More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0386 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_0386  phosphoribosylamine--glycine ligase  100 
 
 		 395 aa  777    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1672  phosphoribosylamine--glycine ligase  57.64 
 
 		 410 aa  448  1e-125  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.561009  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1521  phosphoribosylamine--glycine ligase  54.59 
 
 		 397 aa  435  1e-121  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1570  phosphoribosylamine--glycine ligase  54.84 
 
 		 397 aa  435  1e-121  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0475  phosphoribosylamine--glycine ligase  39.67 
 
 		 416 aa  262  6.999999999999999e-69  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.49391  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0504  phosphoribosylamine--glycine ligase  39.29 
 
 		 416 aa  261  2e-68  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1266  phosphoribosylamine--glycine ligase  39.43 
 
 		 416 aa  259  7e-68  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1387  phosphoribosylamine--glycine ligase  39.19 
 
 		 416 aa  257  2e-67  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0756  phosphoribosylamine/glycine ligase  36.67 
 
 		 424 aa  257  2e-67  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.721746  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0678  phosphoribosylamine--glycine ligase  39.52 
 
 		 416 aa  257  2e-67  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0676  phosphoribosylamine--glycine ligase  39.05 
 
 		 416 aa  258  2e-67  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0492  phosphoribosylamine--glycine ligase  37.38 
 
 		 414 aa  253  5.000000000000001e-66  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1360  phosphoribosylamine--glycine ligase  36.56 
 
 		 431 aa  252  9.000000000000001e-66  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2389  phosphoribosylamine--glycine ligase  36.93 
 
 		 422 aa  252  9.000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1957  phosphoribosylamine/glycine ligase  35.56 
 
 		 408 aa  251  2e-65  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1540  phosphoribosylamine/glycine ligase  36.02 
 
 		 433 aa  251  2e-65  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.427577  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0519  phosphoribosylamine/glycine ligase  37.8 
 
 		 415 aa  250  3e-65  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.941545  normal  0.807449 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0597  phosphoribosylamine/glycine ligase  37.71 
 
 		 424 aa  250  3e-65  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1989  phosphoribosylamine--glycine ligase  36.69 
 
 		 422 aa  249  5e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.187802  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1189  phosphoribosylamine/glycine ligase  36.47 
 
 		 417 aa  249  7e-65  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000704507  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1416  phosphoribosylamine/glycine ligase  39.52 
 
 		 413 aa  248  1e-64  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000507728  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0233  phosphoribosylamine--glycine ligase  38.01 
 
 		 417 aa  248  1e-64  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1119  phosphoribosylamine--glycine ligase  37.02 
 
 		 421 aa  248  1e-64  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.624592 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5622  phosphoribosylamine--glycine ligase  37.17 
 
 		 425 aa  247  2e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0231  phosphoribosylamine--glycine ligase  35.01 
 
 		 425 aa  248  2e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.595549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1261  phosphoribosylamine--glycine ligase  38.11 
 
 		 415 aa  247  2e-64  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0195  phosphoribosylamine--glycine ligase  36.88 
 
 		 425 aa  246  4e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0919  phosphoribosylamine--glycine ligase  37.32 
 
 		 423 aa  246  4.9999999999999997e-64  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.42013  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2191  phosphoribosylamine--glycine ligase  36.45 
 
 		 422 aa  246  6e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0983  phosphoribosylamine--glycine ligase  37.41 
 
 		 425 aa  246  6e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0720926  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1683  phosphoribosylamine--glycine ligase  37.08 
 
 		 426 aa  245  8e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.138512  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2295  phosphoribosylamine--glycine ligase  37.08 
 
 		 426 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1300  phosphoribosylamine--glycine ligase  36.45 
 
 		 432 aa  244  3e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.617554  normal  0.088058 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1041  phosphoribosylamine--glycine ligase  36.56 
 
 		 424 aa  243  3e-63  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.714358  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2318  phosphoribosylamine--glycine ligase  36.84 
 
 		 426 aa  243  3e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.57608 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3260  phosphoribosylamine--glycine ligase  36.45 
 
 		 432 aa  244  3e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.207571  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0555  phosphoribosylamine--glycine ligase  36.6 
 
 		 424 aa  243  5e-63  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2212  phosphoribosylamine--glycine ligase  36.45 
 
 		 426 aa  242  7e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2065  phosphoribosylamine--glycine ligase  36.69 
 
 		 425 aa  241  1e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.19426 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0171  phosphoribosylamine--glycine ligase  34.82 
 
 		 428 aa  241  1e-62  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0026  phosphoribosylamine/glycine ligase  35.31 
 
 		 704 aa  241  1e-62  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2333  phosphoribosylamine--glycine ligase  36.45 
 
 		 426 aa  242  1e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0928506  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0424  phosphoribosylamine--glycine ligase  36.21 
 
 		 426 aa  241  2e-62  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23090  phosphoribosylamine--glycine ligase  34.76 
 
 		 425 aa  240  2.9999999999999997e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.121893  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0036  phosphoribosylamine/glycine ligase  36.02 
 
 		 430 aa  240  2.9999999999999997e-62  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1014  phosphoribosylamine--glycine ligase  35.97 
 
 		 425 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0528  phosphoribosylamine--glycine ligase  34.2 
 
 		 427 aa  240  4e-62  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1753  phosphoribosylamine--glycine ligase  36.49 
 
 		 437 aa  239  5e-62  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.528627  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0434  phosphoribosylamine--glycine ligase  36.49 
 
 		 424 aa  239  5e-62  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1230  phosphoribosylamine--glycine ligase  35.73 
 
 		 425 aa  239  5e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1999  phosphoribosylamine--glycine ligase  33.02 
 
 		 429 aa  239  5.999999999999999e-62  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.00638776  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0054  phosphoribosylamine/glycine ligase  38.63 
 
 		 403 aa  239  5.999999999999999e-62  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0296  phosphoribosylamine--glycine ligase  36.71 
 
 		 426 aa  239  8e-62  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1885  phosphoribosylamine--glycine ligase  35.49 
 
 		 425 aa  238  1e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.132048  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1775  phosphoribosylamine--glycine ligase  36.99 
 
 		 412 aa  238  1e-61  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1384  phosphoribosylamine--glycine ligase  35.49 
 
 		 425 aa  238  1e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.563842  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1442  phosphoribosylamine--glycine ligase  34.45 
 
 		 426 aa  238  1e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.577495  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1074  phosphoribosylamine--glycine ligase  35.49 
 
 		 425 aa  238  1e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.497421  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0784  phosphoribosylamine--glycine ligase  36.69 
 
 		 422 aa  238  1e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.110869  normal  0.244609 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0357  phosphoribosylamine--glycine ligase  35.49 
 
 		 425 aa  238  1e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.659716  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1239  phosphoribosylamine--glycine ligase  35.49 
 
 		 425 aa  238  1e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0277108  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5964  phosphoribosylamine/glycine ligase  35.76 
 
 		 428 aa  238  1e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.262465 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3601  phosphoribosylamine--glycine ligase  36.38 
 
 		 429 aa  238  2e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.330446 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0348  phosphoribosylamine--glycine ligase  35.65 
 
 		 422 aa  238  2e-61  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.6128 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0793  phosphoribosylamine--glycine ligase  35.49 
 
 		 425 aa  238  2e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.296273  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0266  phosphoribosylamine--glycine ligase  35.39 
 
 		 427 aa  238  2e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000213794  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0177  phosphoribosylamine/glycine ligase  34.36 
 
 		 429 aa  237  2e-61  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.348487  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3451  phosphoribosylamine--glycine ligase  34.45 
 
 		 428 aa  236  5.0000000000000005e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.264337  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27830  phosphoribosylamine--glycine ligase  35.95 
 
 		 421 aa  236  6e-61  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1245  phosphoribosylamine--glycine ligase  33.97 
 
 		 419 aa  234  1.0000000000000001e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.495633  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3668  phosphoribosylamine--glycine ligase  35.8 
 
 		 425 aa  235  1.0000000000000001e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0647  phosphoribosylamine--glycine ligase  34.43 
 
 		 426 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0115748  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0949  phosphoribosylamine--glycine ligase  36.23 
 
 		 417 aa  234  2.0000000000000002e-60  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0465  phosphoribosylamine--glycine ligase  32.62 
 
 		 435 aa  234  3e-60  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02975  phosphoribosylamine--glycine ligase  36.08 
 
 		 427 aa  233  3e-60  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0569996  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0459  phosphoribosylamine--glycine ligase  35.57 
 
 		 429 aa  234  3e-60  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0438  phosphoribosylamine--glycine ligase  34.52 
 
 		 430 aa  233  6e-60  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.199076  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06880  phosphoribosylamine--glycine ligase  34.76 
 
 		 426 aa  232  7.000000000000001e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.285428  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1775  phosphoribosylamine/glycine ligase  34.6 
 
 		 433 aa  232  9e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.780493 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2988  phosphoribosylamine--glycine ligase  34.91 
 
 		 428 aa  232  9e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3844  phosphoribosylamine--glycine ligase  35.07 
 
 		 428 aa  231  1e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000315171  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0278  phosphoribosylamine--glycine ligase  34.86 
 
 		 423 aa  231  2e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0464  phosphoribosylamine--glycine ligase  35.38 
 
 		 428 aa  231  2e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00032027  normal  0.0111484 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3467  phosphoribosylamine--glycine ligase  36.43 
 
 		 423 aa  231  2e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0292  phosphoribosylamine--glycine ligase  34.92 
 
 		 427 aa  231  2e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00181025  normal  0.0133648 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1729  phosphoribosylamine--glycine ligase  33.57 
 
 		 430 aa  230  3e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.576125 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2523  phosphoribosylamine--glycine ligase  35.73 
 
 		 422 aa  230  3e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3997  phosphoribosylamine/glycine ligase  34.83 
 
 		 423 aa  230  3e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1969  phosphoribosylamine--glycine ligase  32.94 
 
 		 433 aa  230  3e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.949647 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1626  phosphoribosylamine--glycine ligase  34.91 
 
 		 432 aa  230  3e-59  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1471  phosphoribosylamine--glycine ligase  38.3 
 
 		 423 aa  230  3e-59  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0600936 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4039  phosphoribosylamine/glycine ligase  34.83 
 
 		 423 aa  230  3e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.324775  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0610  phosphoribosylamine--glycine ligase  34.29 
 
 		 423 aa  229  4e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00101284  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2871  phosphoribosylamine/glycine ligase  35.25 
 
 		 449 aa  230  4e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0927595 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0356  phosphoribosylamine--glycine ligase  35.07 
 
 		 428 aa  230  4e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0104682  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00211  phosphoribosylamine--glycine ligase  35.39 
 
 		 429 aa  229  5e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1628  phosphoribosylamine--glycine ligase  34.61 
 
 		 425 aa  229  5e-59  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0360  Phosphoribosylamine--glycine ligase  33.73 
 
 		 430 aa  229  5e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0271  phosphoribosylamine--glycine ligase  34.13 
 
 		 423 aa  229  6e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0331  phosphoribosylamine--glycine ligase  35.01 
 
 		 423 aa  229  6e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>