25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene plpp0010 on replicon NC_006365
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006365  plpp0010  hypothetical protein  100 
 
 
392 aa  803    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  decreased coverage  0.00788782  n/a   
 
 
-
 
NC_006366  plpl0006  hypothetical protein  84.24 
 
 
387 aa  694    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2595  putative carbamoyl-phosphate-synthetase  26.67 
 
 
398 aa  67.8  0.0000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.605395  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06054  hypothetical protein  24.69 
 
 
329 aa  65.9  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3673  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  20.76 
 
 
407 aa  59.3  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2846  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain- containing protein  24.37 
 
 
404 aa  59.3  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.435021  normal  0.117516 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3093  hypothetical protein  23.29 
 
 
440 aa  56.6  0.0000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6148  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  21.52 
 
 
408 aa  52.4  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.631903 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1491  hypothetical protein  22.35 
 
 
409 aa  50.8  0.00004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6149  hypothetical protein  28.65 
 
 
441 aa  49.3  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.669475 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2986  carbamoyl-phosphate synthase large chain  24.31 
 
 
431 aa  48.9  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.556183  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2023  hypothetical protein  21.41 
 
 
408 aa  48.5  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3245  hypothetical protein  23.92 
 
 
419 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.837509  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0875  hypothetical protein  23.67 
 
 
414 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3256  putative carbamoyl-phosphate synthase large chain  23.92 
 
 
420 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.077916  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2026  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  23.53 
 
 
423 aa  47.4  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0755  protein of unknown function DUF201  22.03 
 
 
398 aa  46.6  0.0008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0292  phosphoribosylglycinamide synthetase, ATP-grasp  26.07 
 
 
407 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0170  phosphoribosylglycinamide synthetase ATP-grasp domain-containing protein  26.07 
 
 
407 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7724  putative biotin carboxylase  21.89 
 
 
430 aa  45.4  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.211642  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0200  hypothetical protein  23.04 
 
 
405 aa  45.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.214933  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1457  hypothetical protein  22.06 
 
 
407 aa  43.9  0.004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.939415  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3064  hypothetical protein  30.97 
 
 
441 aa  43.5  0.007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000514586 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37420  biotin carboxylase  22.62 
 
 
405 aa  43.1  0.008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.442231 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2162  hypothetical protein  26.67 
 
 
414 aa  43.1  0.009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.337945  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>