23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_1491 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008789  Hhal_1491  hypothetical protein  100 
 
 
409 aa  835    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1915  hypothetical protein  77.15 
 
 
432 aa  681    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.402909  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1475  hypothetical protein  81.77 
 
 
407 aa  706    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.843921 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1457  hypothetical protein  84.73 
 
 
407 aa  725    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.939415  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4524  Biotin carboxylase-like protein  26.91 
 
 
403 aa  72.4  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.799309  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7725  hypothetical protein  25.75 
 
 
411 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.10668  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2023  hypothetical protein  24.69 
 
 
408 aa  56.2  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6150  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  23.77 
 
 
410 aa  54.3  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.639194 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1498  biotin carboxylase-like  25.22 
 
 
428 aa  54.3  0.000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0010  hypothetical protein  22.35 
 
 
392 aa  50.8  0.00004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  decreased coverage  0.00788782  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0170  phosphoribosylglycinamide synthetase ATP-grasp domain-containing protein  24.88 
 
 
407 aa  50.8  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0292  phosphoribosylglycinamide synthetase, ATP-grasp  24.88 
 
 
407 aa  50.8  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2846  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain- containing protein  23.35 
 
 
404 aa  50.1  0.00007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.435021  normal  0.117516 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6148  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  23.19 
 
 
408 aa  49.7  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.631903 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6149  hypothetical protein  24.68 
 
 
441 aa  48.5  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.669475 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3673  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  23.33 
 
 
407 aa  48.5  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3093  hypothetical protein  27.03 
 
 
440 aa  47  0.0006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0875  hypothetical protein  24.64 
 
 
414 aa  46.6  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0874  nikkomycin biosynthesis domain protein  23.24 
 
 
417 aa  46.2  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06063  hypothetical protein  22.22 
 
 
349 aa  44.3  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006366  plpl0006  hypothetical protein  22.98 
 
 
387 aa  43.9  0.005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3759  protein of unknown function DUF201  28.19 
 
 
425 aa  43.5  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0791  biotin carboxylase  25.48 
 
 
411 aa  43.5  0.008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>