176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_0721 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_0721  hypothetical protein  100 
 
 		 402 aa  819    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.446517 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4786  hypothetical protein  65.16 
 
 		 398 aa  538  9.999999999999999e-153  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09340  hypothetical protein  50.25 
 
 		 399 aa  370  1e-101  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.035454  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01931  vibrioferrin biosynthesis protein PvsA  46.48 
 
 		 399 aa  335  1e-90  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3091  PvsA  46.85 
 
 		 394 aa  334  1e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.324185  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3136  putative siderophore biosynthesis protein  46.48 
 
 		 388 aa  324  1e-87  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001066  vibrioferrin ligase/carboxylase protein PvsA  44.32 
 
 		 403 aa  301  2e-80  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1279  hypothetical protein  38.77 
 
 		 411 aa  280  4e-74  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.406455  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3748  protein of unknown function DUF201  42.14 
 
 		 388 aa  270  2.9999999999999997e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.277412  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8363  putative siderophore biosynthesis protein  41.2 
 
 		 401 aa  265  1e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2969  hypothetical protein  40.43 
 
 		 402 aa  263  4e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2158  argininosuccinate lyase  27.27 
 
 		 914 aa  99.8  8e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2002  argininosuccinate lyase  27.27 
 
 		 900 aa  99.8  9e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.848902  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2022  argininosuccinate lyase  26.98 
 
 		 900 aa  96.7  6e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.10658  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0170  phosphoribosylglycinamide synthetase ATP-grasp domain-containing protein  26.86 
 
 		 407 aa  92.4  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0292  phosphoribosylglycinamide synthetase, ATP-grasp  26.86 
 
 		 407 aa  92.4  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7725  hypothetical protein  30.98 
 
 		 411 aa  86.7  6e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.10668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1270  protein of unknown function DUF201  29.13 
 
 		 399 aa  86.7  7e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.964812  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4500  Cysteine synthase  30.77 
 
 		 756 aa  86.3  8e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.632569  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3192  argininosuccinate lyase  28.99 
 
 		 924 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.655648  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3064  hypothetical protein  27.66 
 
 		 441 aa  81.3  0.00000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000514586 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1396  argininosuccinate lyase  28.75 
 
 		 926 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3265  hypothetical protein  29.03 
 
 		 412 aa  80.5  0.00000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2560  argininosuccinate lyase  28.28 
 
 		 904 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2646  argininosuccinate lyase  28.28 
 
 		 904 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2507  argininosuccinate lyase  28.05 
 
 		 912 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1620  argininosuccinate lyase  32.74 
 
 		 896 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2122  argininosuccinate lyase  32.74 
 
 		 894 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1971  argininosuccinate lyase  28.99 
 
 		 891 aa  76.3  0.0000000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0730  hypothetical protein  26.98 
 
 		 436 aa  73.9  0.000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0200  hypothetical protein  25.19 
 
 		 405 aa  73.2  0.000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.214933  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3759  protein of unknown function DUF201  29.06 
 
 		 425 aa  73.2  0.000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0755  protein of unknown function DUF201  24.52 
 
 		 398 aa  70.9  0.00000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1423  protein of unknown function DUF201  28.54 
 
 		 424 aa  68.9  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.369206  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2428  protein of unknown function DUF201  24.55 
 
 		 402 aa  68.2  0.0000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.281403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2020  phosphoribosylglycinamide synthetase  28.45 
 
 		 407 aa  68.6  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0718  hypothetical protein  24 
 
 		 406 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.555879  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1518  protein of unknown function DUF201  28.31 
 
 		 424 aa  67.4  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0899  hypothetical protein  24 
 
 		 406 aa  67  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0732  hypothetical protein  24 
 
 		 406 aa  67  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2440  biotin carboxylase-like  27.67 
 
 		 424 aa  66.6  0.0000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.459774  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1401  protein of unknown function DUF201  26.21 
 
 		 409 aa  66.6  0.0000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2987  phosphoribosylglycinamide synthetase  25.71 
 
 		 410 aa  65.9  0.000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.0000000000875543  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6153  protein of unknown function DUF201  29.94 
 
 		 397 aa  64.3  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.496627  normal  0.0716856 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1929  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  23.02 
 
 		 411 aa  64.3  0.000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2737  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  21.13 
 
 		 723 aa  64.3  0.000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1432  hypothetical protein  30.18 
 
 		 424 aa  64.7  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.502147  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1164  protein of unknown function DUF201  22.8 
 
 		 437 aa  64.3  0.000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1119  biotin carboxylase  26.87 
 
 		 411 aa  63.5  0.000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33390  biotin carboxylase  26.2 
 
 		 428 aa  61.6  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.465269 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5090  hypothetical protein  26.61 
 
 		 453 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5770  hypothetical protein  26.61 
 
 		 453 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0282385 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0573  phosphoribosylglycinamide synthetase  27.44 
 
 		 420 aa  58.5  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.23534  normal  0.22349 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4648  protein of unknown function DUF201  30.83 
 
 		 404 aa  58.2  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.896666  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3660  hypothetical protein  30.5 
 
 		 411 aa  58.2  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.853995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4068  hypothetical protein  22.16 
 
 		 413 aa  58.2  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2251  phosphoribosylglycinamide synthetase  27.35 
 
 		 418 aa  56.6  0.0000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000511987 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4069  phosphoribosylglycinamide synthetase ATP-grasp domain-containing protein  23.84 
 
 		 389 aa  56.2  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3626  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  29.66 
 
 		 432 aa  55.1  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0875  hypothetical protein  25.37 
 
 		 420 aa  55.1  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.728931 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44930  predicted protein  27.31 
 
 		 575 aa  55.5  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.541672  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0194  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain-containing protein ATP-grasp  27.56 
 
 		 419 aa  54.7  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.296569  normal  0.160479 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0449  putative glycolate oxidase  23.73 
 
 		 404 aa  53.9  0.000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2668  phosphoribosylglycinamide synthetase  26.74 
 
 		 415 aa  53.5  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0912  biotin carboxylase-like protein  26.95 
 
 		 410 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.527326 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0619  phosphoribosylglycinamide synthetase  23.01 
 
 		 410 aa  52.4  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.241949  hitchhiker  0.00233057 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2144  phosphoribosylglycinamide synthetase  24.67 
 
 		 416 aa  51.6  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0250211 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3365  putative carbamoyl-phosphate-synthetase protein  22.94 
 
 		 384 aa  51.2  0.00003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.131382  normal  0.291758 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0275  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  18.6 
 
 		 1074 aa  51.6  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0344  phosphoribosylglycinamide synthetase  23.47 
 
 		 424 aa  51.2  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0791  biotin carboxylase  25.57 
 
 		 411 aa  50.8  0.00004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2438  hypothetical protein  28.81 
 
 		 410 aa  51.2  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.658373 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3582  carbamoyl phosphate synthase large subunit  22.42 
 
 		 1077 aa  50.4  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0783  carbamoyl phosphate synthase large subunit  22.42 
 
 		 1077 aa  50.4  0.00005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.523621  normal  0.328934 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3453  carbamoyl phosphate synthase large subunit  22.42 
 
 		 1077 aa  50.4  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.755127  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0754  protein of unknown function DUF201  23.53 
 
 		 409 aa  50.4  0.00006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2959  phosphoribosylglycinamide synthetase  23.3 
 
 		 405 aa  50.4  0.00006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0714  carbamoyl phosphate synthase large subunit  22.42 
 
 		 1074 aa  50.4  0.00006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.278068 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3840  carbamoyl phosphate synthase large subunit  22.42 
 
 		 1074 aa  50.1  0.00007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3566  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  21.97 
 
 		 1073 aa  49.7  0.00009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3622  carbamoyl phosphate synthase large subunit  21.97 
 
 		 1073 aa  49.7  0.00009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.443028 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0996  phosphoribosylglycinamide synthetase  22.85 
 
 		 541 aa  49.7  0.00009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000037072 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00037  carbamoyl-phosphate synthase large subunit  21.97 
 
 		 1073 aa  49.7  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0037  carbamoyl phosphate synthase large subunit  21.97 
 
 		 1073 aa  49.7  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0767  carbamoyl phosphate synthase large subunit  23.64 
 
 		 1073 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.256868  normal  0.1584 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3647  carbamoyl phosphate synthase large subunit  22.42 
 
 		 1074 aa  49.3  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0243  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  23.79 
 
 		 558 aa  49.3  0.0001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0073  carbamoyl phosphate synthase large subunit  21.97 
 
 		 1075 aa  48.9  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.841404  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0560  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  20.28 
 
 		 1079 aa  48.9  0.0001  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0075  carbamoyl phosphate synthase large subunit  21.97 
 
 		 1075 aa  48.9  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0071  carbamoyl phosphate synthase large subunit  21.97 
 
 		 1075 aa  49.3  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2713  biotin carboxylase  25.43 
 
 		 260 aa  49.3  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2365  hypothetical protein  25.43 
 
 		 260 aa  49.3  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00036  hypothetical protein  21.97 
 
 		 1073 aa  49.7  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0592  carbamoyl phosphate synthase large subunit  21.97 
 
 		 1028 aa  49.7  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0036  carbamoyl phosphate synthase large subunit  21.97 
 
 		 1073 aa  49.7  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0033  carbamoyl phosphate synthase large subunit  21.97 
 
 		 1073 aa  49.3  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0036  carbamoyl phosphate synthase large subunit  21.97 
 
 		 1073 aa  49.7  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0034  carbamoyl phosphate synthase large subunit  21.97 
 
 		 1073 aa  49.7  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3304  carbamoyl phosphate synthase large subunit  22.17 
 
 		 1074 aa  48.5  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>