20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_1475 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_1457  hypothetical protein  86.98 
 
 
407 aa  748    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.939415  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1475  hypothetical protein  100 
 
 
407 aa  839    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.843921 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1915  hypothetical protein  75.06 
 
 
432 aa  662    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.402909  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1491  hypothetical protein  81.77 
 
 
409 aa  706    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4524  Biotin carboxylase-like protein  23.9 
 
 
403 aa  60.1  0.00000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.799309  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7725  hypothetical protein  25 
 
 
411 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.10668  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1498  biotin carboxylase-like  25.66 
 
 
428 aa  57.4  0.0000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0170  phosphoribosylglycinamide synthetase ATP-grasp domain-containing protein  31.62 
 
 
407 aa  53.5  0.000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0292  phosphoribosylglycinamide synthetase, ATP-grasp  31.62 
 
 
407 aa  53.5  0.000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2023  hypothetical protein  22.9 
 
 
408 aa  49.7  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6148  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  22.09 
 
 
408 aa  48.5  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.631903 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1401  protein of unknown function DUF201  23.66 
 
 
409 aa  47  0.0006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37420  biotin carboxylase  25 
 
 
405 aa  46.6  0.0008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.442231 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0791  biotin carboxylase  28.02 
 
 
411 aa  46.6  0.0009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3093  hypothetical protein  27.12 
 
 
440 aa  45.8  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0874  nikkomycin biosynthesis domain protein  24.21 
 
 
417 aa  46.2  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3673  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  21.15 
 
 
407 aa  45.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1164  protein of unknown function DUF201  21.43 
 
 
437 aa  45.4  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6149  hypothetical protein  24.68 
 
 
441 aa  44.7  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.669475 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2846  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain- containing protein  22.27 
 
 
404 aa  43.5  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.435021  normal  0.117516 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>