown function DUF201  34.44 
 
 		 404 aa  71.6  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.896666  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2737  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  24.85 
 
 		 723 aa  70.5  0.00000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06063  hypothetical protein  25.07 
 
 		 349 aa  64.7  0.000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2209  CarB family protein  25.54 
 
 		 543 aa  64.7  0.000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.304362  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4069  phosphoribosylglycinamide synthetase ATP-grasp domain-containing protein  25.07 
 
 		 389 aa  64.3  0.000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0874  nikkomycin biosynthesis domain protein  28.79 
 
 		 417 aa  64.3  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2026  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  27.85 
 
 		 423 aa  63.9  0.000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4524  Biotin carboxylase-like protein  24.91 
 
 		 403 aa  63.5  0.000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.799309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1915  hypothetical protein  26.19 
 
 		 432 aa  63.5  0.000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.402909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4068  hypothetical protein  26.64 
 
 		 413 aa  62.4  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2959  phosphoribosylglycinamide synthetase  21.38 
 
 		 405 aa  62.8  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0755  protein of unknown function DUF201  23.95 
 
 		 398 aa  62  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0875  hypothetical protein  27.86 
 
 		 414 aa  62.4  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1475  hypothetical protein  26.29 
 
 		 407 aa  60.5  0.00000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.843921 
 
 
-
 
NC_003296  RS03057  hypothetical protein  25.52 
 
 		 449 aa  59.3  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.450613  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0449  putative glycolate oxidase  23.44 
 
 		 404 aa  58.9  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09340  hypothetical protein  27.53 
 
 		 399 aa  58.9  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.035454  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1491  hypothetical protein  25.79 
 
 		 409 aa  58.5  0.0000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1929  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  25.16 
 
 		 411 aa  57  0.0000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3552  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain-containing protein  28.63 
 
 		 373 aa  55.8  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.138111  normal  0.272734 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01931  vibrioferrin biosynthesis protein PvsA  28.39 
 
 		 399 aa  54.7  0.000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0912  biotin carboxylase-like protein  24.52 
 
 		 410 aa  55.1  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.527326 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3242  hypothetical protein  26.59 
 
 		 432 aa  54.3  0.000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1007  hypothetical protein  25.27 
 
 		 427 aa  53.5  0.000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1457  hypothetical protein  24.6 
 
 		 407 aa  53.1  0.000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.939415  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0791  biotin carboxylase  26.74 
 
 		 411 aa  53.1  0.000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0200  hypothetical protein  21.23 
 
 		 405 aa  51.2  0.00004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.214933  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0177  hypothetical protein  22.48 
 
 		 411 aa  50.8  0.00005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0875  hypothetical protein  26.46 
 
 		 420 aa  50.4  0.00006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.728931 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3064  hypothetical protein  30.71 
 
 		 441 aa  50.1  0.00008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000514586 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1584  putative carbamoyl-phosphate-synthetase protein  24.9 
 
 		 393 aa  49.7  0.00009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0344  phosphoribosylglycinamide synthetase  27.27 
 
 		 424 aa  48.9  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3660  hypothetical protein  29.51 
 
 		 411 aa  48.5  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.853995  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6148  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  27.34 
 
 		 408 aa  48.5  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.631903 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2148  hypothetical protein  30.33 
 
 		 414 aa  48.9  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.149546 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1388  hypothetical protein  22.53 
 
 		 395 aa  48.1  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0314212 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_37283  predicted protein  24.33 
 
 		 1033 aa  47  0.0006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4786  hypothetical protein  27.17 
 
 		 398 aa  47.4  0.0006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1268  phosphoribosylglycinamide synthetase  23.39 
 
 		 400 aa  46.6  0.001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.584392  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7724  putative biotin carboxylase  26.99 
 
 		 430 aa  45.4  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.211642  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3365  putative carbamoyl-phosphate-synthetase protein  25.11 
 
 		 384 aa  45.4  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.131382  normal  0.291758 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2162  hypothetical protein  28.97 
 
 		 414 aa  44.7  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.337945  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2135  phosphoribosylglycinamide synthetase  25.66 
 
 		 412 aa  44.3  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.165665  normal  0.504192 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3468  hypothetical protein  30.34 
 
 		 425 aa  43.9  0.006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>