103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_3093 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_3093  hypothetical protein  100 
 
 		 440 aa  899    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6149  hypothetical protein  40 
 
 		 441 aa  288  1e-76  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.669475 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1498  biotin carboxylase-like  33.08 
 
 		 428 aa  99.8  9e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2987  phosphoribosylglycinamide synthetase  29.89 
 
 		 410 aa  84.7  0.000000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.0000000000875543  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0170  phosphoribosylglycinamide synthetase ATP-grasp domain-containing protein  22.31 
 
 		 407 aa  83.2  0.000000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0292  phosphoribosylglycinamide synthetase, ATP-grasp  22.31 
 
 		 407 aa  83.2  0.000000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2020  phosphoribosylglycinamide synthetase  30.7 
 
 		 407 aa  78.6  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1514  hypothetical protein  29.86 
 
 		 412 aa  77  0.0000000000007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33390  biotin carboxylase  27.14 
 
 		 428 aa  75.9  0.000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.465269 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2428  protein of unknown function DUF201  27.27 
 
 		 402 aa  71.6  0.00000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.281403  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0755  protein of unknown function DUF201  27.36 
 
 		 398 aa  70.5  0.00000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3626  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  27.27 
 
 		 432 aa  70.1  0.00000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2144  phosphoribosylglycinamide synthetase  28.26 
 
 		 416 aa  68.6  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0250211 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0754  protein of unknown function DUF201  27.24 
 
 		 409 aa  67.4  0.0000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1270  protein of unknown function DUF201  30 
 
 		 399 aa  64.3  0.000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.964812  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2986  carbamoyl-phosphate synthase large chain  25.81 
 
 		 431 aa  62.4  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.556183  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2668  phosphoribosylglycinamide synthetase  27.13 
 
 		 415 aa  61.6  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6153  protein of unknown function DUF201  26.44 
 
 		 397 aa  61.2  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.496627  normal  0.0716856 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3245  hypothetical protein  24.47 
 
 		 419 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.837509  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2595  putative carbamoyl-phosphate-synthetase  24.78 
 
 		 398 aa  58.9  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.605395  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3256  putative carbamoyl-phosphate synthase large chain  23.37 
 
 		 420 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.077916  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4648  protein of unknown function DUF201  28.03 
 
 		 404 aa  58.2  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.896666  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1941  hypothetical protein  22.57 
 
 		 428 aa  57.8  0.0000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37420  biotin carboxylase  24.26 
 
 		 405 aa  57.8  0.0000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.442231 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2969  hypothetical protein  27.65 
 
 		 402 aa  57.4  0.0000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1388  hypothetical protein  24.15 
 
 		 395 aa  57.4  0.0000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0314212 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0619  phosphoribosylglycinamide synthetase  28.12 
 
 		 410 aa  57.4  0.0000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.241949  hitchhiker  0.00233057 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0010  hypothetical protein  23.29 
 
 		 392 aa  56.6  0.0000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  decreased coverage  0.00788782  n/a   
 
 
-
 
NC_006366  plpl0006  hypothetical protein  23.04 
 
 		 387 aa  55.8  0.000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3838  hypothetical protein  21.85 
 
 		 428 aa  55.8  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1724  protein of unknown function DUF201  29.14 
 
 		 401 aa  56.2  0.000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4069  phosphoribosylglycinamide synthetase ATP-grasp domain-containing protein  30 
 
 		 389 aa  55.5  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7725  hypothetical protein  28.89 
 
 		 411 aa  55.8  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.10668  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0875  hypothetical protein  26.2 
 
 		 414 aa  54.3  0.000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4982  D-alanine--D-alanine ligase  28.25 
 
 		 319 aa  54.3  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.380222  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2148  hypothetical protein  26.72 
 
 		 414 aa  54.3  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.149546 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2251  phosphoribosylglycinamide synthetase  26.27 
 
 		 418 aa  54.3  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000511987 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001066  vibrioferrin ligase/carboxylase protein PvsA  29.17 
 
 		 403 aa  54.3  0.000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_37283  predicted protein  23.41 
 
 		 1033 aa  53.5  0.000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0194  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain-containing protein ATP-grasp  28.02 
 
 		 419 aa  53.9  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.296569  normal  0.160479 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3748  protein of unknown function DUF201  26.64 
 
 		 388 aa  53.5  0.000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.277412  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22630  biotin carboxylase  30.91 
 
 		 333 aa  53.5  0.000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.405302 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3192  argininosuccinate lyase  26.2 
 
 		 924 aa  52.8  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.655648  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2135  phosphoribosylglycinamide synthetase  24.8 
 
 		 412 aa  52.8  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.165665  normal  0.504192 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2158  argininosuccinate lyase  27.97 
 
 		 914 aa  52  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1396  argininosuccinate lyase  25.97 
 
 		 926 aa  52  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2209  CarB family protein  25.19 
 
 		 543 aa  51.6  0.00003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.304362  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2646  argininosuccinate lyase  25.53 
 
 		 904 aa  51.6  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4786  hypothetical protein  25.09 
 
 		 398 aa  51.6  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57320  D-alanine--D-alanine ligase  27.95 
 
 		 319 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2002  argininosuccinate lyase  27.97 
 
 		 900 aa  51.6  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.848902  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2022  argininosuccinate lyase  27.97 
 
 		 900 aa  51.2  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.10658  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4068  hypothetical protein  23.76 
 
 		 413 aa  51.2  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2162  hypothetical protein  28 
 
 		 414 aa  51.6  0.00003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.337945  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0573  phosphoribosylglycinamide synthetase  24.64 
 
 		 420 aa  51.2  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.23534  normal  0.22349 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3136  putative siderophore biosynthesis protein  25.22 
 
 		 388 aa  51.2  0.00004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2846  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain- containing protein  23.58 
 
 		 404 aa  50.8  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.435021  normal  0.117516 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2507  argininosuccinate lyase  25.32 
 
 		 912 aa  50.4  0.00006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2560  argininosuccinate lyase  25.53 
 
 		 904 aa  50.4  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2188  D-alanine--D-alanine ligase  24.45 
 
 		 314 aa  50.1  0.00008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.441149  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1270  protein of unknown function DUF201  27.91 
 
 		 322 aa  50.1  0.00009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.462862 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1339  D-alanine--D-alanine ligase  26.61 
 
 		 318 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.266833  normal  0.0340242 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2122  argininosuccinate lyase  26.2 
 
 		 894 aa  49.7  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0177  hypothetical protein  24.35 
 
 		 411 aa  49.7  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2438  hypothetical protein  26.64 
 
 		 410 aa  49.3  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.658373 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2737  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  24.39 
 
 		 723 aa  49.3  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1620  argininosuccinate lyase  25.97 
 
 		 896 aa  48.9  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4510  D-alanine--D-alanine ligase  26.18 
 
 		 318 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.926971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3759  protein of unknown function DUF201  24.04 
 
 		 425 aa  48.5  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1971  argininosuccinate lyase  26.64 
 
 		 891 aa  48.5  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0946  D-alanine--D-alanine ligase  24.67 
 
 		 318 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.427679  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7724  putative biotin carboxylase  27.63 
 
 		 430 aa  48.1  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.211642  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0240  hypothetical protein  25.63 
 
 		 410 aa  47.8  0.0004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1457  hypothetical protein  27.03 
 
 		 407 aa  47.8  0.0004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.939415  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1279  hypothetical protein  23.75 
 
 		 411 aa  47.8  0.0004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.406455  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2663  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  26.17 
 
 		 413 aa  47.8  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0240  hypothetical protein  25.63 
 
 		 410 aa  47.4  0.0005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0449  putative glycolate oxidase  22.78 
 
 		 404 aa  47.4  0.0006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1553  phosphoribosylglycinamide synthetase, ATP-grasp, putative  25.43 
 
 		 267 aa  47  0.0006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0689  D-alanyl-alanine synthetase A  30.63 
 
 		 303 aa  47.4  0.0006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000234965  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4500  Cysteine synthase  26.3 
 
 		 756 aa  47  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.632569  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0874  nikkomycin biosynthesis domain protein  22.33 
 
 		 417 aa  47  0.0007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1491  hypothetical protein  27.03 
 
 		 409 aa  47  0.0007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0924  D-alanine--D-alanine ligase  26.6 
 
 		 313 aa  46.6  0.0009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.783773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0665  D-alanyl-alanine synthetase A  32.43 
 
 		 303 aa  46.6  0.0009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000619225  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1475  hypothetical protein  27.12 
 
 		 407 aa  45.8  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.843921 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4385  D-alanine--D-alanine ligase  25.75 
 
 		 318 aa  46.2  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0215233  normal  0.165436 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1584  putative carbamoyl-phosphate-synthetase protein  22.17 
 
 		 393 aa  45.8  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0054  phosphoribosylamine/glycine ligase  24.38 
 
 		 403 aa  45.4  0.002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03057  hypothetical protein  26.02 
 
 		 449 aa  45.1  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.450613  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4671  D-alanine--D-alanine ligase  26.32 
 
 		 324 aa  44.7  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0129578  normal  0.448814 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1915  hypothetical protein  28.81 
 
 		 432 aa  45.1  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.402909  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2514  D-alanyl-alanine synthetase A  38.46 
 
 		 382 aa  44.7  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.94876  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1164  protein of unknown function DUF201  26.82 
 
 		 437 aa  44.7  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2026  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  22.96 
 
 		 423 aa  44.3  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0418  hypothetical protein  26.97 
 
 		 411 aa  44.3  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0791  biotin carboxylase  26.63 
 
 		 411 aa  43.9  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0741  carbamoyl phosphate synthase large subunit  22.86 
 
 		 1040 aa  43.9  0.006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2550  D-alanine--D-alanine ligase  26.9 
 
 		 319 aa  43.9  0.006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.352521  normal  0.520823 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0135  D-alanine--D-alanine ligase  26 
 
 		 336 aa  43.5  0.007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.71803  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>