68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp0240 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006368  lpp0240  hypothetical protein  100 
 
 
410 aa  837    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0240  hypothetical protein  96.59 
 
 
410 aa  816    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2432  hypothetical protein  32.22 
 
 
430 aa  192  1e-47  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1007  hypothetical protein  30.32 
 
 
427 aa  175  9.999999999999999e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0996  phosphoribosylglycinamide synthetase  34.96 
 
 
541 aa  168  2e-40  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000037072 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0416  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.19 
 
 
726 aa  167  2.9999999999999998e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0147603  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0875  hypothetical protein  29.56 
 
 
420 aa  160  3e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.728931 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2162  hypothetical protein  28.85 
 
 
414 aa  151  2e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.337945  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0344  phosphoribosylglycinamide synthetase  30.67 
 
 
424 aa  150  4e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4090  hypothetical protein  28.47 
 
 
414 aa  140  3.9999999999999997e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.572464  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4142  hypothetical protein  28.47 
 
 
414 aa  139  7.999999999999999e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.16964  normal  0.023954 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0072  hypothetical protein  28.47 
 
 
414 aa  139  8.999999999999999e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5515  phosphoribosylglycinamide synthetase  27.38 
 
 
422 aa  137  4e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.330375  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5879  phosphoribosylglycinamide synthetase  27.38 
 
 
422 aa  137  4e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.521142  normal  0.293972 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6388  phosphoribosylglycinamide synthetase  27.18 
 
 
422 aa  135  9e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.357309  normal  0.160447 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_37283  predicted protein  29.17 
 
 
1033 aa  127  2.0000000000000002e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2135  phosphoribosylglycinamide synthetase  26.76 
 
 
412 aa  110  6e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.165665  normal  0.504192 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44930  predicted protein  26.36 
 
 
575 aa  94.7  3e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.541672  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0912  biotin carboxylase-like protein  23.74 
 
 
410 aa  84.7  0.000000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.527326 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2987  phosphoribosylglycinamide synthetase  24.42 
 
 
410 aa  80.9  0.00000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.0000000000875543  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0292  phosphoribosylglycinamide synthetase, ATP-grasp  23.74 
 
 
407 aa  70.9  0.00000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0170  phosphoribosylglycinamide synthetase ATP-grasp domain-containing protein  23.74 
 
 
407 aa  70.9  0.00000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1929  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  25.44 
 
 
411 aa  67.4  0.0000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2144  phosphoribosylglycinamide synthetase  26.82 
 
 
416 aa  65.1  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0250211 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2020  phosphoribosylglycinamide synthetase  22.37 
 
 
407 aa  64.3  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37420  biotin carboxylase  23.18 
 
 
405 aa  60.5  0.00000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.442231 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3265  hypothetical protein  24.56 
 
 
412 aa  58.5  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3064  hypothetical protein  28.95 
 
 
441 aa  58.9  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000514586 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1688  phosphoribosylamine/glycine ligase  25.85 
 
 
430 aa  57.4  0.0000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7725  hypothetical protein  22.13 
 
 
411 aa  56.2  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.10668  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2668  phosphoribosylglycinamide synthetase  26.36 
 
 
415 aa  55.5  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1270  protein of unknown function DUF201  28.92 
 
 
399 aa  55.1  0.000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.964812  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2251  phosphoribosylglycinamide synthetase  26.11 
 
 
418 aa  54.3  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000511987 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1295  phosphoribosylamine/glycine ligase  25.11 
 
 
427 aa  54.3  0.000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.058661  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33390  biotin carboxylase  25.62 
 
 
428 aa  53.5  0.000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.465269 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2980  phosphoribosylamine/glycine ligase  24.64 
 
 
430 aa  52  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2428  protein of unknown function DUF201  24.08 
 
 
402 aa  51.6  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.281403  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3673  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  21.71 
 
 
407 aa  52  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0449  putative glycolate oxidase  24.51 
 
 
404 aa  50.8  0.00004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0418  hypothetical protein  26.13 
 
 
411 aa  50.1  0.00006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2316  phosphoribosylamine/glycine ligase  23.77 
 
 
446 aa  50.4  0.00006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.306508 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2663  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  24.76 
 
 
413 aa  50.4  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0194  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain-containing protein ATP-grasp  25.73 
 
 
419 aa  50.1  0.00008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.296569  normal  0.160479 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2737  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  23.57 
 
 
723 aa  49.3  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3759  protein of unknown function DUF201  24.11 
 
 
425 aa  48.5  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4500  Cysteine synthase  27.5 
 
 
756 aa  48.9  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.632569  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0755  protein of unknown function DUF201  22.59 
 
 
398 aa  48.1  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1164  protein of unknown function DUF201  23.36 
 
 
437 aa  48.1  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3093  hypothetical protein  25.63 
 
 
440 aa  47.8  0.0004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0619  phosphoribosylglycinamide synthetase  23.97 
 
 
410 aa  47.4  0.0004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.241949  hitchhiker  0.00233057 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4069  phosphoribosylglycinamide synthetase ATP-grasp domain-containing protein  23.38 
 
 
389 aa  47  0.0006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3660  hypothetical protein  21.55 
 
 
411 aa  47  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.853995  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8363  putative siderophore biosynthesis protein  21.69 
 
 
401 aa  46.6  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0924  phosphoribosylamine--glycine ligase  24.45 
 
 
421 aa  45.8  0.001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0506  phosphoribosylamine/glycine ligase  22.45 
 
 
430 aa  45.4  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.437456  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4648  protein of unknown function DUF201  24.13 
 
 
404 aa  45.1  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.896666  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5090  hypothetical protein  25.12 
 
 
453 aa  45.4  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5770  hypothetical protein  25.12 
 
 
453 aa  45.4  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0282385 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0098  protein of unknown function DUF201  26.32 
 
 
334 aa  45.4  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0200  hypothetical protein  22.29 
 
 
405 aa  44.3  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.214933  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0026  phosphoribosylamine/glycine ligase  25.1 
 
 
704 aa  44.3  0.004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2148  hypothetical protein  23.1 
 
 
414 aa  44.3  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.149546 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2440  biotin carboxylase-like  26.89 
 
 
424 aa  44.3  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.459774  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3626  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  24.86 
 
 
432 aa  43.9  0.005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0754  protein of unknown function DUF201  22.67 
 
 
409 aa  43.5  0.007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0312  phosphoribosylamine/glycine ligase  23.86 
 
 
426 aa  43.1  0.01  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1401  protein of unknown function DUF201  23.51 
 
 
409 aa  43.1  0.01  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1438  phosphoribosylamine--glycine ligase  24.9 
 
 
443 aa  42.7  0.01  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>