154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_2440 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_2440  biotin carboxylase-like  100 
 
 
424 aa  818    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.459774  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1423  protein of unknown function DUF201  95.99 
 
 
424 aa  746    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.369206  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1518  protein of unknown function DUF201  95.99 
 
 
424 aa  748    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1432  hypothetical protein  79.91 
 
 
424 aa  614  1e-175  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.502147  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2251  phosphoribosylglycinamide synthetase  50.96 
 
 
418 aa  368  1e-101  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000511987 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1164  protein of unknown function DUF201  40.63 
 
 
437 aa  320  3e-86  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1724  protein of unknown function DUF201  35.66 
 
 
401 aa  194  2e-48  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4500  Cysteine synthase  34.66 
 
 
756 aa  141  1.9999999999999998e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.632569  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33390  biotin carboxylase  29.62 
 
 
428 aa  122  9e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.465269 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7725  hypothetical protein  33.94 
 
 
411 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.10668  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1270  protein of unknown function DUF201  24.38 
 
 
399 aa  118  1.9999999999999998e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.964812  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0449  putative glycolate oxidase  27.2 
 
 
404 aa  114  3e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2737  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  26.57 
 
 
723 aa  110  5e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2428  protein of unknown function DUF201  28.08 
 
 
402 aa  107  4e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.281403  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1119  biotin carboxylase  28.31 
 
 
411 aa  107  5e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1929  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  26.18 
 
 
411 aa  102  1e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0573  phosphoribosylglycinamide synthetase  29.51 
 
 
420 aa  100  5e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.23534  normal  0.22349 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1388  hypothetical protein  24.87 
 
 
395 aa  100  6e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0314212 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0418  hypothetical protein  31.35 
 
 
411 aa  98.6  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4648  protein of unknown function DUF201  30.3 
 
 
404 aa  97.8  3e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.896666  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37420  biotin carboxylase  28.24 
 
 
405 aa  97.4  4e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.442231 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2144  phosphoribosylglycinamide synthetase  28.53 
 
 
416 aa  96.3  8e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0250211 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0619  phosphoribosylglycinamide synthetase  27.55 
 
 
410 aa  96.3  1e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.241949  hitchhiker  0.00233057 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2959  phosphoribosylglycinamide synthetase  25.36 
 
 
405 aa  93.6  6e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2209  CarB family protein  27.27 
 
 
543 aa  92.8  9e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.304362  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2668  phosphoribosylglycinamide synthetase  29.25 
 
 
415 aa  92.8  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2148  hypothetical protein  30.25 
 
 
414 aa  91.7  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.149546 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0754  protein of unknown function DUF201  27.78 
 
 
409 aa  90.5  5e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3265  hypothetical protein  27.22 
 
 
412 aa  87.8  3e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2663  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  27.4 
 
 
413 aa  87.4  5e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2438  hypothetical protein  29.72 
 
 
410 aa  87  5e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.658373 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1401  protein of unknown function DUF201  25.47 
 
 
409 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3759  protein of unknown function DUF201  29.14 
 
 
425 aa  85.9  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3660  hypothetical protein  31.53 
 
 
411 aa  83.2  0.000000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.853995  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3626  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  27.61 
 
 
432 aa  82  0.00000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2158  argininosuccinate lyase  32.97 
 
 
914 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2002  argininosuccinate lyase  32.97 
 
 
900 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.848902  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2020  phosphoribosylglycinamide synthetase  28.12 
 
 
407 aa  79.3  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2022  argininosuccinate lyase  32.97 
 
 
900 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.10658  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3242  hypothetical protein  26.45 
 
 
432 aa  79  0.0000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01931  vibrioferrin biosynthesis protein PvsA  30.97 
 
 
399 aa  77.8  0.0000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2595  putative carbamoyl-phosphate-synthetase  26.51 
 
 
398 aa  75.9  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.605395  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0899  hypothetical protein  28.39 
 
 
406 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0718  hypothetical protein  28.39 
 
 
406 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.555879  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0732  hypothetical protein  28.39 
 
 
406 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0996  phosphoribosylglycinamide synthetase  26.69 
 
 
541 aa  74.7  0.000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000037072 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1498  biotin carboxylase-like  30.79 
 
 
428 aa  73.9  0.000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0875  hypothetical protein  29.96 
 
 
420 aa  74.3  0.000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.728931 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5090  hypothetical protein  26.33 
 
 
453 aa  72  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5770  hypothetical protein  26.33 
 
 
453 aa  72  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0282385 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09340  hypothetical protein  31.47 
 
 
399 aa  70.5  0.00000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.035454  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3552  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain-containing protein  30.54 
 
 
373 aa  70.1  0.00000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.138111  normal  0.272734 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2162  hypothetical protein  25.48 
 
 
414 aa  67.8  0.0000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.337945  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0200  hypothetical protein  24.44 
 
 
405 aa  67.4  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.214933  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0721  hypothetical protein  27.52 
 
 
402 aa  66.6  0.0000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.446517 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3748  protein of unknown function DUF201  30.63 
 
 
388 aa  65.1  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.277412  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001066  vibrioferrin ligase/carboxylase protein PvsA  28.4 
 
 
403 aa  63.5  0.000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3192  argininosuccinate lyase  31.65 
 
 
924 aa  63.2  0.000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.655648  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2026  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  26.42 
 
 
423 aa  63.2  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4786  hypothetical protein  28.74 
 
 
398 aa  62.4  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2507  argininosuccinate lyase  28 
 
 
912 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1396  argininosuccinate lyase  31.38 
 
 
926 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0912  biotin carboxylase-like protein  23.56 
 
 
410 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.527326 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4142  hypothetical protein  24.2 
 
 
414 aa  61.6  0.00000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.16964  normal  0.023954 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0072  hypothetical protein  24.2 
 
 
414 aa  62  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2646  argininosuccinate lyase  29.53 
 
 
904 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5515  phosphoribosylglycinamide synthetase  27.9 
 
 
422 aa  61.2  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.330375  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5879  phosphoribosylglycinamide synthetase  27.9 
 
 
422 aa  61.2  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.521142  normal  0.293972 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3136  putative siderophore biosynthesis protein  25.19 
 
 
388 aa  60.8  0.00000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0344  phosphoribosylglycinamide synthetase  28.98 
 
 
424 aa  60.8  0.00000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0791  biotin carboxylase  29.23 
 
 
411 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2560  argininosuccinate lyase  29.53 
 
 
904 aa  60.8  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1514  hypothetical protein  22.32 
 
 
412 aa  60.5  0.00000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1971  argininosuccinate lyase  29.11 
 
 
891 aa  60.1  0.00000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1007  hypothetical protein  23.95 
 
 
427 aa  60.1  0.00000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4090  hypothetical protein  23.94 
 
 
414 aa  59.3  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.572464  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6388  phosphoribosylglycinamide synthetase  27.54 
 
 
422 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.357309  normal  0.160447 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2969  hypothetical protein  29.49 
 
 
402 aa  58.5  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0755  protein of unknown function DUF201  20.36 
 
 
398 aa  58.5  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0730  hypothetical protein  25.19 
 
 
436 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3091  PvsA  28.74 
 
 
394 aa  57.8  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.324185  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_37283  predicted protein  26.61 
 
 
1033 aa  57.4  0.0000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2122  argininosuccinate lyase  29.79 
 
 
894 aa  57  0.0000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6149  hypothetical protein  26.77 
 
 
441 aa  57  0.0000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.669475 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1620  argininosuccinate lyase  29.59 
 
 
896 aa  56.2  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0240  hypothetical protein  26.89 
 
 
410 aa  55.5  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08450  hypothetical protein  26.53 
 
 
422 aa  55.5  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8363  putative siderophore biosynthesis protein  29.61 
 
 
401 aa  54.7  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2135  phosphoribosylglycinamide synthetase  26.27 
 
 
412 aa  54.3  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.165665  normal  0.504192 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14410  carbamoylphosphate synthase large subunit  23.59 
 
 
423 aa  54.3  0.000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0240  hypothetical protein  25.42 
 
 
410 aa  52.4  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6153  protein of unknown function DUF201  25.45 
 
 
397 aa  51.6  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.496627  normal  0.0716856 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3673  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  26.5 
 
 
407 aa  51.2  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2023  hypothetical protein  25.67 
 
 
408 aa  51.2  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0170  phosphoribosylglycinamide synthetase ATP-grasp domain-containing protein  19.52 
 
 
407 aa  50.8  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0292  phosphoribosylglycinamide synthetase, ATP-grasp  19.52 
 
 
407 aa  50.8  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2977  D-alanine--D-alanine ligase  25.48 
 
 
327 aa  50.4  0.00006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1584  putative carbamoyl-phosphate-synthetase protein  23.17 
 
 
393 aa  50.4  0.00006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0194  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain-containing protein ATP-grasp  27 
 
 
419 aa  50.4  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.296569  normal  0.160479 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6150  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  25.17 
 
 
410 aa  50.1  0.00007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.639194 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>