More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2668 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_2668  phosphoribosylglycinamide synthetase  100 
 
 		 415 aa  819    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2144  phosphoribosylglycinamide synthetase  61.17 
 
 		 416 aa  493  9.999999999999999e-139  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0250211 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3626  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  41.98 
 
 		 432 aa  274  2.0000000000000002e-72  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4648  protein of unknown function DUF201  36.82 
 
 		 404 aa  213  4.9999999999999996e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.896666  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4500  Cysteine synthase  37.12 
 
 		 756 aa  140  3.9999999999999997e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.632569  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1929  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  26.56 
 
 		 411 aa  105  2e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0170  phosphoribosylglycinamide synthetase ATP-grasp domain-containing protein  24.93 
 
 		 407 aa  103  6e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0292  phosphoribosylglycinamide synthetase, ATP-grasp  24.93 
 
 		 407 aa  103  6e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1270  protein of unknown function DUF201  27.03 
 
 		 399 aa  99  2e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.964812  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33390  biotin carboxylase  30.63 
 
 		 428 aa  97.1  5e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.465269 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3192  argininosuccinate lyase  30.9 
 
 		 924 aa  94.7  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.655648  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1396  argininosuccinate lyase  30.73 
 
 		 926 aa  94  4e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2020  phosphoribosylglycinamide synthetase  28.08 
 
 		 407 aa  94.4  4e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2440  biotin carboxylase-like  29.25 
 
 		 424 aa  93.2  7e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.459774  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2507  argininosuccinate lyase  30.22 
 
 		 912 aa  93.2  7e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1518  protein of unknown function DUF201  28.26 
 
 		 424 aa  92.8  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2560  argininosuccinate lyase  30.39 
 
 		 904 aa  92.4  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2646  argininosuccinate lyase  30.39 
 
 		 904 aa  92  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2428  protein of unknown function DUF201  29.38 
 
 		 402 aa  92  2e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.281403  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1423  protein of unknown function DUF201  28.09 
 
 		 424 aa  90.9  4e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.369206  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0194  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain-containing protein ATP-grasp  34.52 
 
 		 419 aa  90.1  7e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.296569  normal  0.160479 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1971  argininosuccinate lyase  30.99 
 
 		 891 aa  89.7  9e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2022  argininosuccinate lyase  32.46 
 
 		 900 aa  89.4  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.10658  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2251  phosphoribosylglycinamide synthetase  26.65 
 
 		 418 aa  89  1e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000511987 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2987  phosphoribosylglycinamide synthetase  25.53 
 
 		 410 aa  89  2e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.0000000000875543  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2158  argininosuccinate lyase  31.8 
 
 		 914 aa  88.6  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2002  argininosuccinate lyase  32.46 
 
 		 900 aa  88.6  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.848902  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3759  protein of unknown function DUF201  36.49 
 
 		 425 aa  88.6  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2737  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  24.43 
 
 		 723 aa  87.8  4e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2122  argininosuccinate lyase  30.34 
 
 		 894 aa  87.4  4e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1620  argininosuccinate lyase  30.17 
 
 		 896 aa  86.7  7e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1388  hypothetical protein  24.92 
 
 		 395 aa  86.7  7e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0314212 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2438  hypothetical protein  33.75 
 
 		 410 aa  86.7  8e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.658373 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1164  protein of unknown function DUF201  24.88 
 
 		 437 aa  81.3  0.00000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5090  hypothetical protein  27.01 
 
 		 453 aa  81.6  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5770  hypothetical protein  27.01 
 
 		 453 aa  81.6  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0282385 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3660  hypothetical protein  34.02 
 
 		 411 aa  79.7  0.00000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.853995  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37420  biotin carboxylase  27.55 
 
 		 405 aa  78.2  0.0000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.442231 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7725  hypothetical protein  29.65 
 
 		 411 aa  76.3  0.0000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.10668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0875  hypothetical protein  27.4 
 
 		 420 aa  75.5  0.000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.728931 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0573  phosphoribosylglycinamide synthetase  25.3 
 
 		 420 aa  74.7  0.000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.23534  normal  0.22349 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6150  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  26.69 
 
 		 410 aa  74.7  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.639194 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2663  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  25.85 
 
 		 413 aa  74.3  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2162  hypothetical protein  27.99 
 
 		 414 aa  74.3  0.000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.337945  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3242  hypothetical protein  26.69 
 
 		 432 aa  73.6  0.000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3265  hypothetical protein  25.14 
 
 		 412 aa  72.8  0.00000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0754  protein of unknown function DUF201  24.7 
 
 		 409 aa  72.8  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3064  hypothetical protein  36.6 
 
 		 441 aa  71.6  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000514586 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0200  hypothetical protein  26.41 
 
 		 405 aa  71.2  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.214933  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4142  hypothetical protein  30.77 
 
 		 414 aa  70.1  0.00000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.16964  normal  0.023954 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0072  hypothetical protein  30.77 
 
 		 414 aa  69.7  0.00000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4090  hypothetical protein  30.77 
 
 		 414 aa  69.7  0.00000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.572464  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1401  protein of unknown function DUF201  25.61 
 
 		 409 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1432  hypothetical protein  27.76 
 
 		 424 aa  69.7  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.502147  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2135  phosphoribosylglycinamide synthetase  28.07 
 
 		 412 aa  69.3  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.165665  normal  0.504192 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1119  biotin carboxylase  27.03 
 
 		 411 aa  68.6  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0449  putative glycolate oxidase  26.13 
 
 		 404 aa  67.8  0.0000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1498  biotin carboxylase-like  35.98 
 
 		 428 aa  67.8  0.0000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1007  hypothetical protein  29.34 
 
 		 427 aa  67.4  0.0000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4068  hypothetical protein  32.76 
 
 		 413 aa  67.4  0.0000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6153  protein of unknown function DUF201  29.86 
 
 		 397 aa  67  0.0000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.496627  normal  0.0716856 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3365  putative carbamoyl-phosphate-synthetase protein  26.64 
 
 		 384 aa  67  0.0000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.131382  normal  0.291758 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4069  phosphoribosylglycinamide synthetase ATP-grasp domain-containing protein  29.15 
 
 		 389 aa  65.9  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1724  protein of unknown function DUF201  27.14 
 
 		 401 aa  66.2  0.000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1712  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  29.79 
 
 		 1126 aa  63.9  0.000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.00812238  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03057  hypothetical protein  25.67 
 
 		 449 aa  63.5  0.000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.450613  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0875  hypothetical protein  25.94 
 
 		 414 aa  63.5  0.000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0418  hypothetical protein  27.53 
 
 		 411 aa  63.2  0.000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5132  phosphoribosylamine/glycine ligase  33.33 
 
 		 420 aa  63.2  0.000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2148  hypothetical protein  25.53 
 
 		 414 aa  62  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.149546 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0320  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  29.33 
 
 		 1078 aa  62  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.000000336143  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0996  phosphoribosylglycinamide synthetase  26.79 
 
 		 541 aa  61.2  0.00000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000037072 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6598  phosphoribosylamine/glycine ligase  28.63 
 
 		 423 aa  61.2  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.204932  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3093  hypothetical protein  27.13 
 
 		 440 aa  60.8  0.00000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1514  hypothetical protein  24.79 
 
 		 412 aa  60.8  0.00000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0619  phosphoribosylglycinamide synthetase  24.9 
 
 		 410 aa  59.7  0.00000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.241949  hitchhiker  0.00233057 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_37283  predicted protein  30.93 
 
 		 1033 aa  59.7  0.00000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01931  vibrioferrin biosynthesis protein PvsA  28.02 
 
 		 399 aa  59.7  0.00000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3713  carbamoyl phosphate synthase large subunit  27.67 
 
 		 1072 aa  59.3  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0714  carbamoyl phosphate synthase large subunit  28.63 
 
 		 1074 aa  59.3  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.278068 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0541  carbamoyl phosphate synthase large subunit  28.11 
 
 		 1066 aa  59.3  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1262  carbamoyl phosphate synthase large subunit  26.79 
 
 		 1057 aa  58.5  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2886  carbamoyl phosphate synthase large subunit  28.12 
 
 		 1082 aa  58.9  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.827795  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1287  carbamoyl phosphate synthase large subunit  26.79 
 
 		 1057 aa  58.5  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.867856  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7724  putative biotin carboxylase  26.56 
 
 		 430 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.211642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0344  phosphoribosylglycinamide synthetase  27.54 
 
 		 424 aa  58.2  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1917  carbamoyl phosphate synthase large subunit  26.5 
 
 		 1065 aa  58.2  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3453  carbamoyl phosphate synthase large subunit  27.43 
 
 		 1077 aa  58.2  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.755127  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2118  carbamoyl phosphate synthase large subunit  30.29 
 
 		 1077 aa  57.8  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0172  phosphoribosylamine--glycine ligase  31.79 
 
 		 429 aa  58.2  0.0000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2197  carbamoyl-phosphate synthase large subunit  25.89 
 
 		 1102 aa  58.2  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1281  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  27.44 
 
 		 1074 aa  58.2  0.0000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3582  carbamoyl phosphate synthase large subunit  27.43 
 
 		 1077 aa  58.2  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0783  carbamoyl phosphate synthase large subunit  27.43 
 
 		 1077 aa  58.2  0.0000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.523621  normal  0.328934 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2038  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  28.85 
 
 		 1109 aa  57.4  0.0000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00373357 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3840  carbamoyl phosphate synthase large subunit  26.99 
 
 		 1074 aa  57.4  0.0000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0177  hypothetical protein  23.55 
 
 		 411 aa  57.4  0.0000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3647  carbamoyl phosphate synthase large subunit  27.43 
 
 		 1074 aa  57.8  0.0000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2503  carbamoyl phosphate synthase large subunit  26.82 
 
 		 1076 aa  57.8  0.0000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1012  carbamoyl-phosphate synthase large subunit  28.64 
 
 		 1079 aa  57.4  0.0000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>