99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3660 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_3660  hypothetical protein  100 
 
 
411 aa  791    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.853995  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0194  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain-containing protein ATP-grasp  37.63 
 
 
419 aa  202  9.999999999999999e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.296569  normal  0.160479 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4648  protein of unknown function DUF201  31.56 
 
 
404 aa  104  3e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.896666  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1432  hypothetical protein  33.62 
 
 
424 aa  95.5  1e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.502147  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1929  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  29.41 
 
 
411 aa  94.7  2e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0170  phosphoribosylglycinamide synthetase ATP-grasp domain-containing protein  28.32 
 
 
407 aa  93.6  5e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0292  phosphoribosylglycinamide synthetase, ATP-grasp  28.32 
 
 
407 aa  93.6  5e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2987  phosphoribosylglycinamide synthetase  29.77 
 
 
410 aa  90.1  6e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.0000000000875543  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2144  phosphoribosylglycinamide synthetase  32.65 
 
 
416 aa  90.1  6e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0250211 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7725  hypothetical protein  28.12 
 
 
411 aa  89.7  8e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.10668  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4500  Cysteine synthase  33.33 
 
 
756 aa  89  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.632569  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1270  protein of unknown function DUF201  27.24 
 
 
399 aa  87.8  3e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.964812  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2251  phosphoribosylglycinamide synthetase  30.33 
 
 
418 aa  87.4  4e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000511987 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1423  protein of unknown function DUF201  31.95 
 
 
424 aa  86.3  9e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.369206  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1518  protein of unknown function DUF201  31.66 
 
 
424 aa  85.9  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2020  phosphoribosylglycinamide synthetase  29.79 
 
 
407 aa  85.9  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2668  phosphoribosylglycinamide synthetase  34.02 
 
 
415 aa  85.5  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0573  phosphoribosylglycinamide synthetase  29.15 
 
 
420 aa  85.5  0.000000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.23534  normal  0.22349 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5090  hypothetical protein  29.1 
 
 
453 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5770  hypothetical protein  29.1 
 
 
453 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0282385 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0449  putative glycolate oxidase  26.06 
 
 
404 aa  82.8  0.000000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2440  biotin carboxylase-like  31.53 
 
 
424 aa  82.4  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.459774  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03057  hypothetical protein  28.84 
 
 
449 aa  80.9  0.00000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.450613  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33390  biotin carboxylase  29.87 
 
 
428 aa  80.1  0.00000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.465269 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0418  hypothetical protein  32.26 
 
 
411 aa  79.3  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2135  phosphoribosylglycinamide synthetase  28.57 
 
 
412 aa  79.7  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.165665  normal  0.504192 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1164  protein of unknown function DUF201  25.5 
 
 
437 aa  78.2  0.0000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3265  hypothetical protein  26.79 
 
 
412 aa  77.8  0.0000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0755  protein of unknown function DUF201  28.23 
 
 
398 aa  77.8  0.0000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2737  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  30.13 
 
 
723 aa  77  0.0000000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3626  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  29.48 
 
 
432 aa  75.1  0.000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0200  hypothetical protein  26.67 
 
 
405 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.214933  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2438  hypothetical protein  32.94 
 
 
410 aa  73.2  0.000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.658373 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8363  putative siderophore biosynthesis protein  32.68 
 
 
401 aa  72.8  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2959  phosphoribosylglycinamide synthetase  27.44 
 
 
405 aa  69.7  0.0000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2428  protein of unknown function DUF201  30.8 
 
 
402 aa  69.3  0.0000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.281403  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3064  hypothetical protein  33.64 
 
 
441 aa  69.3  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000514586 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4069  phosphoribosylglycinamide synthetase ATP-grasp domain-containing protein  25.87 
 
 
389 aa  68.2  0.0000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0754  protein of unknown function DUF201  25.5 
 
 
409 aa  66.6  0.0000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0730  hypothetical protein  26.8 
 
 
436 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1401  protein of unknown function DUF201  26.53 
 
 
409 aa  65.9  0.000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1119  biotin carboxylase  28.93 
 
 
411 aa  65.9  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4786  hypothetical protein  28.38 
 
 
398 aa  62  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3552  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain-containing protein  29.09 
 
 
373 aa  61.2  0.00000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.138111  normal  0.272734 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0619  phosphoribosylglycinamide synthetase  25.57 
 
 
410 aa  61.6  0.00000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.241949  hitchhiker  0.00233057 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1514  hypothetical protein  27.27 
 
 
412 aa  61.2  0.00000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0721  hypothetical protein  28.74 
 
 
402 aa  60.8  0.00000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.446517 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3192  argininosuccinate lyase  30.46 
 
 
924 aa  60.5  0.00000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.655648  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3245  hypothetical protein  21.45 
 
 
419 aa  60.5  0.00000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.837509  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37420  biotin carboxylase  27.97 
 
 
405 aa  60.1  0.00000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.442231 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3759  protein of unknown function DUF201  31.27 
 
 
425 aa  60.1  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1396  argininosuccinate lyase  30.26 
 
 
926 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_37283  predicted protein  24.89 
 
 
1033 aa  58.5  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2595  putative carbamoyl-phosphate-synthetase  23.51 
 
 
398 aa  57.8  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.605395  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1971  argininosuccinate lyase  28.32 
 
 
891 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2560  argininosuccinate lyase  29.87 
 
 
904 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2507  argininosuccinate lyase  29.35 
 
 
912 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2646  argininosuccinate lyase  29.55 
 
 
904 aa  56.6  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2209  CarB family protein  23.14 
 
 
543 aa  55.1  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.304362  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2122  argininosuccinate lyase  32.86 
 
 
894 aa  55.5  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1620  argininosuccinate lyase  32.86 
 
 
896 aa  55.5  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1268  phosphoribosylglycinamide synthetase  21.05 
 
 
400 aa  54.7  0.000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.584392  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0791  biotin carboxylase  25.29 
 
 
411 aa  54.3  0.000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4068  hypothetical protein  25.1 
 
 
413 aa  53.5  0.000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3242  hypothetical protein  29.1 
 
 
432 aa  53.1  0.000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2986  carbamoyl-phosphate synthase large chain  20.77 
 
 
431 aa  52.8  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.556183  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0183  D-alanine--D-alanine ligase  25.93 
 
 
337 aa  51.6  0.00003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0000736036  normal  0.566039 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2969  hypothetical protein  30.49 
 
 
402 aa  50.8  0.00004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1717  hypothetical protein  27.72 
 
 
468 aa  50.8  0.00005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000202258 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6153  protein of unknown function DUF201  27.92 
 
 
397 aa  50.4  0.00006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.496627  normal  0.0716856 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0006  hypothetical protein  23.64 
 
 
387 aa  49.7  0.00009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1724  protein of unknown function DUF201  26.67 
 
 
401 aa  49.3  0.0001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3256  putative carbamoyl-phosphate synthase large chain  20.42 
 
 
420 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.077916  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2162  hypothetical protein  23.83 
 
 
414 aa  48.5  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.337945  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0344  phosphoribosylglycinamide synthetase  22.63 
 
 
424 aa  48.9  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0240  hypothetical protein  21.08 
 
 
410 aa  48.5  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1498  biotin carboxylase-like  29.97 
 
 
428 aa  47  0.0006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0924  D-alanine--D-alanine ligase  28.84 
 
 
313 aa  47  0.0006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.783773  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2022  argininosuccinate lyase  28.16 
 
 
900 aa  47  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.10658  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2158  argininosuccinate lyase  28.16 
 
 
914 aa  47  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2002  argininosuccinate lyase  28.16 
 
 
900 aa  47  0.0007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.848902  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01931  vibrioferrin biosynthesis protein PvsA  25.41 
 
 
399 aa  46.6  0.0007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0960  phosphoribosylamine/glycine ligase  26.64 
 
 
430 aa  46.6  0.0009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4090  hypothetical protein  23.55 
 
 
414 aa  45.4  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.572464  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0169  D-alanine--D-alanine ligase  24.28 
 
 
337 aa  45.8  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0022958  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6302  hypothetical protein  27.99 
 
 
401 aa  45.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0344575  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0875  hypothetical protein  25.11 
 
 
420 aa  44.7  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.728931 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0072  hypothetical protein  23.55 
 
 
414 aa  44.7  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4524  Biotin carboxylase-like protein  23.77 
 
 
403 aa  44.7  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.799309  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0240  hypothetical protein  22.49 
 
 
410 aa  44.3  0.004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4142  hypothetical protein  23.55 
 
 
414 aa  44.3  0.004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.16964  normal  0.023954 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5518  phosphoribosylglycinamide synthetase  29.19 
 
 
403 aa  43.9  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.398662  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0127  phosphoribosylamine/glycine ligase  25.99 
 
 
413 aa  43.5  0.006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5882  phosphoribosylglycinamide synthetase  29.19 
 
 
403 aa  43.9  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.47867 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0029  protein of unknown function DUF201  23.93 
 
 
386 aa  43.9  0.006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1270  protein of unknown function DUF201  32.89 
 
 
322 aa  43.9  0.006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.462862 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0996  phosphoribosylglycinamide synthetase  20.33 
 
 
541 aa  43.5  0.006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000037072 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0177  hypothetical protein  23.11 
 
 
411 aa  43.5  0.007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6391  phosphoribosylglycinamide synthetase  29.89 
 
 
403 aa  43.1  0.009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.782672  normal  0.167257 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>