189 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_33390 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_33390  biotin carboxylase  100 
 
 		 428 aa  868    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.465269 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1971  argininosuccinate lyase  31.68 
 
 		 891 aa  146  8.000000000000001e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4500  Cysteine synthase  32.24 
 
 		 756 aa  140  6e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.632569  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3192  argininosuccinate lyase  32.85 
 
 		 924 aa  139  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.655648  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2507  argininosuccinate lyase  32.09 
 
 		 912 aa  138  2e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1396  argininosuccinate lyase  32.66 
 
 		 926 aa  138  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2646  argininosuccinate lyase  32.28 
 
 		 904 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2560  argininosuccinate lyase  32.29 
 
 		 904 aa  137  5e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2122  argininosuccinate lyase  32.56 
 
 		 894 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1620  argininosuccinate lyase  32.37 
 
 		 896 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2022  argininosuccinate lyase  28.71 
 
 		 900 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.10658  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2158  argininosuccinate lyase  29.09 
 
 		 914 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2002  argininosuccinate lyase  28.71 
 
 		 900 aa  130  6e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.848902  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1270  protein of unknown function DUF201  29.14 
 
 		 399 aa  128  2.0000000000000002e-28  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.964812  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2428  protein of unknown function DUF201  30.49 
 
 		 402 aa  128  2.0000000000000002e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.281403  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2438  hypothetical protein  32.27 
 
 		 410 aa  123  5e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.658373 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0170  phosphoribosylglycinamide synthetase ATP-grasp domain-containing protein  25.9 
 
 		 407 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0292  phosphoribosylglycinamide synthetase, ATP-grasp  25.9 
 
 		 407 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2020  phosphoribosylglycinamide synthetase  29.24 
 
 		 407 aa  119  9.999999999999999e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1518  protein of unknown function DUF201  30.35 
 
 		 424 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2440  biotin carboxylase-like  29.35 
 
 		 424 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.459774  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1423  protein of unknown function DUF201  30.35 
 
 		 424 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.369206  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2251  phosphoribosylglycinamide synthetase  25.86 
 
 		 418 aa  112  9e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000511987 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2987  phosphoribosylglycinamide synthetase  26.29 
 
 		 410 aa  112  2.0000000000000002e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.0000000000875543  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0754  protein of unknown function DUF201  26.82 
 
 		 409 aa  110  3e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3265  hypothetical protein  26.98 
 
 		 412 aa  109  1e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0200  hypothetical protein  26.2 
 
 		 405 aa  108  3e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.214933  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4648  protein of unknown function DUF201  32.88 
 
 		 404 aa  107  4e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.896666  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3759  protein of unknown function DUF201  30.14 
 
 		 425 aa  106  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1929  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  27.42 
 
 		 411 aa  104  3e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2737  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  23.91 
 
 		 723 aa  102  1e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1388  hypothetical protein  28.42 
 
 		 395 aa  100  4e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0314212 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1164  protein of unknown function DUF201  26.35 
 
 		 437 aa  100  7e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7725  hypothetical protein  30.79 
 
 		 411 aa  99  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.10668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0573  phosphoribosylglycinamide synthetase  25.62 
 
 		 420 aa  95.9  1e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.23534  normal  0.22349 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0449  putative glycolate oxidase  27.88 
 
 		 404 aa  95.1  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2668  phosphoribosylglycinamide synthetase  30.63 
 
 		 415 aa  95.1  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1432  hypothetical protein  28.2 
 
 		 424 aa  95.1  2e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.502147  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1401  protein of unknown function DUF201  27.25 
 
 		 409 aa  93.2  7e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0619  phosphoribosylglycinamide synthetase  25 
 
 		 410 aa  93.2  7e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.241949  hitchhiker  0.00233057 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3626  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  31.9 
 
 		 432 aa  90.1  7e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1119  biotin carboxylase  26.1 
 
 		 411 aa  89.7  9e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01931  vibrioferrin biosynthesis protein PvsA  30.6 
 
 		 399 aa  88.6  2e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37420  biotin carboxylase  26.87 
 
 		 405 aa  87  5e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.442231 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0194  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain-containing protein ATP-grasp  29.75 
 
 		 419 aa  84.3  0.000000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.296569  normal  0.160479 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2209  CarB family protein  23.71 
 
 		 543 aa  82.4  0.00000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.304362  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1724  protein of unknown function DUF201  27.4 
 
 		 401 aa  82  0.00000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4068  hypothetical protein  25.57 
 
 		 413 aa  82  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0755  protein of unknown function DUF201  24.64 
 
 		 398 aa  80.5  0.00000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5090  hypothetical protein  29.8 
 
 		 453 aa  80.1  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5770  hypothetical protein  29.8 
 
 		 453 aa  80.1  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0282385 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0418  hypothetical protein  26.56 
 
 		 411 aa  76.6  0.0000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3093  hypothetical protein  27.14 
 
 		 440 aa  76.3  0.000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4069  phosphoribosylglycinamide synthetase ATP-grasp domain-containing protein  27.02 
 
 		 389 aa  74.7  0.000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1007  hypothetical protein  24.93 
 
 		 427 aa  72.4  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3660  hypothetical protein  28.7 
 
 		 411 aa  72  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.853995  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0899  hypothetical protein  28.09 
 
 		 406 aa  72  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0718  hypothetical protein  28.09 
 
 		 406 aa  72  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.555879  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0732  hypothetical protein  28.09 
 
 		 406 aa  72  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2144  phosphoribosylglycinamide synthetase  30.45 
 
 		 416 aa  72  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0250211 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1498  biotin carboxylase-like  30.68 
 
 		 428 aa  70.5  0.00000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001066  vibrioferrin ligase/carboxylase protein PvsA  25.09 
 
 		 403 aa  68.2  0.0000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3091  PvsA  27.21 
 
 		 394 aa  67.8  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.324185  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2969  hypothetical protein  30.4 
 
 		 402 aa  67.8  0.0000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0730  hypothetical protein  24.18 
 
 		 436 aa  67  0.0000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4786  hypothetical protein  25.25 
 
 		 398 aa  66.6  0.0000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5515  phosphoribosylglycinamide synthetase  27.49 
 
 		 422 aa  66.6  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.330375  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5879  phosphoribosylglycinamide synthetase  27.49 
 
 		 422 aa  66.6  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.521142  normal  0.293972 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6153  protein of unknown function DUF201  26.95 
 
 		 397 aa  65.5  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.496627  normal  0.0716856 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2663  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  22.39 
 
 		 413 aa  65.5  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09340  hypothetical protein  26.78 
 
 		 399 aa  64.3  0.000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.035454  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1268  phosphoribosylglycinamide synthetase  20.8 
 
 		 400 aa  64.3  0.000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.584392  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2148  hypothetical protein  22.01 
 
 		 414 aa  64.3  0.000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.149546 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0996  phosphoribosylglycinamide synthetase  28.27 
 
 		 541 aa  62.8  0.00000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000037072 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5518  phosphoribosylglycinamide synthetase  26.48 
 
 		 403 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.398662  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5882  phosphoribosylglycinamide synthetase  26.48 
 
 		 403 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.47867 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3552  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain-containing protein  26.64 
 
 		 373 aa  62.4  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.138111  normal  0.272734 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6388  phosphoribosylglycinamide synthetase  26.39 
 
 		 422 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.357309  normal  0.160447 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06063  hypothetical protein  25.55 
 
 		 349 aa  62.4  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6391  phosphoribosylglycinamide synthetase  26.46 
 
 		 403 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.782672  normal  0.167257 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6302  hypothetical protein  30.42 
 
 		 401 aa  61.2  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0344575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10931  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  23.45 
 
 		 391 aa  60.1  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.224699  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3245  hypothetical protein  23.83 
 
 		 419 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.837509  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13270  D-alanine--D-alanine ligase  30.26 
 
 		 315 aa  58.9  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.122637  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14410  carbamoylphosphate synthase large subunit  26.64 
 
 		 423 aa  58.5  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2595  putative carbamoyl-phosphate-synthetase  25.23 
 
 		 398 aa  58.2  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.605395  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4982  D-alanine--D-alanine ligase  32.76 
 
 		 319 aa  58.2  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.380222  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10931  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  23.73 
 
 		 391 aa  57  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.673369  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57320  D-alanine--D-alanine ligase  28.5 
 
 		 319 aa  56.6  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2986  carbamoyl-phosphate synthase large chain  22.08 
 
 		 431 aa  55.8  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.556183  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3748  protein of unknown function DUF201  27.14 
 
 		 388 aa  56.2  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.277412  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1717  hypothetical protein  26.28 
 
 		 468 aa  55.5  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000202258 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0721  hypothetical protein  25.89 
 
 		 402 aa  55.1  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.446517 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1014  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  21.91 
 
 		 391 aa  55.1  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2135  phosphoribosylglycinamide synthetase  27.88 
 
 		 412 aa  54.7  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.165665  normal  0.504192 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0875  hypothetical protein  24.38 
 
 		 420 aa  54.7  0.000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.728931 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6975  phosphoribosylglycinamide synthetase  28.27 
 
 		 398 aa  54.7  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.646892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1514  hypothetical protein  25.35 
 
 		 412 aa  53.9  0.000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1700  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  25.68 
 
 		 1496 aa  53.9  0.000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1339  D-alanine--D-alanine ligase  26.97 
 
 		 318 aa  53.9  0.000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.266833  normal  0.0340242 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>