82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1724 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_1724  protein of unknown function DUF201  100 
 
 		 401 aa  785    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1423  protein of unknown function DUF201  36.1 
 
 		 424 aa  195  2e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.369206  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1518  protein of unknown function DUF201  35.37 
 
 		 424 aa  188  1e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2440  biotin carboxylase-like  35.66 
 
 		 424 aa  188  1e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.459774  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1432  hypothetical protein  34.48 
 
 		 424 aa  185  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.502147  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2251  phosphoribosylglycinamide synthetase  33.74 
 
 		 418 aa  182  7e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000511987 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1164  protein of unknown function DUF201  30.81 
 
 		 437 aa  179  1e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4500  Cysteine synthase  30.03 
 
 		 756 aa  89  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.632569  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2020  phosphoribosylglycinamide synthetase  28.12 
 
 		 407 aa  86.3  9e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2737  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  23.48 
 
 		 723 aa  84.7  0.000000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3759  protein of unknown function DUF201  28.74 
 
 		 425 aa  82.4  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33390  biotin carboxylase  27.35 
 
 		 428 aa  81.3  0.00000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.465269 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1119  biotin carboxylase  25.56 
 
 		 411 aa  78.6  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2428  protein of unknown function DUF201  25.66 
 
 		 402 aa  78.2  0.0000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.281403  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4648  protein of unknown function DUF201  29.16 
 
 		 404 aa  76.6  0.0000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.896666  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1270  protein of unknown function DUF201  23.26 
 
 		 399 aa  75.9  0.000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.964812  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0449  putative glycolate oxidase  24.92 
 
 		 404 aa  75.1  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6153  protein of unknown function DUF201  25.51 
 
 		 397 aa  74.7  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.496627  normal  0.0716856 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2148  hypothetical protein  25.71 
 
 		 414 aa  73.6  0.000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.149546 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1929  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  24.84 
 
 		 411 aa  72.8  0.000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0754  protein of unknown function DUF201  23.38 
 
 		 409 aa  71.6  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7725  hypothetical protein  26.1 
 
 		 411 aa  72  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.10668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2144  phosphoribosylglycinamide synthetase  27.86 
 
 		 416 aa  71.2  0.00000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0250211 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0573  phosphoribosylglycinamide synthetase  25.17 
 
 		 420 aa  69.7  0.00000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.23534  normal  0.22349 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2438  hypothetical protein  29.16 
 
 		 410 aa  68.6  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.658373 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2002  argininosuccinate lyase  29.66 
 
 		 900 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.848902  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2158  argininosuccinate lyase  29.66 
 
 		 914 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2668  phosphoribosylglycinamide synthetase  27.14 
 
 		 415 aa  67  0.0000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2987  phosphoribosylglycinamide synthetase  24.06 
 
 		 410 aa  66.2  0.000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.0000000000875543  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3192  argininosuccinate lyase  29.96 
 
 		 924 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.655648  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2022  argininosuccinate lyase  29.66 
 
 		 900 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.10658  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1388  hypothetical protein  25.85 
 
 		 395 aa  64.7  0.000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0314212 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1396  argininosuccinate lyase  29.92 
 
 		 926 aa  63.2  0.000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1971  argininosuccinate lyase  29.15 
 
 		 891 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2646  argininosuccinate lyase  29.46 
 
 		 904 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2560  argininosuccinate lyase  29.46 
 
 		 904 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2507  argininosuccinate lyase  28.46 
 
 		 912 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0755  protein of unknown function DUF201  22.56 
 
 		 398 aa  60.1  0.00000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37420  biotin carboxylase  25.08 
 
 		 405 aa  59.7  0.00000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.442231 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0418  hypothetical protein  24.46 
 
 		 411 aa  59.7  0.00000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2663  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  23.77 
 
 		 413 aa  58.9  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0619  phosphoribosylglycinamide synthetase  23.42 
 
 		 410 aa  58.5  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.241949  hitchhiker  0.00233057 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0200  hypothetical protein  22.63 
 
 		 405 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.214933  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2122  argininosuccinate lyase  29.55 
 
 		 894 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1498  biotin carboxylase-like  30.67 
 
 		 428 aa  57.4  0.0000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3093  hypothetical protein  29.14 
 
 		 440 aa  56.2  0.0000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0718  hypothetical protein  25.37 
 
 		 406 aa  55.8  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.555879  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0732  hypothetical protein  25.37 
 
 		 406 aa  55.5  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0899  hypothetical protein  25.37 
 
 		 406 aa  55.5  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1620  argininosuccinate lyase  28.74 
 
 		 896 aa  54.7  0.000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0791  biotin carboxylase  24.5 
 
 		 411 aa  53.5  0.000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2209  CarB family protein  23.75 
 
 		 543 aa  52.8  0.00001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.304362  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1401  protein of unknown function DUF201  23.46 
 
 		 409 aa  51.6  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3265  hypothetical protein  23.4 
 
 		 412 aa  51.6  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0072  hypothetical protein  26.18 
 
 		 414 aa  51.2  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4142  hypothetical protein  26.18 
 
 		 414 aa  51.2  0.00003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.16964  normal  0.023954 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3626  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  27.52 
 
 		 432 aa  49.7  0.00009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2595  putative carbamoyl-phosphate-synthetase  24.04 
 
 		 398 aa  49.7  0.00009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.605395  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4068  hypothetical protein  24.14 
 
 		 413 aa  48.9  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1514  hypothetical protein  19.93 
 
 		 412 aa  48.5  0.0002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4090  hypothetical protein  25.75 
 
 		 414 aa  48.5  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.572464  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_37283  predicted protein  25.9 
 
 		 1033 aa  47.8  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5090  hypothetical protein  24.02 
 
 		 453 aa  47.8  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5770  hypothetical protein  24.02 
 
 		 453 aa  47.8  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0282385 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0875  hypothetical protein  25.33 
 
 		 420 aa  47.8  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.728931 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0730  hypothetical protein  23.91 
 
 		 436 aa  47  0.0005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2522  hypothetical protein  22.08 
 
 		 404 aa  46.6  0.0007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.101837  normal  0.542859 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0021  hypothetical protein  24.1 
 
 		 382 aa  46.6  0.0008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3365  putative carbamoyl-phosphate-synthetase protein  23.96 
 
 		 384 aa  46.2  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.131382  normal  0.291758 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3469  hypothetical protein  24 
 
 		 429 aa  45.1  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3660  hypothetical protein  26.42 
 
 		 411 aa  44.7  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.853995  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6149  hypothetical protein  25.99 
 
 		 441 aa  44.3  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.669475 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5882  phosphoribosylglycinamide synthetase  26.59 
 
 		 403 aa  43.5  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.47867 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5518  phosphoribosylglycinamide synthetase  26.59 
 
 		 403 aa  43.5  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.398662  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0386  phosphoribosylamine--glycine ligase  22.48 
 
 		 395 aa  43.5  0.007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0996  phosphoribosylglycinamide synthetase  25.91 
 
 		 541 aa  43.5  0.007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000037072 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2959  phosphoribosylglycinamide synthetase  21.03 
 
 		 405 aa  43.5  0.007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2846  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain- containing protein  20.17 
 
 		 404 aa  43.1  0.008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.435021  normal  0.117516 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0081  hypothetical protein  31.37 
 
 		 418 aa  43.1  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0344  phosphoribosylglycinamide synthetase  23.53 
 
 		 424 aa  43.1  0.008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3838  hypothetical protein  22.7 
 
 		 428 aa  43.1  0.009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7439  D-alanine--D-alanine ligase  30.06 
 
 		 307 aa  43.1  0.009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0178341  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>