34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_3469 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_3469  hypothetical protein  100 
 
 		 429 aa  885    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0793  biotin carboxylase  33.26 
 
 		 437 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5090  hypothetical protein  34.08 
 
 		 453 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5770  hypothetical protein  34.08 
 
 		 453 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0282385 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0200  hypothetical protein  24.42 
 
 		 405 aa  70.1  0.00000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.214933  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2987  phosphoribosylglycinamide synthetase  26.64 
 
 		 410 aa  68.2  0.0000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.0000000000875543  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6153  protein of unknown function DUF201  26.4 
 
 		 397 aa  65.1  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.496627  normal  0.0716856 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3759  protein of unknown function DUF201  21.45 
 
 		 425 aa  63.2  0.000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2020  phosphoribosylglycinamide synthetase  23.81 
 
 		 407 aa  58.9  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1164  protein of unknown function DUF201  25.2 
 
 		 437 aa  58.2  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1270  protein of unknown function DUF201  24.86 
 
 		 399 aa  55.8  0.000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.964812  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0170  phosphoribosylglycinamide synthetase ATP-grasp domain-containing protein  24.92 
 
 		 407 aa  55.8  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0573  phosphoribosylglycinamide synthetase  29.03 
 
 		 420 aa  55.1  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.23534  normal  0.22349 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0292  phosphoribosylglycinamide synthetase, ATP-grasp  24.92 
 
 		 407 aa  55.8  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0730  hypothetical protein  24.15 
 
 		 436 aa  53.9  0.000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2668  phosphoribosylglycinamide synthetase  25.21 
 
 		 415 aa  53.1  0.000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4068  hypothetical protein  22.98 
 
 		 413 aa  50.8  0.00004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2002  argininosuccinate lyase  24 
 
 		 900 aa  49.7  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.848902  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2158  argininosuccinate lyase  24 
 
 		 914 aa  49.3  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2022  argininosuccinate lyase  24 
 
 		 900 aa  48.9  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.10658  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0791  biotin carboxylase  23.32 
 
 		 411 aa  48.9  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2026  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  22.42 
 
 		 423 aa  47  0.0007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2484  carbamoyl phosphate synthase-like protein  23.65 
 
 		 354 aa  47  0.0007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.834927  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6302  hypothetical protein  26.85 
 
 		 401 aa  46.6  0.0009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0344575  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7725  hypothetical protein  23.71 
 
 		 411 aa  46.2  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.10668  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7724  putative biotin carboxylase  24.26 
 
 		 430 aa  46.2  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.211642  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4500  Cysteine synthase  22.71 
 
 		 756 aa  45.8  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.632569  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1724  protein of unknown function DUF201  24 
 
 		 401 aa  45.1  0.002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2144  phosphoribosylglycinamide synthetase  21.69 
 
 		 416 aa  45.4  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0250211 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3064  hypothetical protein  22.73 
 
 		 441 aa  44.7  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000514586 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2148  hypothetical protein  21.03 
 
 		 414 aa  45.1  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.149546 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0755  protein of unknown function DUF201  25.78 
 
 		 398 aa  44.7  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2315  hypothetical protein  22.71 
 
 		 397 aa  43.9  0.006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4648  protein of unknown function DUF201  23.33 
 
 		 404 aa  43.1  0.01  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.896666  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>